| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 436259 = | 64 (0.910) | 24 (0.370) | 14/92 | NT | 30.2% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | = 2706018 | 52 (0.800) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATAT > Exported/436189‑436328 | gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:2419724/1‑71 (MQ=255)gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:4247182/1‑71 (MQ=255) gTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt < 1:115336/71‑1 (MQ=255) cacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:1088234‑M1/68‑71 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCa < 1:2719461/70‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcccccgcgaaaaaataATTCAg < 1:3723495‑M1/6‑1 (MQ=255) ttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGc > 1:3798154/1‑71 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:673997‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:1818096‑M1/1‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:2969073/1‑71 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca < 1:4084850/71‑1 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca < 1:1801022/71‑1 (MQ=255) ggCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgca > 1:578384/1‑71 (MQ=255) gCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt < 1:2927886/59‑1 (MQ=255) ttGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:4267905/1‑71 (MQ=255) ttGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:3199877/1‑71 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1855454‑M1/48‑57 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:700613‑M1/48‑57 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:3636352‑M1/47‑54 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:2245061‑M1/47‑54 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:1897180‑M1/47‑54 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:2376227/71‑1 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:1364923/71‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1115353‑M1/45‑54 (MQ=255) tATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:1111712/1‑68 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:30527‑M1/26‑1 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGAACTGGAt < 1:2201177‑M1/25‑1 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:3406808‑M1/26‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTa > 1:2352440/1‑50 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:1363537/1‑67 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:246645/1‑67 (MQ=255) tCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:3353240/50‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:257499/50‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:1902350/1‑51 (MQ=255) cGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:2972689/1‑70 (MQ=255) tgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:3656693‑M1/38‑69 (MQ=255) tacaaagccagcagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:4113931‑M1/37‑70 (MQ=255) tggcGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa > 1:1899021/4‑71 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACg > 1:2928841‑M1/34‑71 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 1:1577694‑M1/39‑1 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 1:518871‑M1/39‑1 (MQ=255) ttATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg > 1:2819480/1‑71 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:3684966/1‑37 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:4334617/1‑64 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:3244304/1‑71 (MQ=255) aTTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:4375758/70‑1 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:2112469/60‑1 (MQ=255) tCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgc > 1:888060/1‑40 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:2550121/1‑60 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:1858938/1‑60 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:4197423/1‑71 (MQ=255) 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aCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga > 1:3687399/1‑65 (MQ=255) cTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1711139/1‑71 (MQ=255) acccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:764982‑M1/16‑43 (MQ=255) acccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2238442‑M1/16‑43 (MQ=255) tCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAc > 1:308913/1‑71 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:404431/62‑1 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActct > 1:3763395‑M1/12‑71 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:947456/1‑71 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:459631/1‑71 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:1213238/1‑71 (MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActct > 1:2792345‑M1/11‑70 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTa < 1:1450411/36‑1 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:710112/1‑65 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:783057/1‑65 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActct < 1:4108924/69‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg < 1:4208875‑M1/64‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACCATTGAAGTTGATGATGAACTctaaa < 1:4265584‑M1/63‑3 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:3985096/57‑1 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAACTtgatgat < 1:4447326/57‑1 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa < 1:1596717‑M1/56‑1 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:3794034‑M1/5‑71 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga > 1:1207285‑M1/3‑51 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata < 1:3329540‑M1/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCTCTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:1952653/1‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga > 1:772778/1‑57 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga > 1:249569/1‑57 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:1582782/1‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:334134/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:3981886/69‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:1762241/50‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:447525/50‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:1754023/50‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:1553097/50‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |