| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Exported | = 689836 | 60 (0.920) | coding (999/1119 nt) | hyaA | hydrogenase 1, small subunit | |||||
CCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGACGTCATAAC > Exported/689767‑689902 | ccGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCg > 1:375307‑M2/1‑70 (MQ=255) cgcgTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCg > 1:1250857‑M2/1‑69 (MQ=255) gcgTGGTCGATACTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtg > 1:91075‑M2/1‑68 (MQ=255) gTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGtggtgg > 1:1506547/1‑70 (MQ=255) ttCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGAgtggtg < 1:3583506/62‑1 (MQ=255) ttCCGCAAATGGGTACTCATTCCACC‑CCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTg < 1:16356/71‑1 (MQ=255) ccGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGt > 1:3701204/1‑71 (MQ=255) cGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgt > 1:3830844‑M2/1‑53 (MQ=255) gCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTg 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |