New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | Exported | 981368 = | 59 (0.840) | 6 (0.100) | 3/88 | NT | 9.8% | coding (326/533 nt) | ydfQ | predicted lysozyme |
? | Exported | 981396 = | 58 (0.930) | coding (298/533 nt) | ydfQ | predicted lysozyme |
ACGGGAAACACTTACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAATATTGCGCTCCACCCATGCCAGCGCCTTATCACGCTCAATGGCGTTG > Exported/981334‑981464 | aCGGGAAACACTTACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGt > 1:504183/1‑70 (MQ=255) cGGGAAACACTTACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCa < 1:14364/71‑1 (MQ=255) gAAACACTTACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTg > 1:4242906/1‑71 (MQ=255) aaCACTTACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGt < 1:1955415/71‑1 (MQ=255) ttACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACtt > 1:741331/1‑70 (MQ=255) tACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACttt > 1:1168066/1‑70 (MQ=255) tACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACttt > 1:1614691/1‑70 (MQ=255) tACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACttt > 1:3128591/1‑70 (MQ=255) aCCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACttt < 1:1595135/69‑1 (MQ=255) ccGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTaa > 1:3587190/1‑70 (MQ=255) ccGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTaa < 1:4244101/70‑1 (MQ=255) ccGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTaa > 1:4137407/1‑70 (MQ=255) ccGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTaa < 1:1410795/70‑1 (MQ=255) cGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAata < 1:2100542/71‑1 (MQ=255) cGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAata < 1:3340293/71‑1 (MQ=255) ggCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAATATTg < 1:3883647/71‑1 (MQ=255) accactgaccgaaccACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTtgtg < 1:1548689‑M1/29‑1 (MQ=255) accactgaccgaaccACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTtgtg < 1:3166754‑M1/29‑1 (MQ=255) aTGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGt < 1:48008/47‑1 (MQ=255) 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tttgtGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAATATTGCGCTCCACCCATGCCAGCGCCTTATCACGCTCaa > 1:3124124‑M2/6‑66 (MQ=255) tgtGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAATATTGCGCTCCACCCATGCCAGCGCCTTATCACGCTCAATGGCGtt > 1:662953‑M2/4‑71 (MQ=255) tGGTTCGGTCAGTTGTACTTTAATATTGCGCTCCACCCATGCCAGCGCCTTATCACGCTCAATGGCGTTg < 1:2861843‑M2/69‑1 (MQ=255) tGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAATATTGCGCTCCACCCATGCCAGCGCCTTATCACGCTCAATGGCGTTg < 1:2840875‑M2/69‑1 (MQ=255) | ACGGGAAACACTTACCGGGGCCAATGTTATAGGGACAAAATGACGCGATACCCGCTTTTTGTGGTTCGGTCAGTGGTACTTTAATATTGCGCTCCACCCATGCCAGCGCCTTATCACGCTCAATGGCGTTG > Exported/981334‑981464 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |