| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 225392 = | NA (NA) | 3 (0.060) | 3/92 | NT | NA | noncoding (12/77 nt) | ileV | tRNA‑Ile |
| ? | AP009048 | 225417 = | NA (NA) | noncoding (37/77 nt) | ileV | tRNA‑Ile | |||||
GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225466‑225392‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgaTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT > AP009048/225417‑225486 GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC < 1:4560062/71‑1 TGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACC > 1:3222644/1‑71 TGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACC > 1:1925599/1‑71 GCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:4893050/1‑71 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:180509/70‑1 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:2793808/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:2776025/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:5145284/70‑1 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:5257715/1‑70 CAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:5365854/1‑70 AAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA < 1:4815357/71‑1 AAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:1341961/1‑69 ATTTGGTAGGCCTGAGTGGATTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC > 1:3979565/1‑65 ATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTG < 1:1181197/68‑1 ATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC > 1:427776/1‑65 AGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:2241023/60‑1 CCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:927366/57‑1 TGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA > 1:1491285/1‑53 TGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC < 1:4189094/49‑1 ACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT < 1:4006639/48‑1 TTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA > 1:897378/1‑48 TTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACC > 1:4433921/1‑45 TGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCT > 1:668380/1‑45 TGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAC > 1:2816502/1‑43 TATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 1:896365/1‑71 ATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGATAAGGGTGAGG > 1:3947257/1‑37 GGTGCGCTCTAACCACCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA < 1:350866/63‑1 CCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG > 1:4444194/1‑65 CCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGG < 1:314430/71‑1 CCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACG > 1:2158539/1‑56 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT > 1:5290588/1‑71 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT > 1:1542193/1‑71 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGT > 1:643566/1‑71 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAT < 1:1812922/61‑1 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC < 1:1329209/52‑1 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT < 1:3955724/48‑1 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA < 1:3508406/45‑1 CTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCA > 1:4468913/1‑36 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGA < 1:2938600/64‑1 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 1:809851/1‑47 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 1:5149714/1‑47 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGG > 1:128213/1‑37 GATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTT > 1:4810684/1‑70 GATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAG > 1:5094926/1‑67 GATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAA > 1:3679444/1‑64 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT < 1:466792/71‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT < 1:838250/71‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT < 1:4214139/71‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT < 1:3524522/71‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTT > 1:528653/1‑70 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTT > 1:5088896/1‑70 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTT < 1:4489908/70‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTT > 1:3657422/1‑70 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTT > 1:112284/1‑70 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTT < 1:874609/69‑1 ATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC > 1:1191781/1‑49 ATAAGGGTGAGGTAGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 1:2223646/1‑45 GTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225466‑225392‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgaTAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTT > AP009048/225417‑225486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |