New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP009048 | = 309393 | 84 (1.430) | 5 (0.090) | 3/100 | NT | 5.5% | coding (503/588 nt) | yagZ | conserved hypothetical protein |
? | AP009048 | = 309413 | 91 (1.590) | coding (483/588 nt) | yagZ | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCGTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGG > AP009048/309324‑309462 | gcgTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggt > 1:2107568/1‑71 (MQ=255) gcgTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggt < 1:2282623/71‑1 (MQ=255) gcgTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGG < 1:1259889‑M1/70‑1 (MQ=255) gcgTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGG < 1:1656424‑M1/70‑1 (MQ=255) gTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggtgg < 1:58108/71‑1 (MQ=255) tCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggtgg > 1:5157408/1‑70 (MQ=255) tCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggtgg < 1:2245865/70‑1 (MQ=255) aCTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCa > 1:3236906/1‑71 (MQ=255) aCTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCa > 1:3537855/1‑71 (MQ=255) cTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCAt > 1:86627/1‑71 (MQ=255) cTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGG < 1:2050169‑M1/62‑1 (MQ=255) gTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtg > 1:970852/1‑71 (MQ=255) gTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtg > 1:1991518/1‑71 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCAtt < 1:1007558/69‑1 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCAtt < 1:1278400/69‑1 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtgg < 1:148362/71‑1 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtgg < 1:2366662/71‑1 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtg < 1:226749/70‑1 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtg < 1:1531325/70‑1 (MQ=255) tACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtg < 1:187401/70‑1 (MQ=255) aCGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACT‑‑‑Gcggtaccaccaatgg > 1:848683‑M1/1‑55 (MQ=255) cGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggt > 1:4683491/1‑58 (MQ=255) gCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtggtgg > 1:1772454/1‑71 (MQ=255) tAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTa > 1:163000/1‑71 (MQ=255) tAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCAGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTa > 1:659324/1‑71 (MQ=255) aCGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTAcc > 1:1237779/1‑71 (MQ=255) cgccgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCAtt < 1:512054/58‑1 (MQ=255) cgccgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCt > 1:3406563/1‑70 (MQ=255) cgccgcTCCAGATGCCTTCCGGAAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCg > 1:2332928/1‑68 (MQ=255) gccgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGAGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtga > 1:5170255/1‑71 (MQ=255) cgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatg < 1:3230111/71‑1 (MQ=255) cgcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatg < 1:5065397/71‑1 (MQ=255) gcTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatga < 1:4936881/71‑1 (MQ=255) cTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTgatgat < 1:242992/71‑1 (MQ=255) cTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTgatgat < 1:3338236/71‑1 (MQ=255) tCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTgatgat < 1:3110256/70‑1 (MQ=255) ccAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtggtgg > 1:4015745/1‑56 (MQ=255) ccAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCtgatga > 1:2909732/1‑68 (MQ=255) cAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGatgatg < 1:4881282/69‑1 (MQ=255) cAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGga < 1:2302793/71‑1 (MQ=255) aGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggtggt < 1:5081457/43‑1 (MQ=255) aGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCggtggt < 1:3073107/43‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtggtgg < 1:3802638/52‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGgag > 1:968684/1‑69 (MQ=255) tGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAg > 1:1316066/1‑71 (MQ=255) tGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAg > 1:2273717/1‑71 (MQ=255) gCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:2697634/1‑71 (MQ=255) gCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:513862/1‑71 (MQ=255) ccTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGaa < 1:5011197/68‑1 (MQ=255) ccTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGt < 1:2986957/71‑1 (MQ=255) ccTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGt > 1:4433320/1‑71 (MQ=255) cTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAgg > 1:3938761/1‑69 (MQ=255) ttCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGcggtaccaccaatggtac < 1:4988646‑M1/50‑19 (MQ=255) ttCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGcggtaccaccaatggtac < 1:851708‑M1/50‑19 (MQ=255) ttCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGaa < 1:1469148/66‑1 (MQ=255) tCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa > 1:3618776/1‑70 (MQ=255) tCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa > 1:3305253/1‑70 (MQ=255) tCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa > 1:3789106/1‑70 (MQ=255) ccGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGcggtaccaccaatggtacca > 1:774292‑M1/1‑30 (MQ=255) ccGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGc < 1:4536442‑M2/51‑2 (MQ=255) ccGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGa < 1:3912748/69‑1 (MQ=255) cGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGaaa > 1:885960/1‑70 (MQ=255) ggTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATtggggg < 1:304310/43‑1 (MQ=255) gTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCa < 1:93865/71‑1 (MQ=255) tAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAAc < 1:5306206/68‑1 (MQ=255) tAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCAt < 1:692065/71‑1 (MQ=255) agagTGCTGTAATCTGTTACTGCGGtggtaccacaatggtaccacc > 1:113239‑M1/1‑25 (MQ=255) gagTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATcc > 1:1626682/1‑71 (MQ=255) agTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTg < 1:1104346/61‑1 (MQ=255) gTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtg > 1:3934704/1‑71 (MQ=255) tGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtgt < 1:4389932/71‑1 (MQ=255) tGCTGTAATCAGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCtgt > 1:649691/1‑71 (MQ=255) tGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGt < 1:5130701/55‑1 (MQ=255) gTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCg > 1:3477928/1‑70 (MQ=255) tAATCTGTTACTGTGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:5217039/1‑71 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:2346606/1‑71 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:4165259/1‑71 (MQ=255) tAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCg < 1:4432039/69‑1 (MQ=255) aaTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAAcc < 1:1601481/58‑1 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCt > 1:1899059/1‑62 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtgg > 1:242953/1‑71 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggtgg > 1:3830758/1‑71 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCggt > 1:5250554/1‑69 (MQ=255) aTCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCg > 1:701482/1‑67 (MQ=255) gTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTAc < 1:2378310/70‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGaaa < 1:5127363/50‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTAc < 1:199566/69‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTAc < 1:3036106/69‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACg < 1:496724/70‑1 (MQ=255) ttACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGa < 1:4531349/71‑1 (MQ=255) tACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAt > 1:307401/1‑71 (MQ=255) aCTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAt < 1:4809911/70‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGAtt < 1:5070042/70‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg < 1:4635599/71‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTg < 1:4929210/71‑1 (MQ=255) cGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCt < 1:1439944/70‑1 (MQ=255) ggtggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTTGTACGATTGCTg > 1:984775/1‑70 (MQ=255) ggtggtACCATTG‑TGGTACCAccgcagtaacagattacagcactct > 1:113239‑M2/1‑21 (MQ=255) gtggtACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGTTTGCTgg < 1:738530/70‑1 (MQ=255) gcggtaccaccaatggtaccaccgcagtaacagattacagcactctaccgg < 1:4536442‑M1/51‑51 (MQ=255) | GCGTCGAACTGTACGCTAACGTCGCCGCTCCAGATGCCTTCCGGTAGAGTGCTGTAATCTGTTACTGCGGTGGTACCATTGGTGGTACCGCTGATGATGGAGAAGGTGAAACCATCCTGTGCGGTGGTACGATTGCTGG > AP009048/309324‑309462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |