| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Exported | 1966508 = | 49 (1.090) | intergenic (‑115/+130) | cmtA/tktA | predicted fused mannitol‑specific enzyme IIBC component of PTS/transketolase 1, thiamin‑binding | |||||
TTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAA > Exported/1966438‑1966577 | ttaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTa > 1:1003243/1‑71 (MQ=255)ttaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTa > 1:1040412/1‑71 (MQ=255)ttaATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTa > 1:2647908/1‑71 (MQ=255) tCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAAt > 1:1537297/1‑71 (MQ=255) atataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAAtt < 1:2265022/68‑1 (MQ=255) atataACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGa > 1:1205186/1‑70 (MQ=255) ttGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAAtt < 1:676443/60‑1 (MQ=255) ataGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAtata < 1:1154137/70‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |