| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 436259 = | 39 (0.730) | 75 (1.520) | 44/92 | NT | 71.1% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | = 2706018 | 25 (0.510) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATAT > Exported/436192‑436328 | cacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:2782691‑M1/68‑71 (MQ=255) acgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAtt < 1:1503941‑M1/3‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:3185400‑M1/66‑71 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:3456595‑M1/66‑71 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:284057‑M1/1‑1 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:1224163‑M1/7‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:1431412‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1659898‑M1/62‑71 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca < 1:898608/71‑1 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca < 1:1308121/71‑1 (MQ=255) gtggacgaactgctggttttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:2371181‑M1/1‑1 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGacac > 1:416019‑M1/57‑71 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg > 1:3096101/1‑71 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactg > 1:2588787‑M1/54‑70 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactg > 1:2133545‑M1/54‑70 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcac < 1:798629‑M1/20‑1 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:3225798‑M1/19‑1 (MQ=255) cTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGacac > 1:203762/1‑65 (MQ=255) 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1:809911‑M1/31‑38 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:249272‑M1/12‑1 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:3164497‑M1/12‑1 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt < 1:889234‑M1/40‑1 (MQ=255) caggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:3296512‑M1/29‑71 (MQ=255) ggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg > 1:1645105‑M1/27‑71 (MQ=255) ggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg < 1:2161600‑M1/45‑1 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:2763757/71‑1 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:1423046‑M1/49‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:759629‑M1/47‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:944901‑M1/21‑70 (MQ=255) 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(MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATAAACTCTa > 1:2535133‑M1/11‑71 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:2964075/1‑70 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2345478‑M1/9‑50 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:1285361‑M1/9‑50 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2600892‑M1/9‑50 (MQ=255) gACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:1079284/1‑46 (MQ=255) cTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:133669/1‑70 (MQ=255) cTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:927844/1‑70 (MQ=255) cTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:2134752/1‑70 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:2450573‑M1/6‑39 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:2282837‑M1/6‑39 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |