Missing coverage evidence...
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GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAA  >  BS168_reference_genome/166298‑166463                                                                                                                                           |                            gTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACa                             <  1:192951/138‑1 (MQ=11)      cGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACg                        >  1:21017/1‑138 (MQ=11)      cGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACg                        >  4:12045/1‑138 (MQ=11)       ggTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa                      <  3:61830/139‑1 (MQ=11)       ggTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa                      <  4:147353/139‑1 (MQ=11)       ggTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa                      <  8:357519/139‑1 (MQ=11)       ggTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGGTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa                      <  6:361569/139‑1 (MQ=2)        gTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAc                     >  3:190007/1‑139 (MQ=11)        gTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAc                     >  4:270937/1‑139 (MQ=11)         ttCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAcc                    <  2:21017/139‑1 (MQ=11)                ccGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAAt             >  6:178409/1‑139 (MQ=11)                   cTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAAtt            >  3:104923/1‑137 (MQ=11)                        cTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGtttt     >  2:38131/1‑139 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  2:284053/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  6:108344/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  7:178163/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  8:282987/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGAGGACAAACAAAATGAACTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  2:184606/1‑138 (MQ=2)                            accaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAACCTAATCAAGACATCACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaa  >  4:250281/1‑138 (MQ=11)                                                                                                                                           |                            GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAA  >  BS168_reference_genome/166298‑166463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑