| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 2,861,836 | (A)9→8 | intergenic (‑88/+4) | mreB ← / ← ysxA | cell‑shape determining protein/conserved nucleotide‑related metabolism protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 2,861,828 | 0 | A | . | 98.8% | 377.5 / ‑2.4 | 85 | intergenic (‑80/+12) | mreB/ysxA | cell‑shape determining protein/conserved nucleotide‑related metabolism protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base . (56/28); total (57/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
AGTTCCAAGATCTATACCAAGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACGAAAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAATATC > BS168_reference_genome/2861704‑2861959 | aGTTCCAAGATCTATACCAAGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACGaaaaaa < 3:89344/130‑1 (MQ=255)aGTTCCAAGATCTATACCAAGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACGaaaaaa > 4:89344/1‑130 (MQ=255) tataCAAAGGTCTCTAGCACAAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATAACCTAAAGCTAAAAAATCATAAACTCTATTATAGCTTAATTAGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAAATTCAtttt > 8:336067/1‑139 (MQ=255) taCCAAGGTCTCTAGCACCAATTCGAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAATGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTTATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCttt < 3:182462/136‑1 (MQ=255) taCCAAGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATcc < 2:369544/133‑1 (MQ=255) aGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCttt > 8:68619/1‑138 (MQ=255) aGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCttt > 5:30878/1‑138 (MQ=255) aGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCttt > 7:95573/1‑138 (MQ=255) ggTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTa > 3:227693/1‑138 (MQ=255) tctcTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCttt > 1:168573/1‑135 (MQ=255) tctcTAGCACCAATTCCAAACATATCTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGATTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAACTATCCTTTTTCCttt > 1:313365/1‑135 (MQ=255) tctAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACt > 6:22727/1‑138 (MQ=255) tctAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACt > 5:80344/1‑138 (MQ=255) ctAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGTAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAAc > 2:365148/1‑136 (MQ=255) ataacAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAACAAAAAAACCCTAAAAAGAAAAAATCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACGAAAAAAAAA‑TGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAAttttt > 4:269609/5‑139 (MQ=255) aTTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCATTTTTCCTTTAAACTCACAAAttttt > 3:2319/1‑139 (MQ=255) aaCATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATccc < 4:2319/139‑1 (MQ=255) atgtatgtATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTAAAATAATCGTTTTTCATTTAAAGTCAAAATTTTTTTATCCCCGAt > 7:407554/1‑138 (MQ=255) atctatgtatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGAt > 8:118033/4‑138 (MQ=255) tgtatgtaTCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCg > 2:343178/1‑135 (MQ=255) gtatgtatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCTACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAAATCACAAATTTTTTATCAACGATCAc > 4:43153/1‑139 (MQ=255) tgtatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCa > 5:198402/1‑138 (MQ=255) tatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGATG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCa > 5:329149/1‑136 (MQ=255) tatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGATG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCa < 6:329149/136‑1 (MQ=255) tatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCaaa < 8:95573/138‑1 (MQ=255) tatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAAt > 4:357239/1‑139 (MQ=255) tatCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAAt > 3:402585/1‑139 (MQ=255) atCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATg > 4:137260/1‑139 (MQ=255) cTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCttt < 5:95568/95‑1 (MQ=255) cTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCttt > 6:95568/1‑95 (MQ=255) cTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATcccc < 2:189446/125‑1 (MQ=255) cTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATcccc > 1:189446/1‑125 (MQ=255) cTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGt > 8:301341/1‑139 (MQ=255) cTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGt > 4:403098/1‑139 (MQ=255) ttCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATg > 1:157194/1‑136 (MQ=255) tCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCTACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTc > 4:151897/1‑138 (MQ=255) tCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTATTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTc > 4:83820/1‑138 (MQ=255) ccTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGt < 3:238136/136‑1 (MQ=255) ccTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGt > 2:190944/1‑136 (MQ=255) ccTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTc > 3:380431/1‑137 (MQ=255) 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ttCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTc > 2:321418/1‑134 (MQ=255) ttCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAAGATCGTTTTTCCTTTATCCTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCACTTGGTCat > 2:164207/1‑135 (MQ=255) aaGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGa < 4:380431/139‑1 (MQ=255) gCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATg < 3:83820/139‑1 (MQ=255) aaTACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGcc < 1:321418/136‑1 (MQ=255) aaTACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAAt < 8:148868/139‑1 (MQ=255) aaTACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAAt < 8:346263/139‑1 (MQ=255) aaaGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGt > 2:304315/1‑136 (MQ=255) ggAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTcc > 1:127239/1‑136 (MQ=255) aaaaCTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCAtt > 4:313390/1‑138 (MQ=255) aaaaCTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCAGCAtt > 5:287512/1‑138 (MQ=255) aCTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATccc < 1:345201/87‑1 (MQ=255) aCTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATccc > 2:345201/1‑87 (MQ=255) aCTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCaaa < 7:68619/139‑1 (MQ=255) aCTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCaaa < 6:30878/139‑1 (MQ=255) aTAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGcc < 8:101032/114‑1 (MQ=255) aTAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGcc > 7:101032/1‑114 (MQ=255) aTAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACa < 3:357239/137‑1 (MQ=255) aTAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGc > 5:204317/1‑139 (MQ=255) tattatAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGt > 5:142724/1‑139 (MQ=255) tattatAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGt > 3:319867/1‑139 (MQ=255) ttatAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCtt < 1:343178/135‑1 (MQ=255) ttatAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCt < 1:365148/134‑1 (MQ=255) ttatAGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCt < 2:127239/134‑1 (MQ=255) tataGCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGt > 2:311633/1‑136 (MQ=255) gCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTc < 3:364350/138‑1 (MQ=255) gCTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTc < 4:319867/138‑1 (MQ=255) cTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCaa > 3:159627/1‑139 (MQ=255) cTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCaa > 3:407138/1‑139 (MQ=255) cTTAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCaa > 8:404412/1‑139 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGa > 6:113276/1‑92 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGa < 5:113276/92‑1 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAACCAGCCGTCTTGTCACTTCAata > 4:59513/1‑139 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAata > 7:294495/1‑139 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAata > 5:81445/1‑139 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAata > 8:35316/1‑139 (MQ=255) tAATTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAat > 7:104683/1‑138 (MQ=255) aaTTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCaa > 2:97969/1‑136 (MQ=255) aaTTCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCaa > 2:136052/1‑136 (MQ=255) ttCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAata > 1:66355/1‑136 (MQ=255) ttCGACG‑AAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAat > 2:309076/1‑135 (MQ=255) cgacg‑aAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAATATc > 2:27963/1‑136 (MQ=255) | AGTTCCAAGATCTATACCAAGGTCTCTAGCACCAATTCCAAACATATGTATGTATCTTCCTTTCTTAAAGCAAAAATACCCTAAAGGGAAAAACTCATAAACTCTATTATAGCTTAATTCGACGAAAAAAAAAGTGTTACAAATATCCTTTTTCCTTTAAACTCACAAATTTTTTATCCCCGATCACCAAATGGTCAAGCAGCTCGATGCCAATCAGGTTTCCGCATTCAAACAGCCGTCTTGTCACTTCAATATC > BS168_reference_genome/2861704‑2861959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |