Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | BS168_reference_genome | 557,870 | (T)5→6 | intergenic (+421/‑3) | yddT → / → ydzN | putative exported phage protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BS168_reference_genome | 557,865 | 1 | . | T | 98.2% | 586.6 / 1.4 | 164 | intergenic (+416/‑8) | yddT/ydzN | putative exported phage protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base T (81/80); total (83/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GTGAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑T‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTT > BS168_reference_genome/557728‑557997 | tgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑t > 8:285945/1‑139 (MQ=255) aaaGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑ttt > 5:353592/1‑139 (MQ=255) aaaGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑ttt > 8:321677/1‑139 (MQ=255) aaaGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑ttt > 5:329451/1‑139 (MQ=255) aaGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑t > 2:176975/1‑136 (MQ=255) tAATGATTTGTATGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑tttttaa < 3:405478/139‑4 (MQ=255) aaTGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑t‑tttttaa < 5:58028/138‑4 (MQ=255) aTTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCg < 7:94968/139‑1 (MQ=255) tttGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCg < 3:38239/138‑1 (MQ=255) tttGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCg < 8:12966/138‑1 (MQ=255) tGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAATATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTg > 5:206185/1‑139 (MQ=255) tGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTg > 4:59768/1‑139 (MQ=255) tGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTg > 7:338176/1‑139 (MQ=255) tGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTg > 6:327394/1‑139 (MQ=255) aGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGa < 5:258811/138‑1 (MQ=255) tCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGt < 2:117474/136‑1 (MQ=255) tCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTaaa < 5:305574/139‑1 (MQ=255) gTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTaaa > 1:322309/1‑136 (MQ=255) tAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATg > 2:214381/1‑136 (MQ=255) aGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGt < 2:166210/136‑1 (MQ=255) aGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCa < 8:351906/139‑1 (MQ=255) aaaGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAAt > 6:287447/1‑139 (MQ=255) tttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt < 4:113098/139‑1 (MQ=255) tttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt < 7:321677/139‑1 (MQ=255) tttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt > 8:121966/1‑139 (MQ=255) gttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTTGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt < 4:385471/138‑1 (MQ=255) aaGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt > 2:331577/1‑136 (MQ=255) atatatTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTCATACTATAATAAATGTATACATATTTTATTGAGATTTAATTAATTAAAAATTA‑G‑TATTATAATTTAGTTTTAGTAAATTGTTCAATTTTTTATGTAtag > 8:319128/3‑138 (MQ=255) aGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTAtag > 7:103236/1‑138 (MQ=255) tGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt > 5:128436/1‑139 (MQ=255) gAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATTTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTATCAtt < 4:137810/138‑1 (MQ=255) gAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt < 6:329451/138‑1 (MQ=255) aaaaTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt < 1:158994/136‑1 (MQ=255) aaaTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAAGTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTg > 1:88068/1‑136 (MQ=255) aaTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTgg < 1:220535/136‑1 (MQ=255) aaTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt < 7:121966/139‑1 (MQ=255) aTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTAGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGa < 8:164034/137‑1 (MQ=255) aTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTAGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGa > 7:164034/1‑137 (MQ=255) tatataTTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTgg < 1:109935/131‑1 (MQ=255) tatatTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 7:103846/139‑1 (MQ=255) tatatTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 5:286449/139‑1 (MQ=255) atatTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAat < 1:214381/135‑1 (MQ=255) cAATATAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGG‑T‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGTGATCAATATATGGt < 2:152837/135‑1 (MQ=255) cAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTtat < 6:353592/138‑1 (MQ=255) cTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTAc < 6:218965/139‑1 (MQ=255) ggTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACt > 3:171627/1‑138 (MQ=255) gTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTat > 5:348676/1‑138 (MQ=255) gTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTaa > 3:370449/1‑139 (MQ=255) cTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt > 4:23019/1‑108 (MQ=255) cTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt < 3:23019/108‑1 (MQ=255) cTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTaa > 1:96970/1‑136 (MQ=255) cTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATCGTTATAAATTATTTACTaa > 2:2855/1‑136 (MQ=255) ataataAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 8:157851/113‑1 (MQ=255) ataataAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAAcc > 4:339852/1‑136 (MQ=255) taataaATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaa < 4:184730/137‑1 (MQ=255) ataaATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt < 7:171605/103‑1 (MQ=255) taaATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGt < 5:145835/139‑1 (MQ=255) taaATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGt < 3:59768/139‑1 (MQ=255) ataCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGtac > 8:253282/1‑138 (MQ=255) ataCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGtac > 7:293424/1‑138 (MQ=255) ataCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGtac > 4:18059/1‑138 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 6:406678/101‑1 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata > 5:406678/1‑101 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGtacta > 6:167407/1‑139 (MQ=255) cAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt > 1:120947/1‑72 (MQ=255) cAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTactact < 7:154657/139‑1 (MQ=255) gATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCg < 8:180426/139‑1 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 5:31711/1‑139 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt < 3:18059/139‑1 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 3:298419/1‑139 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 4:388496/1‑139 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTAATACTCGt > 8:45602/1‑139 (MQ=255) ttGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 5:297926/1‑139 (MQ=255) tGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 3:47440/1‑138 (MQ=255) tGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 3:12938/1‑138 (MQ=255) tGTACGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGa < 8:37263/86‑1 (MQ=255) tGTACGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGa > 7:37263/1‑86 (MQ=255) gTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGta > 2:381891/1‑71 (MQ=255) gTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 1:268710/1‑136 (MQ=255) aTGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTg > 1:49468/1‑80 (MQ=255) aTGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 2:18886/1‑135 (MQ=255) aTGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACAAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 1:386799/1‑135 (MQ=255) ggAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATTGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAATTCAGTACTAATCTTTtaata < 6:229037/138‑1 (MQ=255) gagaTGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTaataat < 4:370449/139‑1 (MQ=255) agaTGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTtaataa > 3:212871/1‑137 (MQ=255) agaTGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTtaata < 2:315468/136‑1 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt > 6:284231/1‑79 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAg > 6:367050/1‑139 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAg < 2:50177/135‑1 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGc > 1:351641/1‑136 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCtt < 6:297926/138‑1 (MQ=255) aattaattAAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCATTATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATTATAGCt > 2:341261/1‑136 (MQ=255) attaattaAAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTg > 5:118539/1‑139 (MQ=255) ttaattaaAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTc > 2:98103/1‑136 (MQ=255) aattaaAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGAGATGGAGTAAATGGTTCAATGTTTATTGTATAGTAGCATACGGATCAATATATGGTTATAAATTATTAACTAACCAAGAAGTCATTACTACTCTTTTAATAATAGCTTCTGTaa > 4:395428/1‑139 (MQ=255) attaaAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTaa < 7:253282/138‑1 (MQ=255) ttaaAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAtt > 3:254665/1‑139 (MQ=255) ttaaAAAGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAtt < 3:339852/139‑1 (MQ=255) aaGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAttgt < 2:268710/136‑1 (MQ=255) aaGGA‑GTT‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAttgt < 1:2855/136‑1 (MQ=255) | GTGAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGA‑G‑T‑TTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTT > BS168_reference_genome/557728‑557997 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |