Missing coverage evidence...
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GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAA  >  BS168_reference_genome/166298‑166463                                                                                                                                           |                            gTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACa                             >  3:173141/1‑138 (MQ=11)    aGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAAc                         >  5:48544/1‑139 (MQ=11)       ggTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAAc                         <  2:108499/136‑1 (MQ=11)        gTTCGCTCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGCAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAACCAAGACAACACGTAc                     >  7:194286/1‑139 (MQ=11)        gTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAc                     >  4:42358/1‑139 (MQ=11)         ttCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGt                       <  1:323252/136‑1 (MQ=11)           cGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAc                     >  1:111304/1‑136 (MQ=11)             aTCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAcgt                   >  2:306954/1‑134 (MQ=2)                 cGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAAtt            <  7:64599/139‑1 (MQ=11)                   cTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACACAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAAtt            >  4:90623/1‑137 (MQ=2)                   cTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAAtt            >  6:406123/1‑137 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGGAGTGACATTGTAGACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAATGCTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAAGTGAGTTTTTa   >  6:154721/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTTACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  8:370601/1‑138 (MQ=2)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGtttt     >  1:162342/1‑136 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  4:400049/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  4:224915/1‑138 (MQ=11)                           caccaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  3:274459/1‑138 (MQ=11)                            accaAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGATTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaa  >  8:241137/1‑138 (MQ=2)                              caAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  2:95130/1‑135 (MQ=11)                              caAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  2:65350/1‑135 (MQ=11)                              caAAAGTTTTTAAAAAA‑GTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa   >  1:165757/1‑135 (MQ=11)                                                                                                                                           |                            GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAA  >  BS168_reference_genome/166298‑166463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑