Missing coverage evidence...
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*	*	÷	BS168_reference_genome	171469–171677	176229–172977	1301–4761	21 [20]	[20] 21	rrnG‑16S–[rrnG‑5S]	rrnG‑16S,rrnG‑23S,[rrnG‑5S]

TTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGAT  >  BS168_reference_genome/171331‑171476                                                                                                                                          |         ttttttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca         <  7:233883/139‑1 (MQ=34) ttttttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca         >  7:206955/1‑139 (MQ=34) ttttttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca         >  4:924/1‑139 (MQ=34)   ttttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca         >  8:53335/1‑137 (MQ=33)   ttttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca         >  3:403049/1‑137 (MQ=33)    tttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGcaca       <  8:339070/138‑1 (MQ=33)    tttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGcaca       <  5:335580/138‑1 (MQ=33)    tttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGc          <  2:165757/135‑1 (MQ=33)     ttAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAg      <  3:42358/138‑1 (MQ=33)      tAAAAAAGTTCTTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGGTGCCTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGc     <  7:83407/138‑1 (MQ=12)      tAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAATTCGCACAGc     >  8:270086/1‑138 (MQ=18)       aaaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATCAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCg    <  3:224915/138‑1 (MQ=17)       aaaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCTCACAGCg    <  7:323039/138‑1 (MQ=17)       aaaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCg    <  4:173141/138‑1 (MQ=32)        aaaaaGTTATTGTCTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAATCAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGa   <  8:7865/138‑1 (MQ=17)        aaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGGCAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGa   <  6:404245/138‑1 (MQ=17)        aaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAg      <  2:1336/135‑1 (MQ=32)        aaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGa   <  8:126034/138‑1 (MQ=32)        aaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGa   <  8:22008/138‑1 (MQ=32)        aaaaaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGa   <  8:362979/138‑1 (MQ=32)           aaGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGAt  >  2:181806/1‑136 (MQ=31)                                                                                                                                          |         TTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGAT  >  BS168_reference_genome/171331‑171476

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑