| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 1,481,481 | T→C | intergenic (+30/‑66) | ykzU → / → ykuH | conserved hypothetical protein/conserved protein of unknown function |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 1,481,481 | 0 | T | C | 97.5% | 279.7 / ‑1.6 | 79 | intergenic (+30/‑66) | ykzU/ykuH | conserved hypothetical protein/conserved protein of unknown function |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (40/37); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.24e-01 | |||||||||||
TTTAAACGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGTCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTATCATCTTTAATGTT > BS168_reference_genome/1481350‑1481612 | tttAAACGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGtt > 2:313217/1‑136 (MQ=255) ttAAACGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGTCGTTc > 1:114728/1‑136 (MQ=255) tAAACGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCtt > 6:307745/1‑139 (MQ=255) tAAACGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCtt > 5:49654/1‑139 (MQ=255) aaaCGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTg > 6:368869/1‑139 (MQ=255) gTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGttt > 3:305408/1‑138 (MQ=255) tGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTAAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGtttaa > 5:72076/1‑137 (MQ=255) cTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGtttt < 1:313217/136‑1 (MQ=255) cTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTAtt > 6:330648/1‑139 (MQ=255) cTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTAtt < 6:301489/139‑1 (MQ=255) ttttGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTa > 2:99531/1‑136 (MQ=255) tGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTa > 6:328676/1‑138 (MQ=255) ggATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCGTGTTTTtatttatattta > 1:341335/1‑135 (MQ=255) gATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTaaa > 1:234192/1‑136 (MQ=255) gTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGatat < 6:49654/139‑1 (MQ=255) aaGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAt > 5:10671/1‑139 (MQ=255) aaGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAt > 6:282600/1‑139 (MQ=255) agaTTGGAAAAATAACAGCCCAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAACCTGGCCGTGCGCTTGTTTTATTTTCTTTTTTAATTTATGATATAAt > 1:366879/1‑136 (MQ=255) agaTTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAt > 1:2867/1‑136 (MQ=255) gaTTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAttttt < 5:307745/139‑1 (MQ=255) gaTTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAtt < 1:208036/136‑1 (MQ=255) gaTTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAtt < 1:99531/136‑1 (MQ=255) aTTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAttttt > 6:358901/1‑138 (MQ=255) aTTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAttt < 1:166096/136‑1 (MQ=255) ttGGAAAAATAACAGCACAATCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTaa < 8:313795/139‑1 (MQ=255) ttGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAtttt > 1:64636/1‑136 (MQ=255) attgAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTaa < 4:87417/136‑1 (MQ=255) tGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCGTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTaaa > 8:177550/1‑139 (MQ=255) gAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTaa < 2:64636/136‑1 (MQ=255) aTAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAg < 8:20780/139‑1 (MQ=255) tAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAgg > 5:11615/1‑139 (MQ=255) tAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAg > 8:188994/1‑138 (MQ=255) cAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAg > 1:230349/1‑135 (MQ=255) aGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTg < 4:130392/139‑1 (MQ=255) gCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGa > 6:308801/1‑139 (MQ=255) aGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGAtt < 2:230349/136‑1 (MQ=255) gCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTGCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCAtt > 3:67373/1‑139 (MQ=255) agaTGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAAt > 4:276401/1‑139 (MQ=255) aTGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTg > 6:239391/1‑139 (MQ=255) tGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTTTTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGt > 5:62403/1‑139 (MQ=255) tGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTa > 4:73852/1‑93 (MQ=255) tGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTa < 3:73852/93‑1 (MQ=255) tGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGt > 6:386732/1‑139 (MQ=255) tGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGt > 3:81951/1‑139 (MQ=255) gTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTTTTTTATATTTAAATTTATTATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGTTTCATTGAAGAAAtttt > 4:217041/1‑136 (MQ=255) gTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTTAATTTATGATATAATTTTTTAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATtttt > 8:145835/1‑139 (MQ=255) gTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGt > 5:109636/1‑138 (MQ=255) aTCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGt > 1:144608/1‑135 (MQ=255) aTCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTaa > 8:291224/1‑138 (MQ=255) aTCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTGTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGt > 1:299323/1‑135 (MQ=255) tCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTaaa < 4:12878/138‑1 (MQ=255) tCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTaaa < 7:188994/138‑1 (MQ=255) tCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTaaa < 5:125775/138‑1 (MQ=255) cGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTa > 2:141773/1‑135 (MQ=255) aaaaaTGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAagt < 2:144608/136‑1 (MQ=255) aaaaaTGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCGTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGGGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAagttag > 6:299150/1‑139 (MQ=255) atatCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGTCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGtat < 6:145355/138‑1 (MQ=255) aTAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTa < 5:330648/138‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAATAAATCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGATTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTTAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTTAg < 7:37550/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTAttttt < 2:341335/136‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 3:284570/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 5:133884/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 6:10671/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 8:124488/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATATTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 4:373082/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTCTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 4:323546/139‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACAGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTAttttt < 1:195773/136‑1 (MQ=255) tAAACTGCAAAACAAGCGAACGGTAAAACTGGCCGGTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTAttttt < 2:125149/136‑1 (MQ=255) aaaaCAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTGTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGAAGTTTAg > 4:354520/1‑139 (MQ=255) aaaaCAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGACTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg < 5:228072/131‑1 (MQ=255) aaaaCAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGACTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAg > 6:228072/1‑131 (MQ=255) aaaaCAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGGTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAttttt < 3:134201/70‑1 (MQ=255) aaaaCAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGGTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAAttttt > 4:134201/1‑70 (MQ=255) cAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGt < 2:234192/136‑1 (MQ=255) cAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTat < 3:276401/139‑1 (MQ=255) cAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTat < 7:314304/139‑1 (MQ=255) cAAGCGAACGTTAAAACTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTat < 5:328676/139‑1 (MQ=255) cggtAAAACTGGCAGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTATCATCt < 1:145796/133‑1 (MQ=255) aaaCTGGCCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTATCATCTTTAATGtt < 6:109636/139‑1 (MQ=255) | TTTAAACGTGCTTTTGATGTTGAGGATTATAGTGAAGAGATTGGAAAAATAACAGCACAAGCATTTAGAGATGTTATCGAGAAAAAAATGATATCTGAATAAACTGCAAAACAAGCGAACGTTAAAACTGGTCGTTCGCTTGTTTTATTTTCTATTTAAATTTATGATATAATTTTTAAAGATTAAGGAGTGATTCATTGAAGAAATTGTTAAAAAAGTTAGTTGTATTATTTTTAAGCAGTTTAGTTATCATCTTTAATGTT > BS168_reference_genome/1481350‑1481612 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |