| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 1,553,440 | T→C | 5.3% | L181S (TTG→TCG) | ftsW → | cell‑division protein; transporter of lipid‑linked cell wall precursors |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 1,553,440 | 0 | T | C | 5.3% | 245.0 / 4.0 | 76 | L181S (TTG→TCG) | ftsW | cell‑division protein; transporter of lipid‑linked cell wall precursors |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/34); new base C (2/2); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
TCGACCATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCGCGTTTTGAGAGTCT > BS168_reference_genome/1553314‑1553578 | tCGACCATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCtt > 5:71133/1‑139 (MQ=255) cccATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAg > 6:186934/2‑139 (MQ=255) aCCATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCCTGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAg > 2:194021/1‑139 (MQ=255) aCCATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAg > 5:260860/1‑139 (MQ=255) aCCATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAg > 6:403047/1‑139 (MQ=255) ccATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGc > 7:8704/1‑139 (MQ=255) cATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCg > 3:194999/1‑139 (MQ=255) aTCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCgg < 6:260860/139‑1 (MQ=255) ttAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGaa < 5:186934/136‑1 (MQ=255) aCGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGc > 6:134969/1‑139 (MQ=255) aCGCGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTAAATTCCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACg < 3:141265/138‑1 (MQ=255) gAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt < 5:17566/139‑1 (MQ=255) gAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt > 5:211799/1‑139 (MQ=255) gAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt < 5:403047/139‑1 (MQ=255) aGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt < 2:262345/138‑1 (MQ=255) aGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt > 4:20086/1‑138 (MQ=255) aGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt > 1:262345/1‑138 (MQ=255) tAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAg > 2:368134/1‑139 (MQ=255) tAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAg < 5:155877/139‑1 (MQ=255) tAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAg > 1:92688/1‑139 (MQ=255) tAGCCCCTCCGGTAGTCAAGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCCTGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAg < 4:49262/139‑1 (MQ=255) ccTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTtg < 7:98746/139‑1 (MQ=255) tCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTtgt > 7:71669/1‑138 (MQ=255) tCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTtgt > 8:288418/1‑138 (MQ=255) tCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTggg < 6:211799/139‑1 (MQ=255) gCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAAtt > 5:65873/1‑139 (MQ=255) tataATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGtt > 6:207300/1‑139 (MQ=255) taATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGttt < 1:368134/138‑1 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGc < 8:290301/109‑1 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGc > 7:290301/1‑109 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCAttt > 4:415149/1‑139 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCAtt < 6:119473/138‑1 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTCGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCAttt > 7:364472/1‑139 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTCGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCAttt > 7:359401/1‑139 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTCGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCAtt < 8:364472/138‑1 (MQ=255) tgtgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTCGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCAtt < 8:359401/138‑1 (MQ=255) tgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt > 4:329808/1‑102 (MQ=255) tgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGt < 3:329808/102‑1 (MQ=255) tgGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTa > 7:394237/1‑139 (MQ=255) ggTTAATTGCCATGCAGCCAGATTGCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAATGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGt < 7:267729/139‑1 (MQ=255) ttAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATCGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCCGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCa < 5:16820/139‑1 (MQ=255) ttAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCa < 3:393232/139‑1 (MQ=255) aaTTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAg < 3:20086/138‑1 (MQ=255) aaTTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAg < 6:71133/138‑1 (MQ=255) cATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCtat > 7:311334/1‑138 (MQ=255) tGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCtattat < 5:374969/139‑1 (MQ=255) tGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCtattat < 6:65873/139‑1 (MQ=255) tttCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAAt < 8:8704/139‑1 (MQ=255) aatataGGGTTAATTGCGACGAGCATGATCTTGTGCTCCGGCTACAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTa > 4:151142/3‑138 (MQ=255) ataGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACt < 5:207300/138‑1 (MQ=255) aGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGATTTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCGTTTTGAATCATGACAAAATTTTAACTg > 2:185586/1‑137 (MQ=255) aGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGCCACAATTTTACCTg > 1:309000/1‑137 (MQ=255) aGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTg > 8:358527/1‑137 (MQ=255) aGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTg > 1:249164/1‑137 (MQ=255) ggTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAgg < 8:188718/139‑1 (MQ=255) ggTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAgg < 6:88060/139‑1 (MQ=255) ttAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGa > 4:350097/1‑46 (MQ=255) ttAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGa < 3:350097/46‑1 (MQ=255) ttAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGc < 7:88853/58‑1 (MQ=255) ttAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGc > 8:88853/1‑58 (MQ=255) tAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCg > 1:341676/1‑139 (MQ=255) aaTTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGATTTGTTTTCATTTTAGTAGGCCGTATTATCTATTTGATTAAGGCCAAAATTTAAAAGGAAGGCCGt > 3:309273/1‑139 (MQ=255) aaTTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCtattat < 7:336361/102‑1 (MQ=255) aaTTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCtattat > 8:336361/1‑102 (MQ=255) aaTTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGt > 4:141622/1‑139 (MQ=255) aTTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGt < 1:375542/89‑1 (MQ=255) aTTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGt > 2:375542/1‑89 (MQ=255) tGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATa < 6:391743/61‑1 (MQ=255) tGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATa > 5:391743/1‑61 (MQ=255) cGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTATCTGAAGGCCGTTTAg < 3:151142/138‑1 (MQ=255) gACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAgcg < 1:194021/139‑1 (MQ=255) aCGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAg > 7:176082/1‑86 (MQ=255) aCGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAg < 8:176082/86‑1 (MQ=255) cATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCGCGtttt > 3:251476/1‑139 (MQ=255) cATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCGCGtttt > 1:164541/1‑139 (MQ=255) tGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCGCGTTTTga < 8:311334/139‑1 (MQ=255) tgtgCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGTCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCTCGTATTGAGAGTCt > 2:197662/1‑139 (MQ=255) tgtgCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCGCGTTTTGAGAGTCt > 3:216037/1‑139 (MQ=255) | TCGACCATCTGTTAACGGGAGTAGCCCCTCCGGTAGTCATGACGCTTATAATTTGTGGGTTAATTGCCATGCAGCCAGATTTCGGTACAGCCATGATTATAGGGTTAATTGCGACGTGCATGATCTTGTGCTCCGGCTTCAGCGGAAAGACGCTGGTGAGGCTTGTGATACTGGGCGGAATTGTTTTCATTTTAGTCAGCCCTATTATCTATTTGAATCAGGACAAAATTTTAACTGAAGGCCGTTTAGCGCGTTTTGAGAGTCT > BS168_reference_genome/1553314‑1553578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |