| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 2,411,036 | A→G | 40.7% | intergenic (‑447/‑50) | fmnP ← / → serA | FMN permease/3‑phosphoglycerate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 2,411,036 | 0 | A | G | 40.7% | 40.4 / 102.7 | 86 | intergenic (‑447/‑50) | fmnP/serA | FMN permease/3‑phosphoglycerate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/22); new base G (23/11); total (51/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.98e-02 | |||||||||||
ACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAA > BS168_reference_genome/2410903‑2411174 | aCGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTa < 6:221728/139‑1 (MQ=255) tgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTAt < 5:106055‑M1/50‑1 (MQ=255) ttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCagt < 6:53325‑M1/54‑2 (MQ=255) ttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGAGTGTTAAATTATCagt < 1:55789‑M1/54‑2 (MQ=255) tGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGata > 8:92859/1‑139 (MQ=255) tataGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGt > 1:270672/1‑139 (MQ=255) tataGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGt > 6:366212/1‑139 (MQ=255) agaATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCATTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGt > 3:200605/1‑138 (MQ=255) agaATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCATTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGt > 3:193757/1‑138 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 5:165789/1‑139 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 5:186067/1‑139 (MQ=255) tGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt > 3:277927/1‑138 (MQ=255) cTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTag > 3:6054/1‑139 (MQ=255) aaTTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTaggagg > 1:226259/1‑138 (MQ=255) ttACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGAt < 4:407366/139‑1 (MQ=255) gCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTc > 2:113983/1‑138 (MQ=255) cTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTAt < 4:200605/139‑1 (MQ=255) cTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTAt < 4:193757/139‑1 (MQ=255) cTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTAt < 2:270672/139‑1 (MQ=255) tCAGATCAGTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTGTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAGTTAGGAGGAAATCTATCGATGTTTCGAGTATTgg > 3:245244/1‑139 (MQ=255) gATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATACTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGtct < 4:250278/139‑1 (MQ=255) cATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGtct > 1:200810/1‑136 (MQ=255) ttGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGTAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGa > 1:151149/1‑138 (MQ=255) ttaGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAAc < 1:345484/106‑1 (MQ=255) ttaGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAAc > 2:345484/1‑106 (MQ=255) acgcgttACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGc < 2:367918/133‑1 (MQ=255) aGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGc < 6:186067/138‑1 (MQ=255) cTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAac > 2:113804/1‑138 (MQ=255) tttACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacga > 3:54950/1‑139 (MQ=255) ttACTTTTATCATTTACTGCGTCAATACACTTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGTAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacga < 4:342543/138‑1 (MQ=255) tACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAATTCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacgacg > 6:378097/1‑139 (MQ=255) tACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacgacg > 7:394830/1‑139 (MQ=255) tACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacgacg > 8:276804/1‑139 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattc > 7:249172‑M1/6‑58 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattc > 5:383876‑M1/6‑58 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattc > 7:64979‑M1/6‑58 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattc > 7:344251‑M1/6‑58 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgt < 6:326251‑M1/118‑66 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgt > 5:326251‑M1/6‑58 (MQ=255) tCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACa < 4:408506/138‑1 (MQ=255) tCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACa < 7:92859/138‑1 (MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaattgaagaatactccaactcaattagaacctaatgttcctgtaacaagaagccattcaat > 6:47883‑M1/4‑56 (MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaat > 6:367979‑M1/4‑56 (MQ=255) cTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTAAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTACCGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGc < 6:88680/138‑1 (MQ=255) tttACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgg > 5:48752‑M1/1‑53 (MQ=255) tttACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgg > 6:166788‑M1/1‑53 (MQ=255) ttACTGCGTCAATACACTTTGACAATCTTTTGTTAATTTTTAAAATTATAATATTTTTAGTTTTTCAATTTTGGAGGAAATCTAACGATGTTTGTAGTATTGGTCTCAGAAAAAATGAGCCACGACGGTTTACAGCCa < 2:200810/138‑1 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACTGCCACt < 6:90900‑M1/139‑1 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACt < 2:13595‑M1/139‑1 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACt < 7:6015‑M1/139‑1 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACt < 6:204708‑M1/139‑1 (MQ=255) cTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacga > 8:385414/1‑122 (MQ=255) cTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacga < 7:385414/122‑1 (MQ=255) cTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTa < 1:113804/139‑1 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCa < 3:300470/132‑1 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCa > 4:300470/1‑132 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTAtt > 8:321393/1‑138 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGAAACGAAGGTTTACAGCCACTTAtt > 6:205160/1‑138 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgt > 1:183387‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttg < 5:166788‑M1/137‑92 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatggcatttgt > 3:313234‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATc < 7:321393/139‑1 (MQ=255) tACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttg < 8:64979‑M1/139‑100 (MQ=255) tACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttg < 6:117336‑M1/139‑100 (MQ=255) ctcgtTGACACTGTTTTTATATTTTTTTTAATTATCAGtgaaatgaatgtaattattttaaaattaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgat < 2:355952‑M1/137‑102 (MQ=255) cacGTTGACACTATTTTGAAAGTGTTTTAAATTATCAGtgacattaaaggaagtattttaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgat < 6:48752‑M1/139‑102 (MQ=255) cGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 5:140936‑M1/1‑36 (MQ=255) cGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 5:170227‑M1/1‑36 (MQ=255) cGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatc > 6:267350‑M1/1‑36 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctc < 4:314622‑M1/139‑105 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 6:18103‑M1/1‑35 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 8:308788‑M1/1‑35 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgatcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 7:389135‑M1/1‑35 (MQ=255) tGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctg > 8:315105‑M1/1‑33 (MQ=255) tGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctg < 7:315105‑M1/97‑65 (MQ=255) gACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatg > 4:358319‑M1/1‑32 (MQ=255) gACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagacattcaatgggatttgtcattttgatctcatg > 2:70499‑M1/1‑32 (MQ=255) acacTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatg < 5:267350‑M1/138‑108 (MQ=255) ctctTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcg > 1:107901‑M1/1‑28 (MQ=255) tctTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccacctcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaaggggatttgtcattttgatctcatgtgcgg > 2:45058‑M1/1‑27 (MQ=255) tctTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcgg > 2:94041‑M1/1‑27 (MQ=255) ttttGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCa < 7:43809/111‑1 (MQ=255) ttttGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCa > 8:43809/1‑111 (MQ=255) ttttGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAATTCg > 2:219734/1‑139 (MQ=255) ttttGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCg > 7:294515/1‑139 (MQ=255) ttttGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCg > 4:188728/1‑139 (MQ=255) atatGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaa > 7:408032/1‑138 (MQ=255) atatGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaa > 3:168676/1‑138 (MQ=255) atGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGAc < 8:316960/116‑1 (MQ=255) atGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaaaaa > 7:235513/1‑139 (MQ=255) atGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaaaaa > 7:241557/1‑139 (MQ=255) atGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaa > 7:15006/1‑136 (MQ=255) atGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaa < 8:15006/136‑1 (MQ=255) atGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTAGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGAc > 7:316960/1‑116 (MQ=255) | ACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAA > BS168_reference_genome/2410903‑2411174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |