| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2,655 | Δ3 bp | intergenic (–/‑321) | – / → eryR | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 2654 | 32 (0.010) | 6553 (1.760) | 211/246 | 0.0 | 99.5% | intergenic (–/‑324) | –/eryR | –/– |
| ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2658 = | 34 (0.010) | intergenic (–/‑320) | –/eryR | –/– | |||||
Only 100 of 6553 total aligned reads displayed.
CTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2520‑2654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2792 TATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 4:247948/136‑1 ATTGATGCTTGTGTTACTATTTACAGCTGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATGTGCTAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATTAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 1:321617/135‑1 ATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 1:349581/135‑1 taGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGACGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACAACGATATCTAATATGTTGATACCCGAAG > 2:318182/3‑136 TTGATGCTGGTGATACTATTTACAGCGTCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTTCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGAGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 7:388762/134‑1 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCCAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 7:365446/134‑1 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAATATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 4:156450/134‑1 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 1:131031/134‑1 TGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT < 1:100271/136‑1 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT > 3:59421/1‑135 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT > 7:300112/1‑135 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAA < 5:98805/136‑1 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAA < 2:388025/136‑1 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT < 7:264370/134‑1 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT < 2:292402/134‑1 GATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA > 8:126425/1‑123 CTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTG < 4:387814/135‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGT < 8:215330/135‑1 CAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA > 6:237830/1‑134 CAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT > 3:230905/1‑121 GGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTG > 8:183605/1‑135 GCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT < 4:360834/116‑1 CGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTGGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAG > 5:229171/1‑136 GCCATCTACTTATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATCTGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGT < 6:214626/136‑1 GCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAATATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTTAACACCACGATTTCTAATATGTTGATCCCCCAAGCAAACATAAGAGTGTGTTGGTATTGCAGT > 6:61128/1‑136 GCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGT > 3:2611/1‑136 GCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCACCGAAGCAAACTTAAGAGATTGTTGATAGTCCAG > 6:407997/1‑135 CATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTAT > 8:42471/1‑136 attTCGTAAATGATTTGAAAGATAAATTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAAT < 6:38653/132‑1 ATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAAT < 5:414951/135‑1 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGTGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG > 4:303379/1‑136 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG > 2:22823/1‑136 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTAT < 3:109394/136‑1 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTA > 3:405958/1‑135 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTA > 2:198382/1‑135 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCACGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTA > 6:185961/1‑135 GGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAA > 8:268806/1‑136 GCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGA < 7:236713/135‑1 CAAGATAAAGTTATATCATTGCATGATCATGAGGTATCGTTTTTGAACATCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAA < 6:84318/135‑1 CAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAA < 3:168766/135‑1 AAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAA < 6:295695/87‑1 AAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGT > 3:343778/1‑135 AAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGT > 7:206649/1‑135 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAAT > 7:43704/1‑136 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGG < 4:222041/122‑1 CATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCTAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT > 2:48352/1‑136 CATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT > 6:272244/1‑136 CATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT > 4:43896/1‑136 CATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT > 6:324596/1‑136 CATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGA < 5:199632/123‑1 ATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT < 3:314581/135‑1 TTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGT > 3:201982/1‑78 AGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAA > 5:287710/1‑135 AGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 2:16458/55‑1 GGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAA > 4:333489/1‑135 GGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 8:387742/54‑1 GATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT > 5:347713/1‑62 AGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTA < 6:129742/135‑1 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAAT > 2:134328/1‑136 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAAT > 6:354231/1‑136 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAAT > 1:288056/1‑136 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 8:337704/1‑56 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT > 5:69584/1‑54 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA > 2:75351/1‑45 CGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 3:135878/1‑135 GTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAA < 3:93469/136‑1 GTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 5:2597/1‑134 GTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 1:382835/1‑134 TTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAG > 8:69293/1‑136 TTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATT < 7:337923/130‑1 TTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGG < 7:13797/135‑1 TTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAG > 5:131039/1‑136 CCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCG < 1:155588/136‑1 CACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGT < 3:28794/136‑1 GATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGATGGATTCGTCAT > 7:111399/1‑136 TATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGT < 1:44857/136‑1 ATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTAT > 8:242560/1‑136 ATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC > 4:192750/1‑136 ATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC > 5:316356/1‑136 ATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGG > 8:365466/1‑117 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC < 1:189219/135‑1 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC < 1:25432/135‑1 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC < 8:299615/135‑1 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC < 2:26766/135‑1 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC < 4:98952/135‑1 GTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCC > 8:154684/1‑135 GATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAAT > 8:100142/1‑136 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 6:160730/1‑136 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 2:106118/1‑136 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 1:71878/1‑136 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 4:281168/1‑136 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 3:37674/1‑136 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 7:170506/1‑136 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 7:7207/1‑135 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 4:125352/1‑135 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 1:217265/1‑135 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 5:16301/1‑135 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 5:386164/1‑135 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCAAAATGCG > 4:66735/1‑135 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGAT < 2:350224/110‑1 CTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2520‑2654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |