| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 376,025 | (G)8→7 | intergenic (‑227/‑7) | hxlA ← / → hxlR | 3‑hexulose‑6‑phosphate synthase (HPS)/positive regulator of hxlAB expression (formaldehyde sensing) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 376,018 | 0 | G | . | 98.9% | 424.0 / ‑3.9 | 94 | intergenic (‑220/‑14) | hxlA/hxlR | 3‑hexulose‑6‑phosphate synthase (HPS)/positive regulator of hxlAB expression (formaldehyde sensing) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (53/40); minor base C (0/1); total (53/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTTACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAGGGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGTTC > BS168_reference_genome/375883‑376151 | gTTACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggg < 7:503457/138‑1 (MQ=255) tttattGGAGTTTTCTGTGAGGAGAGAATATGAGATTTCTTTAGCTTGTTTTTATGTGTTAGTTTATTGAAATAAGAGTCTGAATAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 8:527212/135‑1 (MQ=255) ttACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 7:187097/139‑1 (MQ=255) ttACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 3:125233/139‑1 (MQ=255) ttACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 4:197097/139‑1 (MQ=255) ttACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 4:455815/139‑1 (MQ=255) tACTTGGAGGATTCTGTGAGGAGAGAAAATCAGATTTATTTCTCTTGATTTTTTGATTTAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 2:529663/138‑1 (MQ=255) tACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAATAGTAAGTAAGTTATGATACGTATCTATCATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 4:154857/138‑1 (MQ=255) tACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggg < 5:107135/138‑1 (MQ=255) aCTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAgggggg > 7:48163/1‑138 (MQ=255) cTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggggga < 1:526806/139‑2 (MQ=255) cTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAggggggga < 5:171389/139‑2 (MQ=255) ttGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAgggggggat > 8:461368/1‑137 (MQ=255) ggaggaTACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAgggggggatt < 8:542436/138‑4 (MQ=255) aggaTACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTa < 3:506197/139‑1 (MQ=255) gaTACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTTAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTAtt < 8:462879/139‑1 (MQ=255) gaTACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTAtt > 8:10661/1‑139 (MQ=255) gaTACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTAtt < 2:39550/139‑1 (MQ=255) tgAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCg > 5:123800/1‑138 (MQ=255) tgAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTAGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGcc < 6:398751/137‑1 (MQ=255) gaggagAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGa > 1:260796/1‑139 (MQ=255) agagaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGCTACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGACTGATGga > 2:319119/1‑139 (MQ=255) agagaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGga > 2:146294/1‑139 (MQ=255) agagaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGga < 2:118321/139‑1 (MQ=255) agagaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGga < 7:533408/139‑1 (MQ=255) agaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGgac > 5:319532/1‑138 (MQ=255) agaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGgac > 3:522872/1‑138 (MQ=255) agaCAATCAGATTACTTTCGCTTGATATTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGgac > 2:291318/1‑138 (MQ=255) gaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGgacga > 3:171074/1‑139 (MQ=255) gaCAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGgacga > 6:158396/1‑139 (MQ=255) cAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGCGTATAATGAAAAAAGACTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACa < 2:561511/139‑1 (MQ=255) cAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGga > 5:345662/1‑134 (MQ=255) cAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGga < 6:345662/134‑1 (MQ=255) cAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACa < 7:461368/139‑1 (MQ=255) aTCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACaa > 7:396186/1‑138 (MQ=255) gATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGt < 6:123800/139‑1 (MQ=255) aTTTCTTACGCTTGATTATATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGCCGAAAAAAGGtt > 1:366311/1‑139 (MQ=255) ctttcGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTaa < 4:156304/138‑1 (MQ=255) ctttcGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTaa < 2:307227/138‑1 (MQ=255) tcGCTTTATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGTGTCTTCATAAAAGTAAGTTAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATtg < 2:166524/138‑1 (MQ=255) cTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATtgt > 6:106424/1‑136 (MQ=255) ttGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAATAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTgaga < 2:72362/139‑1 (MQ=255) gATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTgaga < 8:136392/137‑1 (MQ=255) aTTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAg > 8:539725/1‑138 (MQ=255) ttATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGaa < 5:158396/138‑1 (MQ=255) aagtctgagtATAATGCAAAAAGCCTCAGCAAAAAAGTAACTAACTGCTGCAAAGTATCTAACAAAAAAAAACGGTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt < 3:27029/133‑1 (MQ=255) aTGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTTAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGTTTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt < 4:175508/138‑1 (MQ=255) aTGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt < 7:326015/138‑1 (MQ=255) aTGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt < 5:501025/138‑1 (MQ=255) aTGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt < 3:565943/138‑1 (MQ=255) tgattgagTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAATTTTTAGTAAGTGATGATACGTTTCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGTGCCGGTTGGTCGTCAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTat < 8:518120/139‑2 (MQ=255) tgagtATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCt > 2:265623/1‑139 (MQ=255) tgagtATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCt > 1:135672/1‑139 (MQ=255) gagtATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt > 6:224421/1‑132 (MQ=255) agtATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTgaga < 6:3513/124‑1 (MQ=255) agtATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTgaga > 5:3513/1‑124 (MQ=255) gtATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTg < 2:260796/138‑1 (MQ=255) tataATGAAACAAGATTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGCTTCGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGAGTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTTACGCTTGCa < 1:319119/139‑1 (MQ=255) tataATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCa < 5:542768/139‑1 (MQ=255) tGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt > 3:155122/1‑124 (MQ=255) tGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAAtt < 4:155122/124‑1 (MQ=255) tGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGAt > 1:453419/1‑139 (MQ=255) aaaaaGAGTCTGCAATAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTAACTAACATACAAAAAGGTAACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGAAGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGAGTgg > 8:84568/1‑139 (MQ=255) aaaaaGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTgg < 2:485115/139‑1 (MQ=255) aaaaaGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTgg > 8:181620/1‑139 (MQ=255) aaaGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCg > 7:116297/1‑139 (MQ=255) aaaGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCg > 4:443904/1‑139 (MQ=255) aaaGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCg > 1:394790/1‑139 (MQ=255) cTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATg > 7:180386/1‑139 (MQ=255) aaaaaaGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGaaa < 5:449816/139‑1 (MQ=255) aagtaagtaagtGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGc < 8:539625/139‑1 (MQ=255) agtGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGTATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTAt < 3:432976/139‑1 (MQ=255) tgatgaTACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATgg > 6:544570/1‑139 (MQ=255) tgatgaTACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCAGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATAAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATgg > 2:357022/1‑139 (MQ=255) atgatACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGct > 5:394301/1‑138 (MQ=255) atgatACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCa > 5:429695/1‑139 (MQ=255) tACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCAtt > 3:335468/1‑137 (MQ=255) tATCTAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGa > 7:295141/1‑138 (MQ=255) tAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAaaga < 8:396186/139‑1 (MQ=255) tAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAaaga < 7:509221/139‑1 (MQ=255) tAACATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAaaga < 2:453419/139‑1 (MQ=255) aaaCATAAAAAAAGGTTCCT‑ACCGGGGGTATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGACGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAaaga < 2:291496/138‑1 (MQ=255) cATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAgg > 1:291496/1‑139 (MQ=255) cATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAgg < 7:264648/139‑1 (MQ=255) cATACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAgg > 5:16669/1‑139 (MQ=255) tACAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGca > 1:229853/1‑139 (MQ=255) aCAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGcac > 8:174360/1‑139 (MQ=255) aCAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGca > 5:343172/1‑138 (MQ=255) aCAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGca > 5:112275/1‑138 (MQ=255) aCAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGCAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGca > 4:399820/1‑138 (MQ=255) aCAAAAAGCTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAATGTTTAATTTTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCTGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGca > 8:548042/1‑138 (MQ=255) cAAAAAGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGcac > 5:384485/1‑138 (MQ=255) aGGTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACg > 6:225373/1‑139 (MQ=255) gTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACaaaa > 8:12522/1‑135 (MQ=255) gTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACaaaa < 7:12522/135‑1 (MQ=255) gTTACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGt > 2:356932/1‑139 (MQ=255) ttACTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGtt > 6:67314/1‑139 (MQ=255) aCTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGGCGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGTTc > 5:267609/1‑138 (MQ=255) aCTAA‑GGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGTTc > 5:235688/1‑138 (MQ=255) aCTAA‑GGGAGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGTTc > 4:386801/1‑138 (MQ=255) | GTTACTTGGAGGATACTGTGAGGAGAGACAATCAGATTTCTTTCGCTTGATTTTATGAGTGAGTATAATGAAAAAAGAGTCTGCAAAAAAGTAAGTAAGTGATGATACGTATCTAACATACAAAAAGGTTACTAAGGGGGGGGATTCTATTGAGCCGGATGGACGACAAAAGGTTTAATTGTGAGAAGGAATTAACGCTTGCAGTGATTGGCGGTAAATGGAAAATGCTCATTTTATGGCATTTAGGAAAAGAAGGCACAAAACGGTTC > BS168_reference_genome/375883‑376151 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |