Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ BS168_reference_genome 160959–161238 165598–161240 3–4640 35 [33] [24] 37 [rrnI‑16S]–[rrnI‑5S] [rrnI‑16S],rrnI‑23S,[rrnI‑5S]

AACACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATG  >  BS168_reference_genome/165576‑165737
                       |                                                                                                                                          
aaCACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGTTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATttat                         >  5:95969/1‑139 (MQ=25)
aaCACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATttat                         >  5:528362/1‑139 (MQ=35)
aaCACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATttat                         <  5:328180/139‑1 (MQ=35)
aaCACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATttat                         <  3:177089/139‑1 (MQ=35)
aaCACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGGCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATttat                         <  1:63116/139‑1 (MQ=25)
   acTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATAACGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTaa                      <  5:293721/139‑1 (MQ=38)
       tcAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTc                   >  6:88860/1‑138 (MQ=40)
          aTTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTAc                >  3:483835/1‑138 (MQ=255)
          aTTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGAAGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTATAc                >  5:325976/1‑138 (MQ=255)
              gtttgGTGGCGATAGCGAAGATGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtg            <  8:212669/138‑1 (MQ=255)
              gtttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtg            <  4:431873/138‑1 (MQ=255)
              gtttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACCGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATATATTAATTATACCAtgt           >  5:446726/1‑139 (MQ=255)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGTTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTATGACGCCGCCATGCAGATTTATTAATTCTACAAggtt          >  6:318762/1‑139 (MQ=14)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtgtt          >  1:218319/1‑139 (MQ=255)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtgtt          >  5:518209/1‑139 (MQ=255)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtgtt          >  1:3127/1‑139 (MQ=255)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtgtt          >  7:13029/1‑139 (MQ=255)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtgtt          >  3:257944/1‑139 (MQ=255)
               tttgGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAAGTCTACCAtgtt          >  6:474472/1‑139 (MQ=255)
                 tggtggCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGCCGCCGCCACGCAGATTTATTAATTGTACCAggtttg        >  1:235690/1‑139 (MQ=255)
                 tgggggCGATAGCGACGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCAtgttt         <  3:446454/138‑1 (MQ=255)
                   gtggCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGa                              <  2:25186/115‑1 (MQ=31)
                   gtggCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGa                              >  1:25186/1‑115 (MQ=31)
                      gCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTAt   >  3:211049/1‑139 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  1:227968/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  7:524373/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  1:49491/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  5:430021/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  2:3127/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  4:483835/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  3:445494/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  3:430617/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  3:39751/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  2:264410/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGAGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  7:421119/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGGCACACCCGTTCCCATCCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  2:251766/139‑1 (MQ=255)
                       cGATAGCGAAGAGGGCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATg  <  4:214433/139‑1 (MQ=255)
                       |                                                                                                                                          
AACACTCTCAATTTGTTTGGTGGCGATAGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATACCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATG  >  BS168_reference_genome/165576‑165737

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: