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                                                                             aGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAgtcagtca  <  1:1686366/150‑1 (MQ=11)
                                                                                                                                                     |                                                                             
CGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAATTGCACATTAGTGTAATTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAGCGATGTGCGTAGTCAGTCA  >  BS168_reference_genome/171265‑171491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: