| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BS168_reference_genome | = 2152046 | 61 (0.960) | 8 (0.150) | 8/200 | NT | 13.7% | intergenic (+1/+40) | spsMn/sprB | spore capsular polysaccharide biosynthesis enzyme fragment; N‑terminal part of SpsM/recombination directionality factor; phage SPbeta |
| ? | BS168_reference_genome | 2286449 = | 48 (0.870) | pseudogene (2/606 nt) | spsMc | sporulation capsular polysaccharide biosynthesis enzyme C‑terminal end; restored upon phage SPbeta excision | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GAAACAGGTTCCGACATGTGAGGACCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGTTATA > BS168_reference_genome/2151910‑2152182 | aaaaagaaaagggcctataccagctcaatttgaaataacccctatcctaaggtttaatttcatttttgacctcacagccactaatagtttccactaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTatat > 6:1104‑M1/122‑139 (MQ=255) aaaCAGGTTCCGACATGTGAGGACCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATAtt < 3:26537/139‑1 (MQ=255) ccGACATGTGAGGACCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGAtact < 1:122796/138‑1 (MQ=255) ccGACATGTGAGGACCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGAtact < 1:311564/138‑1 (MQ=255) ccGACATGTGAGGACCATCCATTTGAAGCGAACCAGACCAATCTCATCGGCCGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGAtact < 1:76951/138‑1 (MQ=255) gtgAGGCCCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCTGTCTCTTCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCGTTTCTCACCGAGTGCTGCATGTCTTTTATATCAGTACAGATAAAGCTGTATctcctgtgatcagattggg > 4:339164‑M1/1‑120 (MQ=255) gtgAGGACCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACa > 2:134670/1‑138 (MQ=255) gctcaatttgaaataacccctatcctaaggtttaatttcatttttgacctcacagccactaatagtttccactaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCt < 7:118214‑M1/39‑1 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAg < 1:223439/116‑1 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAg > 2:223439/1‑116 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGa > 2:51002/1‑138 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGa > 5:141886/1‑138 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGa > 2:211855/1‑138 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGa > 8:171415/1‑138 (MQ=255) tccatTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGATGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGa > 3:72656/1‑138 (MQ=255) ttGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGaaaaaaa > 5:225309/1‑139 (MQ=255) tGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGaaaaaaa < 7:286432/138‑1 (MQ=255) gCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGc < 7:80297/139‑1 (MQ=255) gCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGc > 5:203475/1‑139 (MQ=255) aTCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTa > 5:268197/1‑139 (MQ=255) aTCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTa > 6:23172/1‑139 (MQ=255) tCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaa > 5:148539‑M1/1‑96 (MQ=255) tCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCGTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTAGATTAAGATACTTAGTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTa > 1:172648/1‑138 (MQ=255) aCCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGc < 1:211855/139‑1 (MQ=255) aggtttaatttcatttttgacctcacagccactaatagtttccactaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGcctt < 6:169831‑M1/67‑1 (MQ=255) tctcATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGCGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTAAAGATAAAGCTGTATctcctgtgaccacaatgggtgccaccaaggagttatctgaaaagctgattca > 6:44329‑M1/1‑86 (MQ=255) tctcATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTa < 2:140402/128‑1 (MQ=255) tctcATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTa > 1:140402/1‑128 (MQ=255) tctcATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGAGCAGCATGTCATTATTATCAGTAAAGAGAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGccttcg > 7:258663/1‑138 (MQ=255) taatttcatttttgacctcacagccactaatagtttccactaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTATATTAAGAtact > 3:157082‑M1/68‑94 (MQ=255) taatttcatttttgacctcacagccactaatagtttccactaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTATATTAAGAtact < 4:157082‑M1/27‑1 (MQ=255) aTCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaag > 4:219930‑M1/1‑82 (MQ=255) aTCGGCCGACAACATTTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTATTATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTc < 8:237320/139‑1 (MQ=255) cggACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCagag < 1:51002/139‑1 (MQ=255) cggACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCagag > 1:118229/1‑139 (MQ=255) cAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGagcagc < 8:174967/139‑1 (MQ=255) cAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGagcagc < 6:30610/139‑1 (MQ=255) aaaTGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACTCCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCtt < 6:345604/139‑1 (MQ=255) aaGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCtaa > 6:284899/1‑132 (MQ=255) aaGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCtaa < 5:284899/132‑1 (MQ=255) ccTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaacc < 6:148539‑M1/139‑87 (MQ=255) tCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTg > 5:71314/1‑139 (MQ=255) tccactaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGt < 3:343162‑M1/107‑1 (MQ=255) actaagaaaagtagtaagtatcttaaaaaACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTta < 3:329536‑M1/110‑1 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCtt > 1:322651/1‑109 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCtt < 2:322651/109‑1 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTtata < 3:259935/137‑1 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTtata > 4:259935/1‑137 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATaa > 8:26252/1‑138 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATaa > 2:104393/1‑138 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATaa > 3:41786/1‑138 (MQ=255) aGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATaa > 3:290404/1‑138 (MQ=255) 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(MQ=255) GATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATc < 4:172124‑M1/139‑1 (MQ=255) GATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATc > 7:208385‑M1/1‑139 (MQ=255) aTAAAGATGTATctcctgtgaccacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttgttcggtccgctttggaaatgttctcggttccag < 1:274794‑M1/139‑128 (MQ=255) ATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTTCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATcc < 4:201422‑M1/139‑1 (MQ=255) ATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATcc < 4:253932‑M1/139‑1 (MQ=255) ATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATcc < 4:36517‑M1/139‑1 (MQ=255) ATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATcc < 3:8736‑M1/139‑1 (MQ=255) TAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCt > 6:268197‑M1/1‑139 (MQ=255) TAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCt > 3:172124‑M1/1‑139 (MQ=255) TAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCt > 5:23172‑M1/1‑139 (MQ=255) gCTGTATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttgttcggtccgctttggaaatgttctcggttccagaggtt > 1:364108‑M1/1‑7 (MQ=255) GCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGt < 3:93908‑M1/139‑1 (MQ=255) GCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGt < 5:195782‑M1/139‑1 (MQ=255) gTATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttgttcggtccgctttggaaatgttct < 1:175061‑M1/122‑119 (MQ=255) gTATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttgttcggtccgctttggaaatgttct > 2:175061‑M1/1‑4 (MQ=255) tATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaatctgtaatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttgttcggtccgctttggaaatgatctcggatccagaggttcggt < 3:303926‑M1/139‑137 (MQ=255) tATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttgttcggtccgctttggaaatgttctcggttccagaggttcggt < 3:219930‑M1/139‑137 (MQ=255) tATctcctgtgaacacaatgggtgccaccaagctgttatctgaaaagctgtttcatcaagcaaaccgccacgtccaaaacaaaggaaccttgttttattcggtccgcttttgaaatgttctcggttccagagctgtct > 2:285813‑M1/1‑3 (MQ=255) TATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATATAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGTtata < 1:29511‑M1/139‑1 (MQ=255) TATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCt < 4:35326‑M1/124‑1 (MQ=255) TATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATc > 4:305733‑M1/1‑129 (MQ=255) TATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATc < 3:305733‑M1/129‑1 (MQ=255) TATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGTtata < 3:57068‑M1/139‑1 (MQ=255) TATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGTtat > 6:71314‑M1/1‑138 (MQ=255) | GAAACAGGTTCCGACATGTGAGGACCATCCATTTGAAGCGATCCAGACCAATCTCATCGGCGGACAAAATGTGGTGGAAGCTGCCCTTTCACACCGAGTGCAGCATGTCATTAATATCAGTACAGATAAAGCTGTATATTAAGATACTTACTACATATCTAACGAAAAAAAGAAGCTTACTCTGCCTTCCTTTCCAGAGCAGCTTCTAATAAATGTTGAGCAAATTGTTTATAAAACTCATCTAAGTCATTACTTGCTTCATCCTGAGTTATA > BS168_reference_genome/2151910‑2152182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |