New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BS168_reference_genome | 2152031 = | 58 (0.910) | 9 (0.160) | 9/200 | NT | 15.5% | pseudogene (406/420 nt) | spsMn | spore capsular polysaccharide biosynthesis enzyme fragment; N‑terminal part of SpsM |
? | BS168_reference_genome | = 2286432 | 48 (0.870) | intergenic (+24/‑16) | sprA/spsMc | serine‑type phage integrase; phage SPbeta/sporulation capsular polysaccharide biosynthesis enzyme C‑terminal end; restored upon phage SPbeta excision |
AACATGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGGTCCGCTTTGGAAATGTTCTC > BS168_reference_genome/2286301‑2286567 | aaCCTGACACAAAACAGCACAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAATGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTACTAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagata > 2:340559‑M2/1‑132 (MQ=255) aaCATGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagata > 2:115397‑M2/1‑132 (MQ=255) aaCATGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagat < 4:160452‑M2/138‑7 (MQ=255) aCATTACAAAAAAAAGAAAATGGCCTATACCATCTCAATTTGAAATAAACACTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGAACTCACATAAACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTATTAAGTATCTTAAAAAACAGATaa < 8:59092/139‑1 (MQ=255) aCATGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagata > 3:265248‑M2/1‑131 (MQ=255) tGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagc > 3:160452‑M2/1‑128 (MQ=255) tGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaa > 6:224407‑M2/1‑128 (MQ=255) tGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaa < 5:224407‑M2/137‑10 (MQ=255) gACACAATAAATAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAATGTTTAATTTCATTTTTGACCTCAAAGACACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagc > 1:178453‑M2/1‑127 (MQ=255) acaAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagc > 1:341990‑M2/1‑124 (MQ=255) acaAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagc < 2:341990‑M2/135‑12 (MQ=255) aaaaaaGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTAtc < 5:316347/139‑1 (MQ=255) aaaaaGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatat > 6:1104‑M2/1‑121 (MQ=255) aagGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGaa < 4:92701/139‑1 (MQ=255) aagGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGaa < 5:81154/139‑1 (MQ=255) aagGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGaa < 1:290099/139‑1 (MQ=255) gCTCAATTTGAACTAACACCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAACAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATCGGTGcca > 7:273792/1‑139 (MQ=255) gCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTGCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCtgtg > 7:207890/1‑123 (MQ=255) gCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTGCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCtgtg < 8:207890/123‑1 (MQ=255) gCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatct < 7:118214‑M2/138‑40 (MQ=255) gCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGcca > 2:77194/1‑139 (MQ=255) cTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGccac > 2:301593/1‑139 (MQ=255) cTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGccac > 5:22029/1‑139 (MQ=255) aaTTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGccacc < 6:290682/137‑1 (MQ=255) ccccTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACAGAATGGGTGCCACAAAGCTGTTATCTg > 1:207547/1‑138 (MQ=255) ccccTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTg > 2:261582/1‑138 (MQ=255) ccccTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTg > 7:238635/1‑138 (MQ=255) ccccTATCCTAAGGTTTAATTTCAATTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTCAACACAATGTGTGCCACCAACCTGTTATCTg > 6:95296/1‑138 (MQ=255) cTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGaa > 1:332238/1‑137 (MQ=255) cTAAGGGTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTg < 2:308592/138‑1 (MQ=255) aGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatctaacgaaaaaaagaagcttactctgcctt < 6:169831‑M2/139‑68 (MQ=255) aGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGttt > 6:310819/1‑138 (MQ=255) aGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGttt > 3:91531/1‑138 (MQ=255) aGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGttt > 4:273504/1‑138 (MQ=255) tAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatact < 4:157082‑M2/94‑28 (MQ=255) tAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatact > 3:157082‑M2/1‑67 (MQ=255) tAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTtcatc > 7:273468/1‑137 (MQ=255) tAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTtcatc > 7:4190/1‑137 (MQ=255) aTTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAAcc > 1:73724/1‑139 (MQ=255) tttttGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCg > 2:229271/1‑139 (MQ=255) tttttGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCg > 1:186938/1‑139 (MQ=255) tttttGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGCTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCg > 7:356652/1‑139 (MQ=255) ttGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGcc < 5:31499/138‑1 (MQ=255) ttGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGcc < 6:268676/138‑1 (MQ=255) caGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCaaaa < 8:4190/139‑1 (MQ=255) actactAGTTTCCACTAAGCAAAGTAGTAAGTATCTTAATAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAg < 1:154176/139‑1 (MQ=255) aCTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAg < 5:49097/139‑1 (MQ=255) aCTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAg < 8:238635/139‑1 (MQ=255) cTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAgg < 7:195936/139‑1 (MQ=255) cTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAg > 8:195936/1‑138 (MQ=255) tAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGa < 1:15026/139‑1 (MQ=255) tAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAAcc < 4:91531/139‑1 (MQ=255) tAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAAcc < 1:348585/139‑1 (MQ=255) tttCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGcc < 3:213243/116‑1 (MQ=255) tttCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGcc > 4:213243/1‑116 (MQ=255) tttCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGaa < 5:127223/134‑1 (MQ=255) tttCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGaa > 6:127223/1‑134 (MQ=255) tttCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCttg > 5:339196/1‑139 (MQ=255) tCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatctaacgaaaaaaagaagcttactctgccttcctttccagagcagcttctaataaatgttgagcaaattgt < 3:343162‑M2/139‑108 (MQ=255) tCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCaaa < 5:64246/109‑1 (MQ=255) tCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCaaa > 6:64246/1‑109 (MQ=255) tCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCttgtt > 8:348474/1‑139 (MQ=255) tCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCttgtt > 3:220044/1‑139 (MQ=255) tCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTAAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCtagtt > 6:229707/1‑139 (MQ=255) aCTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatctaacgaaaaaaagaagcttactctgccttcctttccagagcagcttctaataaatgttgagcaaattgttta < 3:329536‑M2/139‑111 (MQ=255) gAAAAGTACTAAGTATCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatctaacgaaaaaaagaagcttactctgccttcctttccagagcagcttctaataaatgttgagcaaattgtttataaaa > 1:224142‑M2/1‑24 (MQ=255) agtaTCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatctaacgaaaaaaagaagcttactctgccttcctttccagagcagcttctaataaatgttgagcaaattgtttataaaactcatctaagt < 1:257713‑M2/139‑127 (MQ=255) agtaTCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGGTCCGCTTTgg > 1:123459/1‑138 (MQ=255) gtaTCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGGTCCGCTTTGGaa < 3:273504/139‑1 (MQ=255) taTCTTAAAAAacagataaagctgtatattaagatacttactacatatctaacgaaaaaaagaagcttactctgccttcctttccagagcagcttctaataaatgttgagcaaattgtttataaaactcatctaagtca > 7:358539‑M2/1‑11 (MQ=255) aaaaaaCAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGTTCCGCTTTGGAAATGTtct > 5:33910/1‑139 (MQ=255) aaaaaCAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGGTCCGCTTTGGAAATGTtctc < 6:22029/139‑1 (MQ=255) aaaaaCAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGGTCCGCTTTGGAAATGTtctc < 2:73724/139‑1 (MQ=255) | AACATGACACAAAAAAGAAAAGGGCCTATACCAGCTCAATTTGAAATAACCCCTATCCTAAGGTTTAATTTCATTTTTGACCTCACAGCCACTAATAGTTTCCACTAAGAAAAGTAGTAAGTATCTTAAAAAACAGATAAAGCTGTATCTCCTGTGAACACAATGGGTGCCACCAAGCTGTTATCTGAAAAGCTGTTTCATCAAGCAAACCGCCACGTCCAAAACAAAGGAACCTTGTTTTGTTCGGTCCGCTTTGGAAATGTTCTC > BS168_reference_genome/2286301‑2286567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |