| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 1,385,573 | C→A | 5.0% | P12P (CCG→CCT) | metE ← | cobalamin‑independent methionine synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 1,385,573 | 0 | C | A | 5.0% | 302.9 / 3.3 | 92 | P12P (CCG→CCT) | metE | cobalamin‑independent methionine synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/44); new base A (2/3); total (45/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
ATCTGCTGGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGCCTCTTTCCCAT > BS168_reference_genome/1385439‑1385700 | aTCTGCTGGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGa > 5:309861/1‑138 (MQ=255) tgctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATc > 3:63236/1‑139 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATcc > 6:2992/1‑138 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATcc > 5:270910/1‑138 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATcc > 3:362213/1‑138 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATcc > 7:333175/1‑138 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATcc > 8:315013/1‑138 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCt < 8:333175/139‑1 (MQ=255) ctgGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATACTCGGAAATcc > 6:260833/1‑138 (MQ=255) ggTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTa > 7:113014/1‑138 (MQ=255) aTTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCg < 4:63236/139‑1 (MQ=255) aTTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCg < 7:156403/139‑1 (MQ=255) tttGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGa < 8:233348/139‑1 (MQ=255) gtTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTAGGAAATCCTAAATTCGATGttt > 3:324970/1‑139 (MQ=255) gtTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCGTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTGCAGTCCGATTCTAGGAAATCCTAAATTCGATGttt > 3:324973/1‑139 (MQ=255) tttACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTGCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTAGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTg < 7:169537/138‑1 (MQ=255) gCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTg > 4:251584/1‑139 (MQ=255) gCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTg > 7:346385/1‑139 (MQ=255) ggATCAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTc < 6:219518/139‑1 (MQ=255) cgctAAAAATAAGTCGGCGCATTTCCTGAAAAAAGGATCTTTTACCAGACCTCCCTTCCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGtt < 2:216613/134‑1 (MQ=255) tAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCAtt < 1:90645/139‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATTTGCTTCAAAATCGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctc < 7:50434/138‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCTATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctcg > 5:49530/1‑138 (MQ=255) gTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTctcc < 5:188574/139‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTAGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTctcc < 4:324970/139‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATTTGCGTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTAGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTctcc < 4:324973/139‑1 (MQ=255) gTTAGTAGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTACAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCTGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctc < 6:213440/138‑1 (MQ=255) cgtcgATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCtcgtcc > 8:304838/1‑139 (MQ=255) tcgATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCtt > 7:180813/1‑139 (MQ=255) cgATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCttt < 6:270910/139‑1 (MQ=255) gATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCttt < 7:1028/138‑1 (MQ=255) gATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAAATCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCttt < 8:347018/138‑1 (MQ=255) cTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGt > 8:40388/1‑138 (MQ=255) cAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTaaa < 4:362213/138‑1 (MQ=255) aaaaaCGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTaaaa < 8:346385/138‑1 (MQ=255) aaaCGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAacac < 5:195927/139‑1 (MQ=255) aaaCGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAacac < 5:2992/139‑1 (MQ=255) aaaCGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAacac < 3:252263/139‑1 (MQ=255) tATC‑TTTATCATTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCTATGTTTTGATTGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACActctct > 8:365135/1‑139 (MQ=255) aTCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAccc > 6:241648/1‑139 (MQ=255) aTCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAccc > 3:171134/1‑139 (MQ=255) aTCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTATCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCTAAGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTACTCCTTTATATGTAAAACACTCACTTACaaca > 6:74402/1‑136 (MQ=255) tCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCcg < 3:197668/139‑1 (MQ=255) tCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCcg < 1:85670/139‑1 (MQ=255) cAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCGTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACAcgc > 1:321275/1‑139 (MQ=255) tACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctc < 4:132639/102‑1 (MQ=255) tACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctc > 3:132639/1‑102 (MQ=255) tACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTtat > 2:149530/1‑111 (MQ=255) tACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTtat < 1:149530/111‑1 (MQ=255) cTGCATTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTTATGGTTGGCTTTGTTTATCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGAGGAt > 1:8914/1‑138 (MQ=255) tGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTAATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATa > 4:53222/1‑138 (MQ=255) ccTTTCCACTACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATAc < 6:23123/137‑1 (MQ=255) ccTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAcc < 6:327558/128‑1 (MQ=255) ccTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAcc > 5:327558/1‑128 (MQ=255) ccTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAg > 2:76168/1‑139 (MQ=255) ccTTTCCAATAAGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATAc < 8:92792/137‑1 (MQ=255) cTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 6:309861/139‑1 (MQ=255) cTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 5:356076/139‑1 (MQ=255) cTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 5:181925/139‑1 (MQ=255) cTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 7:40388/139‑1 (MQ=255) cTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 4:74373/139‑1 (MQ=255) cTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 3:333239/139‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTc > 1:141578/1‑82 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTc < 2:141578/82‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctc > 2:93630/1‑92 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTtctc < 1:93630/92‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTctcct < 6:229283/94‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTctcct > 5:229283/1‑94 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTGTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGgctgc > 1:136757/1‑139 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAcc > 7:78934/1‑123 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAcc < 2:176795/123‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAcc > 1:176795/1‑123 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAcc < 8:78934/123‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCcg > 7:222864/1‑125 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCcg < 8:222864/125‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg > 2:102920/1‑135 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 1:102920/135‑1 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGgctgc > 8:1065/1‑139 (MQ=255) ccAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTATTTCACCCGCGGATACAGgctgc > 3:356519/1‑139 (MQ=255) ttCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAgg < 8:28750/126‑1 (MQ=255) ttCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCAACCGCGGATACAgg > 7:28750/1‑126 (MQ=255) cAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCcg > 2:348231/1‑114 (MQ=255) cAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCcg < 1:348231/114‑1 (MQ=255) tGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTca < 7:1065/139‑1 (MQ=255) cATTCCCGGTTCACTCCGATTCTCCGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACaaaaa < 7:26667/138‑1 (MQ=255) aTTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGc < 3:53222/139‑1 (MQ=255) ttCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGcc > 7:34893/1‑139 (MQ=255) ttCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGACATTGTTTCTCCTCCTTTATATCTAAAACACTCTCTTTCACCAGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTAAATCACAACAAAAAGc > 8:191117/1‑138 (MQ=255) tCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGCct > 6:249095/1‑139 (MQ=255) ttCAGTCCGATTCTCGGAAATCATAAATTCGATGTTTTGATGGGTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTATCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGGTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGCCTCTTTcc < 7:191117/139‑1 (MQ=255) tCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGCCTCTTTCCCAt > 7:225173/1‑137 (MQ=255) tCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGCCTCTTTCCCAt > 3:339814/1‑137 (MQ=255) | ATCTGCTGGTCAATTTGTGTTTTTACTGCGGATAAAAATAGTTCGTCGATTTGCTTCAAAAACGTATC‑TTTATCAGTACTGCCTTTCCAATACGCTTCAAGTGCTTTTTTCCATTCCCGGTTCAGTCCGATTCTCGGAAATCCTAAATTCGATGTTTTGATGGTTGTCATTGTTTCTCCTCCTTTATATGTAAAACACTCTCTTTCACCCGCGGATACAGGCTGCTAAGAGGTTTTCTCACAACAAAAAGCCTCTTTCCCAT > BS168_reference_genome/1385439‑1385700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |