| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 2,382,177 | G→A | 6.6% | N263N (AAC→AAT) | hepT ← | heptaprenyl diphosphate synthase component II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 2,382,177 | 0 | G | A | 6.6% | 249.7 / 5.1 | 75 | N263N (AAC→AAT) | hepT | heptaprenyl diphosphate synthase component II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base A (3/2); total (38/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 | |||||||||||
GATGCTTCAATTGCATCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTATGAATCT > BS168_reference_genome/2382040‑2382310 | gATGCTTCTATTGCAGCTGTTTTTATGATTTCTTCTATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGGACTGGCAATGTGACGt < 4:179351/139‑1 (MQ=255)gATGCTTCAATTGCATCTGTTTTTTTTATTTCTTCAATGATTTGTTCAAGCTGTTCCAGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTGAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCTCTGGCAATGTGACGt < 6:16232/139‑1 (MQ=255) gCTTCAATTGCATCCGTTTTTTTGATTTCCTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCGCTGTTAATCAATTTAAGCTGATTCTTTAATGCTGGATTTTCCAGAGCATACAGCACTGGCAATGTGACAttcc > 5:70707/1‑137 (MQ=255) cTTCAATTGCATCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTcc > 3:119232/1‑139 (MQ=255) ttCAATTGCATCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCt > 7:18564/1‑139 (MQ=255) ttCAATTGCATCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTGTCCt > 4:257519/1‑139 (MQ=255) tccgTTTTTTTGATTTCCTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCGCTGTTAATCAATTTAAGCTGATTCTTTAATGCTGGATTTTCCAGAGCATACAGCACTGGCAATGTGAAATTCCCTTGAAGCaaa > 3:168134/4‑138 (MQ=255) tCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTATTGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCaaa > 1:281330/1‑138 (MQ=255) tCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAAt > 4:97182/1‑139 (MQ=255) tttttttGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAAtct < 2:251914/137‑1 (MQ=255) tGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTa < 4:368675/138‑1 (MQ=255) tcttcAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGt < 3:97182/138‑1 (MQ=255) aaTGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTAccc < 8:298421/139‑1 (MQ=255) tGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTa < 6:239728/126‑1 (MQ=255) tGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTa > 5:239728/1‑126 (MQ=255) ggTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCGCTGTTAATCAATTTAAGCTGATTCTTTAATGCTGGATTTTCCAGAGCATACAGCACTGGCAATGTGACATTCCCTTGAAGCAAATCTCCTCCAACGGGTTTGCCCAGCTCtt > 4:339433/1‑139 (MQ=255) gCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGt > 5:198269/1‑139 (MQ=255) ttCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTg > 5:357254/1‑137 (MQ=255) tCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGatg > 6:171568/1‑137 (MQ=255) tCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAg > 3:147217/1‑139 (MQ=255) tCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAg > 3:228460/1‑139 (MQ=255) ccTGCGTTGTCTCGCTGTTAATCAATTTAAGCTGATTCTTTAATGCTGGATTTTCCAGAGCATACAGCACTGGCAATGTGACATTCCCTTGAAGCAAATCTCCTCCAACGGGTTTGCCCAGCTCTTCTTCAGTTGAAg < 3:339433/138‑1 (MQ=255) gTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGATGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCACTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCa > 7:324428/1‑138 (MQ=255) gTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATc > 4:91108/1‑137 (MQ=255) gTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATc > 3:181292/1‑137 (MQ=255) aaTCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAatat < 4:342167/134‑1 (MQ=255) aaTCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCATCAGTTGAAGTAAAATCAAGAatat > 3:342167/1‑134 (MQ=255) tCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCaat < 8:76623/139‑1 (MQ=255) tCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCaat < 6:198269/139‑1 (MQ=255) aTTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCaataat < 5:232262/139‑1 (MQ=255) tttAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTTCGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATc > 2:331023/1‑139 (MQ=255) tttAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGt < 2:341484/88‑1 (MQ=255) tttAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGt > 1:341484/1‑88 (MQ=255) tttAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCaataat > 6:124698/1‑138 (MQ=255) tttAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCaataat < 5:124698/138‑1 (MQ=255) tttAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATc > 1:194004/1‑139 (MQ=255) ttttttAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGAc > 2:249524/1‑138 (MQ=255) ttttttAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACa > 8:172828/1‑139 (MQ=255) ttttttAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACa > 8:348067/1‑139 (MQ=255) ttACTGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCACATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGCAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGc < 6:178582/138‑1 (MQ=255) tAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGcc < 8:324428/138‑1 (MQ=255) aaTGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCg < 4:147217/138‑1 (MQ=255) gCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGa < 6:327367/123‑1 (MQ=255) gCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGa > 5:327367/1‑123 (MQ=255) gATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTCAAGTAAAAACAAGAATATCATCAATAATATGATAAGACAAGCCGACGTAATa > 1:272311/1‑139 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 5:54170/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 5:73666/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 1:249524/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 7:172828/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 4:190172/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 8:18564/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 7:198847/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAAAATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 6:335001/139‑1 (MQ=255) tttcCAGAGCATACAGCACTGGCAATGTGACATTCCCTTGAAGCAAATCTCCTCCAACGGGTTTGCCCAGCTCTTCTTCAGTTGAAGTAAAATCAAGGATATCATCAATGATTTGATAAGACATGCCGACGTAATAcc < 4:168134/138‑1 (MQ=255) ttCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCa < 8:39748/138‑1 (MQ=255) cAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCaaa < 4:181292/138‑1 (MQ=255) aGGGCATACATCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAAc < 2:337298/138‑1 (MQ=255) aGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAAc < 7:348067/138‑1 (MQ=255) aGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAAc < 7:237425/138‑1 (MQ=255) ggCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAAc < 6:165520/136‑1 (MQ=255) ggCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAAc > 5:165520/1‑136 (MQ=255) cAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAAt < 1:331023/139‑1 (MQ=255) aCTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCt > 6:99402/1‑139 (MQ=255) tGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACa < 1:184019/131‑1 (MQ=255) tGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACa > 2:184019/1‑131 (MQ=255) tGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTa > 2:283200/1‑139 (MQ=255) gCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTAt > 6:94846/1‑138 (MQ=255) aTGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTATGAAt > 5:117757/1‑139 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGa < 6:242741/72‑1 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGa > 5:242741/1‑72 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAAt > 6:43125/1‑126 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAAt < 5:43125/126‑1 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTATGAAtct > 7:204553/1‑139 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTATGAAtct > 2:36755/1‑139 (MQ=255) gtgACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATATGAAAAGACATGACGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGACTTATGAAtct > 1:47255/1‑139 (MQ=255) | GATGCTTCAATTGCATCTGTTTTTTTGATTTCTTCAATGATTGGTTCAAGCTGTTCCTGCGTTGTCTCACTGTTAATCAATTTAAGCTGGTTTTTTAATGCAGGATTTTTCAGGGCATACAGCACTGGCAATGTGACGTTTCCTTGAAGCAAATCTCCTCCTACGGGTTTACCCAGCTCTTCCTCAGTTGAAGTAAAATCAAGAATATCATCAATAATCTGATAAGACATGCCGACGTAATACCCAAACCAGTACAATGCCTTATGAATCT > BS168_reference_genome/2382040‑2382310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |