Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 3,835,011 | T→A | 7.3% | I90F (ATC→TTC) | U712_19780 ← | ATP‑dependent RNA helicase dbpA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 3,835,011 | 0 | T | A | 7.3% | 195.8 / 6.8 | 69 | I90F (ATC→TTC) | U712_19780 | ATP‑dependent RNA helicase dbpA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/30); new base A (2/3); total (36/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.02e-01 |
GATATGATCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCCTGTCTGTGATTT > CP006881/3834874‑3835146 | gATATGATCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGat < 5:65748/138‑1 (MQ=255) atatGATCCCGAACACGGCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGatat < 8:258704/139‑1 (MQ=255) atatGATCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGatat < 7:180301/139‑1 (MQ=255) atatGATCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGatat < 5:87168/139‑1 (MQ=255) tatGATCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATc < 8:78176/139‑1 (MQ=255) atGATCCAGATCAGGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATc < 6:259407/138‑1 (MQ=255) aTCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTcc < 5:240222/139‑1 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGGCAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCAc > 2:286254/1‑139 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTTATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATGTTACTTTACTTGCAc > 6:376504/1‑139 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCAc > 8:96483/1‑139 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCAc > 8:79108/1‑139 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCAc > 1:33375/1‑139 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCATTACATGCAc > 1:100624/1‑139 (MQ=255) gTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATAAAATGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTTTTACGTTTAAATCGTCCGATGTTAGTGTTATGTTACTTTAAtttgac > 5:357655/1‑135 (MQ=255) ccGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTTATCCCTTTAAATCGTCCGATTTTAGTGATATATTCCTTTACTTTCAc > 4:140889/1‑136 (MQ=255) ccGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTGGTGTTATGTTCCTTTACTTGCAc > 3:34878/1‑136 (MQ=255) ccGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCAc > 4:303107/1‑136 (MQ=255) ccGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCAc < 3:23485/136‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATACGTTTAAATAGTCCGATGTTAGTGATATCTTACTTTACTTTCAc > 4:23485/1‑136 (MQ=255) ggCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGTATGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCTTCCGATGTTAGTGATATATTCCTTTAATTTACCCGCaa > 8:184612/1‑139 (MQ=255) ggCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGc > 7:19250/1‑132 (MQ=255) ggCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGc > 7:12953/1‑132 (MQ=255) 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caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACg < 4:258068/136‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 5:376504/139‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 1:286254/139‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 6:167892/139‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 8:343457/139‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 7:373922/139‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 1:129285/139‑1 (MQ=255) caacaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 1:70461/139‑1 (MQ=255) acaaTGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCg < 6:129603/139‑1 (MQ=255) tgtgGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCTAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGgtgt < 1:75130/139‑1 (MQ=255) tgtgGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCCCCGCAAGCTCACGGGTCGgtgt > 5:176574/1‑139 (MQ=255) tgtgGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 7:29130/133‑1 (MQ=255) tgtgGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt > 8:29130/1‑133 (MQ=255) ttttGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTACTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGGGGGTGTTAAAATa > 1:100606/1‑138 (MQ=255) ttGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAgc > 7:43687/1‑139 (MQ=255) aGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCg < 3:140889/134‑1 (MQ=255) gCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt < 7:23378/110‑1 (MQ=255) gCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGt > 8:23378/1‑110 (MQ=255) tttGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGt < 3:212359/135‑1 (MQ=255) ttGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGTCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATAGTACGCTGTTCGTTATATAGTACTTTACATTCACCCCAAGCTAACGGGTCGGTTTTAAAATAATCGCCTGAGGCTAGttttgc > 6:41489/1‑137 (MQ=255) tGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCAt > 1:269511/1‑139 (MQ=255) aTCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCaa > 8:88526/1‑139 (MQ=255) aaGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCg < 7:96483/139‑1 (MQ=255) cggaTTTTCCAAATACGGAGGGCGCTTTGATCCGTTTAAAGCGGCCGATGTTCGTGATCACTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGGGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAg < 6:225661/138‑1 (MQ=255) gaTTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCAGCCCAATTCGCCAGcg > 5:190419/1‑138 (MQ=255) ttttCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTca < 7:79108/139‑1 (MQ=255) tCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTca > 1:34598/1‑136 (MQ=255) tCCAAATACGGCTGGCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCATTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTcaca < 7:184612/138‑1 (MQ=255) cccAAAAAGGGCGGCCGCTTTTACCCGTTAAAATCGTCCGAGTTGCGTTAACTCTACCTTAACTTCCCCCGCATGCGCCGGGGGCGGTGTAAAAATACGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTcaca < 2:216332/137‑1 (MQ=255) aaTACGGCTGTCGCTTTGAACCGTTTAAAACGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTAAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACagagag < 6:329888/139‑1 (MQ=255) aTACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACagagag > 8:170865/1‑138 (MQ=255) aTACCGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCATACATTACTTTCACCGCAAGATCAAGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTAATACCAAATCGCCAGCTCACagagag > 2:81583/1‑138 (MQ=255) tttAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTc > 7:8238/1‑139 (MQ=255) tttAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTc > 1:345915/1‑139 (MQ=255) aaaTCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTc > 3:428697/1‑136 (MQ=255) aTCGTCCGAGGTTGGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCt < 8:414163/139‑1 (MQ=255) cGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGc < 4:428697/136‑1 (MQ=255) tCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGTATTGTTTTCATCCCAATTCGCCATCTCACAGAGAGGAATACCGAACGAAGCCGGTTTCCCGCTTc > 7:297317/1‑137 (MQ=255) tCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCct > 6:59151/1‑139 (MQ=255) gATGTTCGTGATATCTTCATTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGACCGAAGCCGTGTTCCCGCTTCct > 4:66774/1‑136 (MQ=255) aTGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCctg > 3:345176/1‑136 (MQ=255) cGTGAAATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCctgtctgt < 1:3519/136‑1 (MQ=255) cGTGAAATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCctgtctgt > 2:3519/1‑136 (MQ=255) cGTGAAATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCctgtctgt < 1:10268/136‑1 (MQ=255) cGTGAAATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCctgtctgt > 2:10268/1‑136 (MQ=255) tatCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCCTGTCTGTGAttt < 3:98972/136‑1 (MQ=255) | GATATGATCCAGAACACGTCCCGGCGTGCCGACAACAATGTGGCTTTTTTGCTTAAGCTCAGCTTTTTGTTTATCAAAGGAGGATTTTCCAAATACGGCTGTCGCTTTGATCCGTTTAAATCGTCCGATGTTCGTGATATCTTCCTTTACTTGCACCGCAAGCTCACGGGTCGGTGTTAAAATAAGCGCCTGCGGCTTGTTTTCATCCCAATTCGCCAGCTCACAGAGAGGAATCCCGAACGAAGCCGTTTTCCCGCTTCCTGTCTGTGATTT > CP006881/3834874‑3835146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |