| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 3,718,298 | C→A | 5.3% | G16W (GGG→TGG) | U712_19165 ← | Uncharacterized protein ywdD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 3,718,298 | 0 | C | A | 5.3% | 257.4 / 3.9 | 75 | G16W (GGG→TGG) | U712_19165 | Uncharacterized protein ywdD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/36); new base A (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
GGTGTTCCAAACGCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGCCCTCGTC > CP006881/3718168‑3718434 | ggTGTTCAAAACGCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTa < 3:290757/135‑1 (MQ=255) ttCCAAACGCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAGGCCCGCt > 6:393476/1‑139 (MQ=255) cAAACGCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCt > 4:148235/1‑136 (MQ=255) aCGCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCtttt < 4:51609/136‑1 (MQ=255) gCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGAttt > 1:37639/1‑139 (MQ=255) cAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGa < 7:113054/138‑1 (MQ=255) aTAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATAc < 7:350133/139‑1 (MQ=255) tAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACa < 6:82001/139‑1 (MQ=255) gTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATg < 6:365681/139‑1 (MQ=255) cTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATc > 5:371158/1‑139 (MQ=255) cTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCGCTTCTATCATCGCCTCCCCCTCAGGAAGCCCTTTACGCCCGCTGGTGATTTAGGATACATATGTTGCTTTTTc > 2:321951/1‑139 (MQ=255) ttCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATc > 1:295221/1‑138 (MQ=255) cctcctCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCCCCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCGTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATc > 3:123027/1‑136 (MQ=255) tcctcACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCTGATACATATGTTTCTTTATCCAttt > 2:141412/1‑139 (MQ=255) tcctcACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCAttt > 2:398607/1‑139 (MQ=255) aCTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGACACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTc < 6:152669/138‑1 (MQ=255) ctctTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCg < 5:393476/139‑1 (MQ=255) ttccttccTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCGTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTc > 5:28923/1‑138 (MQ=255) tccttcctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTc < 2:23590/137‑1 (MQ=255) tccttcctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTc < 6:179450/137‑1 (MQ=255) gcttcctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCACAGGAAGCCCTATAAGCCAGCTTTTGATTTCGGATACATATGATTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCa < 2:20406/137‑1 (MQ=255) ccttcctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCt < 3:407570/135‑1 (MQ=255) ttcctGAAAAGAGCGAAACAGAAGAAGTTCAAAATGGCTCTCAATCTCATCAAACAACGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTAAAGCCCGCGTTTGATATCGGATACATATGTTTCTTTATCCATATTGACCGCTCCa > 4:139329/1‑136 (MQ=255) tcctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACtt > 1:290144/1‑138 (MQ=255) cctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCa < 3:139329/134‑1 (MQ=255) cctGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACtt < 1:141412/137‑1 (MQ=255) ccagAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACtt < 1:398607/134‑1 (MQ=255) aaaaGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCATTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCt > 3:137367/1‑127 (MQ=255) aaaaGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCATTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCt < 4:137367/127‑1 (MQ=255) aaaGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGt < 3:157558/136‑1 (MQ=255) aaaGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTAtt < 8:262109/139‑1 (MQ=255) cGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGACGCCCTATAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCTCTCAACTTCAGTATTCGGTc > 1:353972/1‑138 (MQ=255) atgatgTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGc > 5:427874/1‑139 (MQ=255) gTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGaa > 5:246542/1‑138 (MQ=255) cAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAAt < 6:246542/138‑1 (MQ=255) atatGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCa < 6:265066/105‑1 (MQ=255) atatGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCa > 5:265066/1‑105 (MQ=255) atatGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAAt < 3:148235/136‑1 (MQ=255) ggCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTc > 7:301060/1‑138 (MQ=255) gCTCTCCATCTCTTCTATCCTCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTACGCCCGCTTATGAGTTCGGATACATATGTTTCTTACTCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCt < 6:289388/136‑1 (MQ=255) ctctCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATg < 1:161101/73‑1 (MQ=255) ctctCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATg > 2:161101/1‑73 (MQ=255) ctctCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCTGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCAt > 1:377332/1‑139 (MQ=255) ctctCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCAt > 5:384317/1‑139 (MQ=255) ctctCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTGTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCAATCATTGCTGAAAATACGCTCCAt > 5:16695/1‑139 (MQ=255) ctctCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTGTTGATTTCGGATAAATATGTTTCTTTATACATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCAt > 7:317990/1‑139 (MQ=255) tctcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCtttt > 4:305326/1‑55 (MQ=255) tctcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCtttt < 3:305326/55‑1 (MQ=255) ctcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCa > 3:94477/1‑136 (MQ=255) tcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTc < 5:201105/111‑1 (MQ=255) tcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTc > 6:201105/1‑111 (MQ=255) tcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCAt > 3:119157/1‑136 (MQ=255) tcAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTcc > 6:216456/1‑139 (MQ=255) aaTCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTa > 8:373759/1‑76 (MQ=255) aaTCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTa < 7:373759/76‑1 (MQ=255) aaTCTCTTCTATCATCGCCTCACACTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTATTATTTCTGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATCCGCTCCATTCCt > 1:420734/1‑138 (MQ=255) cttctATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCATTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAAt > 8:222159/1‑120 (MQ=255) cttctATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCATTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAAt < 7:222159/120‑1 (MQ=255) ctATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTg < 3:202626/135‑1 (MQ=255) ctATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGc > 4:397883/1‑136 (MQ=255) tATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCg > 3:261790/1‑136 (MQ=255) atcatcGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTcc < 6:384317/139‑1 (MQ=255) tcatcGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTcc < 5:66429/138‑1 (MQ=255) gCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAg > 8:380478/1‑138 (MQ=255) gCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGc > 6:16114/1‑139 (MQ=255) ccTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCa < 3:123078/136‑1 (MQ=255) ccTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCa < 7:187133/139‑1 (MQ=255) ccTCACCCTCAGGAAGCCCCTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGGTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTAATCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCa < 1:381615/139‑1 (MQ=255) tCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGc > 3:309684/1‑136 (MQ=255) aCCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACg > 2:394701/1‑107 (MQ=255) aCCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACg < 1:394701/107‑1 (MQ=255) aGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCTGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGcc < 2:377332/139‑1 (MQ=255) aGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGcc < 6:240098/139‑1 (MQ=255) gAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGCCCt < 8:301060/139‑1 (MQ=255) gAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGCCCt < 5:163005/139‑1 (MQ=255) cccTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCTGTCCATCATGTCTGAAAATACGCTCCATACCTACGTGCGTTCCGCCAGCACTGCTTTGCCCTctgc > 8:151967/1‑136 (MQ=255) cccTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAg > 2:263555/1‑121 (MQ=255) cccTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAg < 1:263555/121‑1 (MQ=255) cccTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGCCCTCGTc > 8:132560/1‑139 (MQ=255) cccTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGCCCTCGTc > 5:141921/1‑139 (MQ=255) | GGTGTTCCAAACGCCTGCAATAAAGTCTGCATAGCTTCCTCCTCACTCTTTCCTTCCTGAAAAGAGCGAAACAGATGATGTTCAATATGGCTCTCAATCTCTTCTATCATCGCCTCACCCTCAGGAAGCCCTTTAAGCCCGCTTTTGATTTCGGATACATATGTTTCTTTATCCATTTTGTCCGCTCCACTTCAGTATTCGGTCCATCATGGCTGAAAATACGCTCCATTCCTTCGTGCGTTCCGCCAGCACTTCTTTGCCCTCGTC > CP006881/3718168‑3718434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |