| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 679,931 | A→G | 5.5% | L487L (CTT→CTC) | U712_03330 ← | putative membrane protein yerD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 679,931 | 0 | A | G | 5.5% | 230.4 / 3.4 | 73 | L487L (CTT→CTC) | U712_03330 | putative membrane protein yerD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/31); new base G (2/2); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
CGTCTGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTGGTGTGGCAGACGAG > CP006881/679793‑680068 | cggccggCAAGGGCTGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGGAGGCGATATTGAGGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCa < 7:335173/134‑1 (MQ=255)cGTCTGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCa < 8:226106/139‑1 (MQ=255)cGTCTGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCa < 6:119552/139‑1 (MQ=255) cTGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg < 7:67543/139‑1 (MQ=255) tGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCGAGGt > 7:112987/1‑139 (MQ=255) tGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCGAGGt > 7:107757/1‑139 (MQ=255) aGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGCCAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTaaa > 8:363393/1‑138 (MQ=255) aGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTaaa > 3:113281/1‑138 (MQ=255) aGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTaaa > 3:245459/1‑138 (MQ=255) ggCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg < 1:4817/131‑1 (MQ=255) ggCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg > 2:4817/1‑131 (MQ=255) tttCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTccc > 7:160576/1‑138 (MQ=255) tttCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCt > 1:194319/1‑139 (MQ=255) tttCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCt > 2:248219/1‑139 (MQ=255) tttCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGAAAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCt > 1:118963/1‑139 (MQ=255) cTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTcg < 3:1725/138‑1 (MQ=255) cTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGAAATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTcg < 7:69076/138‑1 (MQ=255) aTGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCa < 2:133871/138‑1 (MQ=255) tGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCaa < 1:248219/138‑1 (MQ=255) aaaCAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCCAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATg > 8:97335/1‑138 (MQ=255) cAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAATTAAAGCGGCGATTTAATCCATGCTGGGGATGCAAGTTTAATTGTTCCAGCGCGCATTGaaa > 6:181078/1‑138 (MQ=255) tCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTg > 4:262566/1‑137 (MQ=255) aGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGa < 8:160576/139‑1 (MQ=255) gATATTGATGATACTGCGATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGGAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGc < 2:241226/139‑1 (MQ=255) ttGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGtt > 5:45425/1‑139 (MQ=255) gatgatACTGCCATCCTCTTTCCTATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATTAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGttt < 4:245459/138‑1 (MQ=255) aCTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTc > 3:239194/1‑138 (MQ=255) aCTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTc > 5:332423/1‑138 (MQ=255) tGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGCCACGATGCTGTTTTTCCTCAAc > 5:284076/1‑139 (MQ=255) tGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAAc > 5:161858/1‑139 (MQ=255) tGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAAc > 7:180069/1‑139 (MQ=255) ccATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGc > 1:311809/1‑139 (MQ=255) tCCTCTTTCCGATAGACAAGATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATACCTTCTGCGGCTTCAAGGTTAAATAGTCCCTCGAGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATTCTGTTTTTCCTCAACGCTCa < 1:32837/139‑1 (MQ=255) tCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGTAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCt > 1:201130/1‑137 (MQ=255) tttCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCt > 4:180114/1‑139 (MQ=255) tCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg > 1:50686/1‑65 (MQ=255) tCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg < 2:50686/65‑1 (MQ=255) tCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCttt > 5:222960/1‑139 (MQ=255) gATAGACAAGATGCTCCTTTGAAAACTGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCGGCAAGGTTTAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAAAGTTGTTGCAGACACGAAGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTg < 6:79684/139‑1 (MQ=255) gATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTg < 2:311809/139‑1 (MQ=255) gATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTg > 2:294181/1‑139 (MQ=255) tAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg > 8:208016/1‑60 (MQ=255) tAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAgg < 7:208016/60‑1 (MQ=255) acaacaTGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCCAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTATGCAAtt > 5:79684/1‑139 (MQ=255) aacaTGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCa > 4:58385/1‑52 (MQ=255) aacaTGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCa < 3:58385/52‑1 (MQ=255) caTGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTATTGCAATTTCg > 4:279802/1‑138 (MQ=255) caTGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGGTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTATTGCAATTTCg > 3:342879/1‑138 (MQ=255) cTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtc < 6:161858/139‑1 (MQ=255) cTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtc < 3:262566/139‑1 (MQ=255) cTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgt < 8:102557/138‑1 (MQ=255) cTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgt < 4:132043/138‑1 (MQ=255) cTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgt < 6:190073/138‑1 (MQ=255) cTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgt < 2:155097/138‑1 (MQ=255) ttGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtcg > 2:107276/1‑139 (MQ=255) ttGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtcg > 7:274068/1‑139 (MQ=255) tGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtcgt > 5:147042/1‑139 (MQ=255) ggAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtcgtc > 3:209929/1‑139 (MQ=255) ggAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTgtcgtc > 6:60673/1‑139 (MQ=255) aacgAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGGTAAATCGTCCCGCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCACCGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGAGCTGTCGTCGCcac < 6:94620/136‑1 (MQ=255) aaTGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTACTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCcac < 6:332423/139‑1 (MQ=255) tGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCacac > 3:178753/1‑139 (MQ=255) tGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCacac > 5:186862/1‑139 (MQ=255) aaTCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCGAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACAcc < 8:107757/138‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCGAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACAcc < 8:112987/138‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACAcc < 5:104091/138‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACAcc < 7:108349/138‑1 (MQ=255) cGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGa < 8:274068/139‑1 (MQ=255) gAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTGGTCGCCACACCTGCCGGAc < 2:118963/139‑1 (MQ=255) gAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCGTTTTGCAATTTCGGATCTGGCGTCGCCACACCTGCCGGAc < 6:284076/139‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATATTCCCTCGCGCAATGATATAACTTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCATCGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATATGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTgg < 4:342879/139‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTgg < 6:186862/139‑1 (MQ=255) tgctgcGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTGgtg > 6:356117/1‑139 (MQ=255) gctgcGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTGgtgt > 5:346143/1‑139 (MQ=255) gctgcGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTGgtgt > 3:360970/1‑139 (MQ=255) gCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGttt < 7:146544/59‑1 (MQ=255) gCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGttt > 8:146544/1‑59 (MQ=255) cAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTGGTGTGGCAGACgag < 4:209929/139‑1 (MQ=255) | CGTCTGGCAAGGGCGGTTTCTTTATGAAACAAATTGATGGATCAGGTTGTCGATATTGATGATACTGCCATCCTCTTTCCGATAGACAACATGCTCCTTGGAAAAATGAATCGGCGAATTAATCCCTGCTGCGGCTGCAAGGTTAAATAGTCCCTCGCGCAATGAAATAACGTAGTTGCAGACACGATGCTGTTTTTCCTCAACGCTCAGTGCTTTTTGCAATTTCGGATCTGTCGTCGCCACACCTGCCGGACAGGTGTTGGTGTGGCAGACGAG > CP006881/679793‑680068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |