| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 1,634,454 | T→G | 15.5% | N79T (AAC→ACC) | U712_08390 ← | Uncharacterized protein ylqB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 1,634,454 | 0 | T | G | 15.5% | 121.1 / 5.0 | 71 | N79T (AAC→ACC) | U712_08390 | Uncharacterized protein ylqB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/42); new base G (7/5); total (24/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.03e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATGTGTAATACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTTGTGATTGAG > CP006881/1634316‑1634588 | gATGTGTAATACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑Gt > 5:63133/1‑139 (MQ=255) aTGTGTAATACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑Gtt > 8:89837/1‑139 (MQ=255) tAATACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGACCCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCa < 7:181755/139‑1 (MQ=255) tAATACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCa > 8:286973/1‑139 (MQ=255) tACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGTATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTg > 5:108610/1‑139 (MQ=255) cGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAGCCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGTAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAATTCTTACGGGCGCTGTTTggacaggg > 1:199692/1‑133 (MQ=255) ataGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCCCTGGCTGt > 1:99957/1‑139 (MQ=255) ataGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGt > 7:364315/1‑139 (MQ=255) ataGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGt > 5:332501/1‑139 (MQ=255) ataGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCAATGGCTGt > 8:278816/1‑139 (MQ=255) ataGTAACCAGCAGCTGGCCACAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCAGCAGGCGTTCCTGACGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCAGCTTCAACTCTTACGGGCGC‑GTGTGGGACTGGCGGt > 6:250666/1‑139 (MQ=255) aGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGCCCTTCGTGTACGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGGACAGGGTGGcc > 1:116236/1‑139 (MQ=255) aaCCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGtt > 3:174934/1‑139 (MQ=255) aCCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑Gtt < 2:225531/120‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑Gtt > 1:225531/1‑120 (MQ=255) aCCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGGCCTGGGTGTCCGttt > 2:200912/1‑139 (MQ=255) aCCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGttt > 4:147456/1‑139 (MQ=255) aCCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGCACTGGCGGTCCGttt > 6:80808/1‑139 (MQ=255) agcagcTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGCCCTTCGTGTCGGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGCCGTGGCGGTGGGGTTTgg > 2:317077/1‑139 (MQ=255) agcagcTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTgg > 3:86049/1‑139 (MQ=255) cagcTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTc > 7:94549/1‑139 (MQ=255) agcTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGGACAGGCGGTGCGGTTTGGtgg > 8:332622/1‑137 (MQ=255) cTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAg > 5:273777/1‑139 (MQ=255) aTACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCg < 8:364315/139‑1 (MQ=255) cATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCt < 3:178814/138‑1 (MQ=255) cATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCt < 7:89837/138‑1 (MQ=255) aTTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTa < 6:273777/139‑1 (MQ=255) aTTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTa < 3:221904/139‑1 (MQ=255) aTTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTa < 3:201105/139‑1 (MQ=255) ttGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGGACTGGCTGTCCGGTTTGGTCGAGGAATTTTACGCTTAc > 8:92254/1‑139 (MQ=255) ttGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTg > 6:331034/1‑109 (MQ=255) ttGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTg < 5:331034/109‑1 (MQ=255) gAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTg < 7:92254/138‑1 (MQ=255) aCCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTaa < 4:343055/139‑1 (MQ=255) cTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAata < 8:194883/139‑1 (MQ=255) cTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAata < 7:286973/139‑1 (MQ=255) cGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGa < 3:14670/138‑1 (MQ=255) cGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGa < 4:296061/138‑1 (MQ=255) cGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGa < 4:174934/138‑1 (MQ=255) cGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGa < 3:147456/138‑1 (MQ=255) cGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGa < 7:150857/138‑1 (MQ=255) gTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACt < 8:266825/139‑1 (MQ=255) gCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGc < 4:86049/138‑1 (MQ=255) gCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGc < 3:142181/138‑1 (MQ=255) gCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGc < 7:309321/138‑1 (MQ=255) gCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGc < 7:278816/138‑1 (MQ=255) ttCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGAcc < 6:108610/139‑1 (MQ=255) ttCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCACTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCGGTGCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCGTACTGTAATTTTTTAATTGACTCGCCAATAtttaa > 4:147581/1‑135 (MQ=255) cTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCtt < 5:103678/138‑1 (MQ=255) aaGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTc < 6:332501/138‑1 (MQ=255) gtttgtttTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCTATATTGACCTTGTCCGTAAt < 1:269599/139‑1 (MQ=255) gTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAAt < 7:137832/139‑1 (MQ=255) tgtgttgtgtTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGGACTGGCGGTCCGGTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCGTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAAAATTTACCTTGTGCGGTATTgt > 8:78517/1‑138 (MQ=255) tgttgtgttTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTCGGCGAGTAATTTGCCTCTACCTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTACGTAATTGAtt < 2:199692/139‑1 (MQ=255) ttgtgttTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGAttt < 1:200912/138‑1 (MQ=255) gtgttTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGGCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTa < 1:317077/138‑1 (MQ=255) tgttTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTAcc < 3:242706/139‑1 (MQ=255) tgttTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGCACTGGCTGTCCGGTTTGGTCGAGGTATTTTCCGCTTTATGTAATATTTTACTTGACTCGCCAATATTTACCTTGTCCGTAATTGATTTTaac > 8:326889/1‑137 (MQ=255) tgttTCCGACCTTCGTGTCCGATTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGGCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTAcc < 6:15189/139‑1 (MQ=255) tgttTCCGACCTTCGTGGCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAAATTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTAcc < 3:359428/139‑1 (MQ=255) gttTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTGTGGCACTGGCTGTCCGTTGTGCTAGAGTAAATTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTAcc < 7:245033/138‑1 (MQ=255) tCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGta < 4:19643/138‑1 (MQ=255) ccGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGtat < 7:326889/138‑1 (MQ=255) ccGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGtat < 6:63133/138‑1 (MQ=255) ccGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGtat < 3:350672/138‑1 (MQ=255) ccGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGtat < 5:196974/138‑1 (MQ=255) ccTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATAcccc < 8:94549/139‑1 (MQ=255) ccTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GGTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATAcccc < 3:141282/139‑1 (MQ=255) aCGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTtg < 6:138346/136‑1 (MQ=255) aCGGGCGC‑GGTTGGGACTGGCTGGCCGTTTTGGTGGCGTAATTTTGCGCTTACTGTAATATTGTACTTGGCTCGCCCATATTTACATTGTACCGATATGATTTTGACGGATTCACCACCAGCATTGGTGCTATTTGTGa > 8:237915/1‑139 (MQ=255) cgc‑gTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTTGTGATTGAg < 5:80808/139‑1 (MQ=255) cgc‑gTTTGGCACTGGCTGTCCGGTTTGGTCCCGTAATTTGCCGCTTACTGGAAAATTGTACATGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTTGTGATTGAg < 8:22763/139‑1 (MQ=255) cgc‑gGTTTGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTTGTGATTGAg < 2:116236/139‑1 (MQ=255) cgc‑gGTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTTGTGATCGAg < 5:250666/139‑1 (MQ=255) cgc‑gGTTGGCACTGGCTGTCCGTCATGGGCGAGTAATTAGCCCCTTACAGCAATCTTCAACTTGCCTCGCCAATCTAGACCTTGTCCGAAAATGATTTGCCCGTATACCCCTCCCTCTGTGCTCATAGTTGTGATTGAg < 2:312491/139‑1 (MQ=255) | GATGTGTAATACGTATAGTAACCAGCAGCTGGCCCCAAATACATTGGAACCTCAAATGTTCCGTTTGCATCAGTCGTTCCTGAAGCAGTTTGTGTTGTGTTTCCGACCTTCGTGTCCGCTTCAAATCTTACGGGCGC‑GTTTGGCACTGGCTGTCCGTTTTGGTCGAGTAATTTGCCGCTTACTGTAATATTGTACTTGACTCGCCAATATTGACCTTGTCCGTAATTGATTTTACCGTATACCCCTCCATCTGTGCTGATATTTGTGATTGAG > CP006881/1634316‑1634588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |