| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,543,140 | C→A | 6.0% | S95I (AGT→ATT) | U712_13060 ← | putative tautomerase yrdN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,543,140 | 0 | C | A | 6.0% | 254.6 / 3.6 | 77 | S95I (AGT→ATT) | U712_13060 | putative tautomerase yrdN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/44); new base A (3/2); total (31/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATTATCATTTTCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGCCTCTACTAC > CP006881/2543021‑2543276 | cATTATCATTTTCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGAGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCTGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGaacaa > 8:220606/1‑138 (MQ=255) tATCATTTTCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGaacaac > 7:21587/1‑136 (MQ=255) ttttCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGAtttt < 6:46970/139‑1 (MQ=255) ttCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGAtttt > 3:154773/1‑137 (MQ=255) ttCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTa > 2:239724/1‑139 (MQ=255) ttCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTa > 4:130566/1‑139 (MQ=255) aacaaTAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGtt < 8:174520/139‑1 (MQ=255) aacaaTAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGtt < 5:181039/139‑1 (MQ=255) aacaaTAGATACAATTAAATCAGTTGAAGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTTTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGt < 3:58790/138‑1 (MQ=255) tAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGtt < 1:286827/139‑1 (MQ=255) aGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTGTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTa < 8:102760/139‑1 (MQ=255) gATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTa < 8:225034/138‑1 (MQ=255) aCAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATc > 2:20400/1‑139 (MQ=255) aCAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTAATTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATc > 3:90332/1‑139 (MQ=255) aCAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTAATTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATc > 3:85163/1‑139 (MQ=255) cAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATcc < 3:82464/139‑1 (MQ=255) cAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGAATCCAGTCTTTCAGCTAACATCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATcc < 6:366700/139‑1 (MQ=255) aaTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGtt < 7:99997/127‑1 (MQ=255) aaTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGtt > 8:99997/1‑127 (MQ=255) aTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTa < 7:255133/132‑1 (MQ=255) aTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTa > 8:255133/1‑132 (MQ=255) aTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTa < 7:249926/139‑1 (MQ=255) aTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTa < 5:125620/139‑1 (MQ=255) aTTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTa < 2:287212/139‑1 (MQ=255) aTTAAATCAGCTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTa < 5:148383/139‑1 (MQ=255) aTCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCa < 3:151167/139‑1 (MQ=255) aTCAGGTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCa < 4:198650/139‑1 (MQ=255) aGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGt < 5:25427/138‑1 (MQ=255) ggtGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTAt < 1:92667/137‑1 (MQ=255) gTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCATTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTa > 2:38169/1‑138 (MQ=255) gTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCTGGATTTAATTGTAAATGAAAGAACAACAAGATTTATAGTTAGGTTAAATCCTAACCCAGTAt > 2:153425/1‑139 (MQ=255) gTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTAt > 5:100794/1‑139 (MQ=255) gTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTAt > 2:194964/1‑139 (MQ=255) gTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTCCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTAt > 6:26372/1‑139 (MQ=255) aTGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCt < 7:152401/138‑1 (MQ=255) tGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTc > 2:62750/1‑138 (MQ=255) tGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCa < 7:305408/139‑1 (MQ=255) tGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCa < 7:128956/139‑1 (MQ=255) tGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTCCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCa < 5:26372/139‑1 (MQ=255) gCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCaa > 8:39039/1‑139 (MQ=255) aCCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAAc > 4:320522/1‑121 (MQ=255) aCCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAAc < 3:320522/121‑1 (MQ=255) aCCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCaataat > 4:158478/1‑138 (MQ=255) cacTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGACTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTTCTTGTAAATGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCATTATCCTCAATAATCatat > 7:185215/1‑139 (MQ=255) aGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTa < 7:198034/110‑1 (MQ=255) aGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTa > 8:198034/1‑110 (MQ=255) aGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAg > 2:98691/1‑116 (MQ=255) aGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAg < 1:98691/116‑1 (MQ=255) aGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCATCTCTTCCGGACGGGATTTACTTGAAACTGAAAGAACACCAAGATTTTAAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAAACATATGAttt > 4:212373/1‑139 (MQ=255) aTTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTc > 2:250302/1‑139 (MQ=255) aTTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTc > 6:89847/1‑139 (MQ=255) gTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATg > 6:90252/1‑139 (MQ=255) ttCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCa > 5:287790/1‑139 (MQ=255) ttCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCa > 3:238272/1‑139 (MQ=255) gCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTGTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGaa < 7:8299/139‑1 (MQ=255) aaCAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGa > 4:201191/1‑126 (MQ=255) aaCAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGa < 3:201191/126‑1 (MQ=255) aaCAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACaa < 8:155256/139‑1 (MQ=255) cAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTAATTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAAtt < 4:85163/139‑1 (MQ=255) cAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCATCCGGTCGGGATTTAATTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAAtt < 4:90332/139‑1 (MQ=255) gTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATaa > 1:29889/1‑139 (MQ=255) tAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATTATCATATTATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATaa < 7:220606/138‑1 (MQ=255) tAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATaa < 8:234845/138‑1 (MQ=255) tAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATaa > 2:300688/1‑138 (MQ=255) tAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATaa < 1:239724/138‑1 (MQ=255) tAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATaa < 1:300688/138‑1 (MQ=255) aaTTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGt < 1:153425/139‑1 (MQ=255) aaTTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGt < 1:38169/139‑1 (MQ=255) ctcttcCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGca < 1:194964/137‑1 (MQ=255) cGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCaaaa < 3:158478/139‑1 (MQ=255) cGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCaaa < 5:90252/138‑1 (MQ=255) gTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGc < 6:287790/139‑1 (MQ=255) gTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGc < 4:238272/139‑1 (MQ=255) gggATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGCctc < 4:154773/139‑1 (MQ=255) gggATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGCctc < 8:67034/139‑1 (MQ=255) gATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGCCTcta < 1:20400/139‑1 (MQ=255) aCTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGCCTCtactac < 1:250302/138‑1 (MQ=255) | CATTATCATTTTCAACAATAGATACAATTAAATCAGTTGATGCGATACCACACTCAGATTCCAGTCTTTCAGCTAACAGCCTGTAAAATTTTTGTTTCTTCTCTTCCGGTCGGGATTTACTTGTAACTGAAAGAACAACAAGATTTTTAGTTCGGTTAAATCCTAACCCAGTATCCTCAATAATCATATGATTTTCTGGATGTTCATGAACAATTTGATAACGGTCTTGTTGAGGCACATCAAAAGCCTCTACTAC > CP006881/2543021‑2543276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |