Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 3,232,856 | T→A | 6.1% | Q72L (CAG→CTG) | U712_16655 ← | Putative efflux system protein yvrP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 3,232,856 | 0 | T | A | 6.1% | 229.4 / 2.2 | 74 | Q72L (CAG→CTG) | U712_16655 | Putative efflux system protein yvrP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/34); new base A (3/2); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CACTTCATCAGAATGATCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATAGGGCTCCGATGATACGGCAACTTGGTTCATGTGAGTAAAAAAGTAAAAACCG > CP006881/3232735‑3232993 | cACTTCATCAGAATGATCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTc < 8:165601/138‑1 (MQ=255) cTTCATCAGAATGATCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAAc > 4:314484/1‑139 (MQ=255) aTGATCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGaa < 3:109204/139‑1 (MQ=255) tCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACg > 3:312740/1‑139 (MQ=255) tCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACg > 1:55155/1‑139 (MQ=255) tCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCAGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACg > 3:136552/1‑139 (MQ=255) tCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCAGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACg > 3:131285/1‑139 (MQ=255) cGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTg > 4:185957/1‑139 (MQ=255) cGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTg > 2:219807/1‑139 (MQ=255) gCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTGTCCAGAAAACGATTgg > 3:77631/1‑139 (MQ=255) gCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCATTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTAAGGTTCAACCTATCCAGAAAACGTTTgg > 7:330410/1‑139 (MQ=255) ccTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGcc < 4:304219/139‑1 (MQ=255) cATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGa > 6:353812/1‑139 (MQ=255) aTACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACATGATCGCCTTCTTTGACGTATGATTTTTTAATGATAACATTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGATGTTTCTCAGGATCAACCTTTCCAGAAAACGTATGGCCTGAt > 2:200097/1‑139 (MQ=255) cTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCt < 4:312740/139‑1 (MQ=255) cTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCt < 1:219807/139‑1 (MQ=255) cTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCt < 3:185957/139‑1 (MQ=255) aaaaaGCTTATCTCCCTTTTTACCCTGATCGACTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTTCCTTTTTCTGAATCTATGTATAATTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGaa > 4:276862/1‑139 (MQ=255) aaaaaGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGaa < 8:79100/118‑1 (MQ=255) aaaaaGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGaa > 7:79100/1‑118 (MQ=255) aaaaaGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGaa > 3:97083/1‑139 (MQ=255) aaaaaGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGaa > 5:202214/1‑139 (MQ=255) aaaaaGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCAATCTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGCTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGa > 8:47212/1‑138 (MQ=255) aaaaaGCTTATCGCCCGTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGCAGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTGTTTCTGAATCTAGGTATACTTTCTGCTGGTTCTCAGGTGCAACCTTTCCAGCACTCGTTTGGCCTGATTCTGaa > 8:224575/1‑139 (MQ=255) aataGCTTATCGACCTTTTTAAACTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCATGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAAt < 1:200097/136‑1 (MQ=255) aaaGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATCTTTATTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCAGCTGTTTCTCAGCAACACCCTTACCAGAAAACGTTTGCCATGATTCTGTAtc > 6:112713/1‑139 (MQ=255) aGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAAtctc < 6:202214/139‑1 (MQ=255) gCTTATCGCCCTTTTTAACGTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGTAtctc < 5:112713/138‑1 (MQ=255) cTTATCGCCCTTTTTATCCTGATCGCCTTATTTGAAGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct < 8:330410/139‑1 (MQ=255) cTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct < 8:94230/139‑1 (MQ=255) cTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct < 3:131789/139‑1 (MQ=255) tATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc > 3:335680/1‑139 (MQ=255) tATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc > 5:37074/1‑139 (MQ=255) tATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc > 3:183920/1‑139 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTTTGTTTTTTTAATGCTGCCGTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAATCGTTTGGCCAGATTCTGAATCtcctcc < 3:260614/138‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 3:314484/138‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 5:353812/138‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 2:208870/138‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCAGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 4:136552/138‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCAGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 4:131285/138‑1 (MQ=255) tCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCATAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct > 4:23541/1‑135 (MQ=255) tCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct < 3:23541/135‑1 (MQ=255) tCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCCTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTtct > 4:247325/1‑88 (MQ=255) tCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCCTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTtct < 3:247325/88‑1 (MQ=255) tttttAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAAtctc < 8:295500/127‑1 (MQ=255) tttttAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAAtctc > 7:295500/1‑127 (MQ=255) ccTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGAc < 6:37074/139‑1 (MQ=255) gATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTACCACCTTTCCAGAAAACGTTTCGCCTGATTCTGATTCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGa > 8:29872/1‑139 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGaa > 7:58540/1‑91 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGaa < 8:58540/91‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc > 1:56912/1‑120 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 2:56912/120‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGAc < 3:146620/135‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGAc > 4:146620/1‑135 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGa < 3:156620/138‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGa > 4:156620/1‑138 (MQ=255) aTCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGAt > 1:101222/1‑139 (MQ=255) aTCGCATTCTTTGACGTTTGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGAt < 2:103392/139‑1 (MQ=255) tCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGAtt < 2:101222/139‑1 (MQ=255) tGACGTAAGTTTTTTTAATGGTGACTTTTTCTGACTCTATTTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCATAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATa < 8:263367/136‑1 (MQ=255) tGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAAtctc < 7:323866/66‑1 (MQ=255) tGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAAtctc > 8:323866/1‑66 (MQ=255) tttCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGcc > 4:207279/1‑45 (MQ=255) tttCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGcc < 3:207279/45‑1 (MQ=255) tttCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc < 4:300974/63‑1 (MQ=255) tttCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCtcctcc > 3:300974/1‑63 (MQ=255) ttCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct < 4:198446/60‑1 (MQ=255) ttCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATctcct > 3:198446/1‑60 (MQ=255) ttCTGCTGTATCTCAGGTTCACCCTTTCCAGAAAACGTTTCGCCTGATTCTGAAAATCCTCCCATGTATACCGCCACCGATTCAACAAAGGGCTCCGATGATAAGGCAAATTGGTTCATGTAATTAAAAAACTAAAAAc > 8:284066/1‑139 (MQ=255) tCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATa < 5:268397/88‑1 (MQ=255) tCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATa > 6:268397/1‑88 (MQ=255) tCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATAGGGCTCCGATGATACgg > 2:55851/1‑105 (MQ=255) tCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATAGGGCTCCGATGATACgg < 1:55851/105‑1 (MQ=255) tCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATAGGGCTCCGATGATACGGCAACTTGGTTCATGTTAGTAAAAAAGTAAAAAcc > 1:161859/1‑139 (MQ=255) ctgctgTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATAGGGCTCCGATGATACGGCAACTTGGTTCATGTGAGTAAAAAAGTAAAAACCg > 7:304012/1‑139 (MQ=255) | CACTTCATCAGAATGATCCTCGCCCTCATACTCAAAAAGCTTATCGCCCTTTTTAACCTGATCGCCTTCTTTGACGTATGTTTTTTTAATGCTGCCTTTTTCTGAATCTATGTATACTTTCTGCTGTTTCTCAGGTTCAACCTTTCCAGAAAACGTTTGGCCTGATTCTGAATCTCCTCCCATGTATACCGCGACCGATTCAGCATAGGGCTCCGATGATACGGCAACTTGGTTCATGTGAGTAAAAAAGTAAAAACCG > CP006881/3232735‑3232993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |