| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 3,825,369 | A→T | 6.4% | intergenic (+572/+286) | U712_19725 → / ← U712_19735 | Purine nucleoside transport protein nupG/Uncharacterized protein yxiS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 3,825,369 | 0 | A | T | 6.4% | 220.8 / 2.8 | 74 | intergenic (+572/+286) | U712_19725/U712_19735 | Purine nucleoside transport protein nupG/Uncharacterized protein yxiS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/36); new base T (2/3); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTTTTAAAGCCCTGCTGTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTCCATT > CP006881/3825231‑3825506 | gTTTTAAAGCCCTGCTGTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTaa < 3:17481/139‑1 (MQ=255) aaGCCCTTCTGTTGGACTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCt < 7:216374/138‑1 (MQ=255) aaGCCCTGCTGTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCt < 1:312662/138‑1 (MQ=255) aaGCCCTGCTGTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCt < 7:324753/138‑1 (MQ=255) aaGCCCTGCTGTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCt < 7:46666/138‑1 (MQ=255) tgctgTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCtt > 5:248830/1‑139 (MQ=255) tgTTCGTATGTTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCttttt < 2:147267/139‑1 (MQ=255) ttCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCttttt < 1:345811/137‑1 (MQ=255) cGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTa < 6:212816/138‑1 (MQ=255) cGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTAc > 4:107403/1‑139 (MQ=255) cGCCTGCTGTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTa < 5:319677/138‑1 (MQ=255) cTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTa < 4:233613/139‑1 (MQ=255) cTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTa > 4:287733/1‑139 (MQ=255) cTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTa < 3:119218/139‑1 (MQ=255) cTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGCCATTCCCTACGTGATGCACTTGTGGATAAGTTAACACCTAGATCTTTTTGTACgaa > 5:83465/1‑137 (MQ=255) cTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCt < 8:178508/125‑1 (MQ=255) cTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCt > 7:178508/1‑125 (MQ=255) cTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATgg > 3:321137/1‑139 (MQ=255) cTTATTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTCGTCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATgg < 6:357023/139‑1 (MQ=255) tttttCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGa < 5:304581/138‑1 (MQ=255) ttCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGtt < 4:163402/138‑1 (MQ=255) ttCCTGATACGATTGTTCATGTAGGATTTCAGCTCTTGATTGATTTTGTTTTCAAACTCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGtt < 7:57050/138‑1 (MQ=255) ccTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTc > 8:233879/1‑139 (MQ=255) gATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTGTTCGCt > 4:325960/1‑139 (MQ=255) aTACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAACCGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGc < 3:240303/137‑1 (MQ=255) aCGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGAGTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCAGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTg > 7:157759/1‑138 (MQ=255) cGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGaa < 6:169365/139‑1 (MQ=255) aTTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTcc < 3:114108/88‑1 (MQ=255) aTTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTcc > 4:114108/1‑88 (MQ=255) aTTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTa < 6:353980/106‑1 (MQ=255) aTTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTa > 5:353980/1‑106 (MQ=255) aTTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACt < 7:54473/139‑1 (MQ=255) tGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTATCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGc > 5:127590/1‑139 (MQ=255) tGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTATCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGc > 5:133413/1‑139 (MQ=255) ttCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCt < 6:171674/138‑1 (MQ=255) gTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTa > 4:322153/1‑137 (MQ=255) gTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTa > 4:88445/1‑137 (MQ=255) gTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTa > 1:123245/1‑137 (MQ=255) cTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATgg > 6:42266/1‑139 (MQ=255) tCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGc > 3:267196/1‑139 (MQ=255) aGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCg > 2:119620/1‑139 (MQ=255) ctctTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCa < 1:318548/139‑1 (MQ=255) ctctTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCa < 7:247327/139‑1 (MQ=255) ctctTGATTGATATTCTTATCAAACGCGCCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCa < 4:60680/139‑1 (MQ=255) attgattTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGAAGGCGCCGCATATGc < 3:325960/138‑1 (MQ=255) attTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGTGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATa > 4:23444/1‑139 (MQ=255) attTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATa > 3:24064/1‑139 (MQ=255) attTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATa < 3:88445/139‑1 (MQ=255) cttttcAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGa > 8:124886/1‑138 (MQ=255) ttcAACCGCGGCAGTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGGCGGTGTTTGCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGaaaa < 8:80623/138‑1 (MQ=255) ttcAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGaa < 2:94620/136‑1 (MQ=255) aCGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCaa < 3:107403/139‑1 (MQ=255) gCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTg > 2:46048/1‑139 (MQ=255) ccGTGATGCACGTGTGGAGACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGGCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCcg < 3:190794/138‑1 (MQ=255) aCGTGCTGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGGGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCcg < 5:293012/139‑1 (MQ=255) aCGTGATGCACTTGTGGTTACGTTATCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGGGTTTTCGCTTGAAATGCTTTTAACTAGGGGGCCGCATTTGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCcg < 7:156689/139‑1 (MQ=255) tGATGCACTTGTGGATACGTTATCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCgg < 6:127590/139‑1 (MQ=255) tGATGCACTTGTGGATACGTTATCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCgg < 6:133413/139‑1 (MQ=255) gCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCcg < 3:177430/132‑1 (MQ=255) gCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCcg > 4:177430/1‑132 (MQ=255) cTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCaa < 3:99029/115‑1 (MQ=255) cTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCaa > 4:99029/1‑115 (MQ=255) gATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGtt > 2:4654/1‑139 (MQ=255) gATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGt > 2:148572/1‑138 (MQ=255) 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gTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTc > 2:331450/1‑138 (MQ=255) gTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTc > 3:117646/1‑138 (MQ=255) gTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTc > 8:56628/1‑138 (MQ=255) aaCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGGGCTGACAGGCGGGGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTCCAtt < 2:136949/139‑1 (MQ=255) aCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTCCAtt < 5:139938/138‑1 (MQ=255) aCTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTCCAtt < 1:46048/138‑1 (MQ=255) | GTTTTAAAGCCCTGCTGTTCGCCTGCTTTTTTGTTTTTCAGGTATTCCTGATACGATTGTTCATGTAGGCTTTCAGCTCTTGATTGATTTTCTTTTCAAACGCGGCATTCCCGACGTGATGCACTTGTGGATACGTTAACTCCTTGATCTTTTTGTACGTATGGGTGCTGACAGTCGGTGTTTTCGCTTGAACTGCTTTTAAAGATGGGGCCGCATATGCAAATACAGAAAAAAGCAAGACTGCAATGCCCGCGGCTTTCAGCATGTTATTCCATT > CP006881/3825231‑3825506 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |