Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,177,974 | C→A | 5.2% | V8L (GTA→TTA) | U712_10895 ← | Dihydrodipicolinate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,177,974 | 0 | C | A | 5.2% | 240.7 / 3.4 | 77 | V8L (GTA→TTA) | U712_10895 | Dihydrodipicolinate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/38); new base A (2/2); total (37/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.63e-01 |
ACAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAAGAGATATCAA > CP006881/2177841‑2178101 | aCAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTaa > 4:268912/1‑139 (MQ=255) tgtatgGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTAC‑TTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTcc < 8:145833/139‑1 (MQ=255) tatgGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTcc < 2:3156/138‑1 (MQ=255) tgGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCCCGCGGGCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttc > 6:188142/1‑139 (MQ=255) ggTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttct > 4:117860/1‑139 (MQ=255) tCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttc > 2:298508/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGCCTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 8:256529/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGTTCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 3:186236/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTcc < 8:157861/131‑1 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTcc > 7:157861/1‑131 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 3:110626/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 2:23020/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTGTCcttcttgtt > 5:48602/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCGGTCAATTTAACAGCGTCTTGCCCCATTCTACCACGCGGTCCGGCAATGACTACTTTAAGTGTTACGTGTGACAGCTTGATCTCCACTCCTTTCctgcttctt > 8:156458/1‑139 (MQ=255) cccGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCGTCCACGCGGTCCGGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCATTCTTCTTTTCTgg > 7:196575/1‑139 (MQ=255) ccGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTATGGt > 7:182568/1‑139 (MQ=255) cGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATctcct > 2:109356/1‑114 (MQ=255) cGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATctcct < 1:109356/114‑1 (MQ=255) cGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTc > 6:357245/1‑139 (MQ=255) cGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTc > 5:63450/1‑139 (MQ=255) cGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATATTGATCTCCACTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTc > 7:209352/1‑139 (MQ=255) cGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCAACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACATTCCAACTTCATTTATGGTc > 6:80685/1‑139 (MQ=255) aCAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTc > 5:199698/1‑137 (MQ=255) cAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAg < 2:370177/139‑1 (MQ=255) cAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAg < 1:23020/139‑1 (MQ=255) aaGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGc < 3:240604/139‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCGACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCg < 5:80685/139‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCg < 1:91303/139‑1 (MQ=255) gTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGAt > 7:115930/1‑139 (MQ=255) gTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGAt > 6:78320/1‑139 (MQ=255) gTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGAt > 5:263685/1‑139 (MQ=255) gTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGAt > 5:218205/1‑139 (MQ=255) aGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGTTCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTAtctc < 4:186236/139‑1 (MQ=255) ggTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 2:169416/95‑1 (MQ=255) ggTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc > 1:169416/1‑95 (MQ=255) gtgtTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGAGATCTTGATCTCGTCTACTTTCGTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATATCTa > 4:184046/1‑139 (MQ=255) gtgtTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTg < 8:95683/89‑1 (MQ=255) gtgtTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTg > 7:95683/1‑89 (MQ=255) gtgtTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCATCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTTACATCTTGAAATCCTCTACTTTACTTCATCTTTTATGGTCCAGCGATCTTTATatctt > 1:282117/1‑138 (MQ=255) ttcgttcTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTa > 1:204413/1‑139 (MQ=255) cgttcTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCg > 5:195484/1‑121 (MQ=255) cgttcTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCg < 6:195484/121‑1 (MQ=255) cgttcTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGGCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTAtt < 6:11449/139‑1 (MQ=255) tGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCATGAAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTAGTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTGTAGTATTAAAtt < 8:196575/139‑1 (MQ=255) gTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAAtt > 1:288967/1‑138 (MQ=255) tttAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCa < 2:288967/139‑1 (MQ=255) cAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGaac < 3:184046/139‑3 (MQ=255) cAGCTTCTGGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGAcc < 7:156458/139‑1 (MQ=255) cttcttGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGAATGACCCgg > 6:220822/1‑139 (MQ=255) tcttGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTc > 2:70184/1‑139 (MQ=255) cccctccttcCACGCGCTCCTGCCATGACAACCATAATTGTCTCGCGTGACCTCTTGATCTCCTCTACTCTCCTTCATCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGGGGGc < 2:266176/133‑1 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGc < 5:241504/139‑1 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGc < 2:234455/139‑1 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGc < 6:218205/139‑1 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGc < 5:220822/139‑1 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGGCGTGGGc < 6:63450/139‑1 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATATCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGttgtc < 8:159432/139‑5 (MQ=255) cccATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTTGTATTAAATTTATGCATGACTCGGTCGTGAGc < 8:115930/139‑1 (MQ=255) ttcttcCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTAtt > 3:159067/1‑108 (MQ=255) ttcttcCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTAtt < 4:159067/108‑1 (MQ=255) ttcttcCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGAATGACCCGGTCGTgggggtag > 8:67790/1‑134 (MQ=255) cACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTaaa < 8:182568/139‑1 (MQ=255) cACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTaaa < 1:70184/139‑1 (MQ=255) cACGCGGTACCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTTGTATTAAATTTATGCATGACTCGGTCGTGAGCTTCCTCTaaa < 2:282117/139‑1 (MQ=255) cgcgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTAtctc < 6:316951/93‑1 (MQ=255) cgcgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTAtctc > 5:316951/1‑93 (MQ=255) cgcgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAaga < 5:357245/139‑1 (MQ=255) cgcgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAaga < 4:110626/139‑1 (MQ=255) cgcgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAaga < 3:268912/139‑1 (MQ=255) cgcgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTATCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAaga < 2:197048/139‑1 (MQ=255) cgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAAt < 3:191568/102‑1 (MQ=255) cgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAAt > 4:191568/1‑102 (MQ=255) cgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAAgaga < 2:204413/139‑1 (MQ=255) cgGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGGCGTGGGCTTCCTCTAAAgaga < 6:199698/139‑1 (MQ=255) tCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTa > 5:166096/1‑96 (MQ=255) tCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTa < 6:166096/96‑1 (MQ=255) cAATGACTACTTTATTTGTTTAGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAAGAGATATCaa < 3:163759/137‑1 (MQ=255) actactTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGc > 4:38483/1‑112 (MQ=255) actactTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGc < 3:38483/112‑1 (MQ=255) | ACAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGGTCCAGCGATCTTTATCTCTAGTATTAAATTTATGCATGACCCGGTCGTGGGCTTCCTCTAAAGAGATATCAA > CP006881/2177841‑2178101 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |