Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 1,669,467 | C→T | R204* (CGA→TGA) | U712_08600 → | Flagellar biosynthetic protein fliR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 1,669,467 | 0 | C | T | 98.8% | 295.6 / ‑4.1 | 85 | R204* (CGA→TGA) | U712_08600 | Flagellar biosynthetic protein fliR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (33/51); total (33/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 |
CGAATTTCGGCGATGAAAAGTTTGCCTATTTTATTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAA > CP006881/1669333‑1669599 | cGAATTTCGGCGATGAAAAGTTTGCCTATTTTATTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGaa < 7:459759/138‑1 (MQ=255) ggCGATGAAAAGTTTGCCTATTTTATTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCg < 1:156341/138‑1 (MQ=255) ggCGATGAAAAGTTTGCCTATTTTATTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCg < 1:211828/138‑1 (MQ=255) aTGAAAAGTTTGCCTATTTTATTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGtt < 7:210710/139‑1 (MQ=255) aaaTTTTGCATATTTTATTGCTAAAAGGTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCACATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCATTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAAt < 8:373387/139‑1 (MQ=255) aTTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTCTTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTggtcggt < 8:171209/138‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCTAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTggtcggtc < 5:108934/138‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTggtcggtc < 1:471530/138‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTggtcggtc < 3:187256/138‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTggtcggtc < 5:96051/138‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTggtcggtc < 1:336207/138‑1 (MQ=255) ttGCGAAAAGCTTTAATCCAATGTTTATTATCGATTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTATTTGATTTAGAATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTACCGCAGTTAATAGTATTTGTGGTCGGTCt > 7:113391/1‑139 (MQ=255) aaaaGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCtt > 3:248570/1‑139 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGaa < 6:421847/85‑1 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGaa > 5:421847/1‑85 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGt > 8:314943/1‑137 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGt > 3:30019/1‑137 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGt > 5:462409/1‑137 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGt > 5:452000/1‑137 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCAGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAAATGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCTGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCa > 6:347617/1‑139 (MQ=255) tGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg < 8:154263/139‑1 (MQ=255) tGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg < 5:352775/139‑1 (MQ=255) tGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg < 6:84640/139‑1 (MQ=255) attatCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGtt > 6:383762/1‑92 (MQ=255) attatCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGtt < 5:383762/92‑1 (MQ=255) ttatCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCAt < 8:84817/139‑1 (MQ=255) ttatCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGCTGGTGGCCAGTATGTTTCTAGTTGAATTAGCATTAGGTATCGTGGCCTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCAt < 2:472150/139‑1 (MQ=255) gCTTTTCAAATTTCAGAGACGGTTGTGGACAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg < 8:293070/138‑1 (MQ=255) gCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTTTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg < 8:3274/138‑1 (MQ=255) gCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg < 3:145342/138‑1 (MQ=255) gCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg < 6:452000/138‑1 (MQ=255) cTTTTGAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 6:349061/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTaaa > 1:201027/1‑88 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTaaa < 2:201027/88‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCTGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 7:283924/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 3:374623/1‑139 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 7:168111/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 7:11660/1‑139 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 6:462409/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 3:200246/1‑139 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 7:314943/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 4:402313/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 4:406316/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 5:183235/1‑139 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 5:251133/1‑139 (MQ=255) tttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa > 2:18015/1‑139 (MQ=255) tttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa > 6:412104/1‑139 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 3:275784/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 8:62774/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 4:200246/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 8:42289/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 7:94247/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 8:11660/138‑1 (MQ=255) cAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCAtt < 4:189507/138‑1 (MQ=255) aaaTGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgt < 4:374623/139‑1 (MQ=255) aGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTgtatgtat < 5:358706/138‑1 (MQ=255) gTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgtatgta < 7:219748/130‑1 (MQ=255) gTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgtatgta > 8:219748/1‑130 (MQ=255) gCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTg < 3:338979/81‑1 (MQ=255) gCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTg > 4:338979/1‑81 (MQ=255) aGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTtcgtcg < 6:419947/139‑1 (MQ=255) tttgtttCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGCGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg < 5:336983/96‑1 (MQ=255) tttgtttCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGAGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg > 6:336983/1‑96 (MQ=255) tttCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTcc < 3:332652/139‑1 (MQ=255) gTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCAtt < 3:21921/93‑1 (MQ=255) gTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCAtt > 4:21921/1‑93 (MQ=255) gTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGa < 1:18015/136‑1 (MQ=255) gTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGa < 5:412104/136‑1 (MQ=255) gTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATg > 3:141140/1‑139 (MQ=255) gTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGACCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATg > 6:102682/1‑139 (MQ=255) aTTTAGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGtttt < 3:471256/139‑1 (MQ=255) aGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGtt < 6:314113/80‑1 (MQ=255) aGCATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGtt > 5:314113/1‑80 (MQ=255) cATTAGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGtt > 1:247931/1‑138 (MQ=255) aGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa > 3:439745/1‑86 (MQ=255) aGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 4:439745/86‑1 (MQ=255) aGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAAc > 2:152673/1‑138 (MQ=255) aGGTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAAc > 3:419400/1‑138 (MQ=255) ggTATCGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGa > 8:271800/1‑139 (MQ=255) cGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCAtt > 3:379354/1‑82 (MQ=255) cGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCAtt < 4:379354/82‑1 (MQ=255) cGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCTTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGa > 5:62772/1‑138 (MQ=255) cGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGa > 3:314211/1‑138 (MQ=255) cGTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGa > 7:385299/1‑138 (MQ=255) gTGGCTTGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGaaa < 4:141140/139‑1 (MQ=255) | CGAATTTCGGCGATGAAAAGTTTGCCTATTTTATTGCGAAAAGCTTTAATGCAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAA > CP006881/1669333‑1669599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |