| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,054,382 | A→C | intergenic (+60/‑41) | U712_10180 → / → U712_10185 | Putative aldehyde dehydrogenase dhaS/Squalene‑‑hopene cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,054,382 | 0 | A | C | 100.0% | 497.3 / NA | 131 | intergenic (+60/‑41) | U712_10180/U712_10185 | Putative aldehyde dehydrogenase dhaS/Squalene‑‑hopene cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (59/72); total (59/72) | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GGACGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTAAAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCAAAATGCTGATGGTTCATGGACATTTTG > CP006881/2054248‑2054517 | ggACGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAg < 8:433443/138‑1 (MQ=255)ggACGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGGACAAGa > 4:26352/1‑139 (MQ=255) gACGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGAc > 6:334473/1‑139 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 8:370359/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 7:52931/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 1:241762/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 7:403498/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 6:318199/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 5:312016/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 8:385701/139‑1 (MQ=255) aCGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 2:212822/139‑1 (MQ=255) gagaAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt < 5:334473/139‑1 (MQ=255) gagaAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt < 2:298771/139‑1 (MQ=255) agaAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 6:364791/1‑138 (MQ=255) gaAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGa < 5:402668/139‑1 (MQ=255) aaTGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAat < 1:119922/139‑1 (MQ=255) tGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAata > 5:138385/1‑138 (MQ=255) ggATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGa > 5:294034/1‑133 (MQ=255) ggATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGa < 6:294034/133‑1 (MQ=255) gATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatata < 4:6062/139‑1 (MQ=255) gATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGGCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatata < 6:427478/139‑1 (MQ=255) aTCATATGACTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATTGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatatat < 4:87431/139‑1 (MQ=255) atGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTc > 1:274810/1‑139 (MQ=255) ccTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt < 6:385130/121‑1 (MQ=255) ccTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 5:385130/1‑121 (MQ=255) tGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGTCAGTACAAGACGCTGAatatata > 1:185854/1‑127 (MQ=255) tGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAgg > 2:356339/1‑139 (MQ=255) ggATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 4:114857/1‑117 (MQ=255) ggATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt < 1:384100/117‑1 (MQ=255) ggATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 2:384100/1‑117 (MQ=255) gATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 1:165732/114‑1 (MQ=255) gATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg > 2:165732/1‑114 (MQ=255) ttACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg > 2:250052/1‑109 (MQ=255) ttACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 1:250052/109‑1 (MQ=255) ttACACAGAAGTAAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAg > 1:139385/1‑139 (MQ=255) caGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTTCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTg < 5:222411/107‑1 (MQ=255) aaGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg < 6:312620/101‑1 (MQ=255) aaGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACg > 5:312620/1‑101 (MQ=255) aaGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 7:37281/1‑103 (MQ=255) gTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATggg > 6:239805/1‑138 (MQ=255) gTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATggg > 8:383504/1‑138 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCGAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 2:275430/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 3:31284/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 6:138385/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 7:51019/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 3:26352/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 2:274810/139‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGAAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 2:321093/139‑1 (MQ=255) gcAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 1:448935/138‑1 (MQ=255) cAAATGTTTCTGGGAAAACGTTTATGACTAACTTGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGTTTTTTTTTTCTTTCTGTAATGGAAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 2:334239/138‑1 (MQ=255) aGTGTATGTGTAAACCTTGAAGACTAACATTTATGTTTAAAAAACTGCTGACTGGCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACtt < 4:121199/139‑1 (MQ=255) tgtATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGaa > 1:377375/1‑112 (MQ=255) tgtATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGaa < 2:377375/112‑1 (MQ=255) tgtATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca > 6:429910/1‑132 (MQ=255) tgtATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 5:429910/132‑1 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt < 1:232462/91‑1 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 2:232462/1‑91 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGc < 5:271284/129‑1 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGc < 5:265250/129‑1 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGc > 6:265250/1‑129 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAg > 1:6322/1‑138 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAg > 2:56451/1‑138 (MQ=255) tATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGATGAGCGTGATGGGCACACTTCAgg > 4:65407/1‑139 (MQ=255) gTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGgaga > 3:122765/1‑137 (MQ=255) aaCCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 5:84992/122‑1 (MQ=255) aaCCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca > 6:259349/1‑122 (MQ=255) aaCCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca > 6:84992/1‑122 (MQ=255) aaGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTg > 2:342979/1‑77 (MQ=255) aaGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTg < 1:342979/77‑1 (MQ=255) aaGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatata > 8:165759/1‑85 (MQ=255) aaGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatata < 7:165759/85‑1 (MQ=255) aaGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGtt > 8:328512/1‑139 (MQ=255) tAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATggg < 5:315165/108‑1 (MQ=255) tAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCa > 2:270809/1‑138 (MQ=255) tAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCa > 1:445473/1‑138 (MQ=255) ttAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAATGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCAt > 1:51161/1‑138 (MQ=255) tAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca > 8:215846/1‑97 (MQ=255) tAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGca < 7:215846/97‑1 (MQ=255) tAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTa > 7:408017/1‑139 (MQ=255) aaaaaaCTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGAt < 6:297857/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAgg < 4:392671/105‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTAc > 6:312037/1‑139 (MQ=255) aaaaaCTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTAcc < 2:6322/139‑1 (MQ=255) aaaaaCTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTAc < 1:56451/138‑1 (MQ=255) tgctgcCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGa < 6:130988/77‑1 (MQ=255) tgctgcCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGa > 5:130988/1‑77 (MQ=255) tgctgcCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAAc > 5:451730/1‑126 (MQ=255) tgctgcCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAAc < 6:451730/126‑1 (MQ=255) tgccAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt > 5:448933/1‑43 (MQ=255) tgccAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCt < 6:448933/43‑1 (MQ=255) tgccAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatata > 5:441292/1‑52 (MQ=255) tgccAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAatatata < 6:441292/52‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTACTAGTCGCTGTATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAgg < 2:51161/139‑1 (MQ=255) gcagTTTTTTTCTTACTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCaa < 4:279474/139‑1 (MQ=255) ttttttCTTTCTGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCAAAATGc > 4:391848/1‑139 (MQ=255) tctttctGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCAAAATGCTGAt < 1:356339/138‑1 (MQ=255) tctGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGGAAAATTCTGATgg < 2:139385/136‑1 (MQ=255) tctGTAATGGCAGTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCAAAATGCTGATGGtt > 7:202502/1‑138 (MQ=255) gTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGAc < 1:28809/107‑1 (MQ=255) gTACAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCAAAATCCTGATGGTTCATGGACATTTTg > 3:448506/1‑139 (MQ=255) | GGACGAGAAATGGGATCATATGCCTTGGATAATTACACAGAAGTCAAAAGTGTATGGGTAAACCTTGAAGACTAACATGTATGTTTAAAAAACTGCTGCCTGCCAGCAGTTTTTTTCTTTCTGTAATGGCAGTAAAAGACGCTGAATATATATGCTTCTGAAGGAGTTGAGCGTGATGGGCACACTTCAGGAGAAAGTGAGGCGTTTTCAAAAGAAAACCATTACCGAGTTAAGAGACAGGCAAAATGCTGATGGTTCATGGACATTTTG > CP006881/2054248‑2054517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |