| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 3,723,066:1 | +A | 94.0% | intergenic (‑180/‑121) | U712_19190 ← / → U712_19195 | PTS system sucrose‑specific EIIBC component/putative transporter ywcJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 3,723,066 | 1 | . | A | 94.0% | 332.7 / 12.6 | 100 | intergenic (‑180/‑121) | U712_19190/U712_19195 | PTS system sucrose‑specific EIIBC component/putative transporter ywcJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/3); new base A (31/63); total (34/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGCCAACGAATAAAGGACACAGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTGAGAATACGCTTTCATCATAAATTATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑T‑G‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATAAAACTTTTAGACAAAAATTCGTAAAAACTATTTGTGAAAAACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAACCATCAAAGAAAGCAGGAAAAAACAATGGAAACTCA > CP006881/3722929‑3723197 | cGCCAACGAATAAAGGACACAGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑ta > 1:271218/1‑138 (MQ=255) aCGAATAAAGGACACAGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑T‑A‑ttttt > 2:395201/1‑139 (MQ=255) cacaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAg > 4:112945/1‑139 (MQ=255) cacaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAg > 6:155834/1‑139 (MQ=255) acaGCGATCC‑TTTTTCATTTACTCAAATTTTATGTCTTGCCTGCTTTTCCAGTCACAATACAGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTAATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCATC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt < 4:269598/139‑1 (MQ=255) acaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCTTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt > 1:361582/1‑139 (MQ=255) acaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑ATTTAAATAGt > 7:311673/1‑139 (MQ=255) acaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt < 3:38709/139‑1 (MQ=255) acaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt < 2:58705/139‑1 (MQ=255) acaGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt > 1:256867/1‑139 (MQ=255) acaGCGATCC‑TATTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCATTACCAGTCACAATCCAGCTTATTCATATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt < 5:316929/139‑1 (MQ=255) caGCGATCCTTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGt < 6:164619/139‑1 (MQ=255) caGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGtt < 4:239392/139‑1 (MQ=255) aGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGttt > 7:110503/1‑139 (MQ=255) aGCGATCC‑TTTTTCATTTACGAAAATTTTAGGTCTTGCCTCCAATACCAGTAACAATCAAGCTTATTCAGATAAAGAATACTCTATCATAATAAAAAAAGATATCGTATACGTCAACAA‑A‑TTATTT‑AGTTAAAGAGtt > 8:110573/1‑138 (MQ=255) cGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGtt < 2:241668/136‑1 (MQ=255) cGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGtt > 1:241668/1‑136 (MQ=255) tCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATat < 1:404720/139‑2 (MQ=255) tCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATat < 6:79125/139‑2 (MQ=255) tCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATa > 1:310195/1‑138 (MQ=255) tCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATa > 2:350254/1‑138 (MQ=255) tCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCAGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAA‑TTTTTT‑AGTTAAATTGTTTGATa > 5:27527/1‑138 (MQ=255) tttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAAcat > 8:173450/1‑137 (MQ=255) tttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAAcat > 4:297240/1‑137 (MQ=255) ttGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTaaaaatt > 1:306347/1‑136 (MQ=255) ttGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTaaaaatt > 3:126044/1‑136 (MQ=255) tGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaa > 7:193792/1‑138 (MQ=255) cTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtg < 5:396534/139‑1 (MQ=255) cTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtgtg < 3:112945/138‑1 (MQ=255) cTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtgtg < 1:150189/138‑1 (MQ=255) tACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaa < 5:350459/138‑1 (MQ=255) ccAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 4:399294/138‑3 (MQ=255) ccAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 3:331023/138‑3 (MQ=255) ccAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 2:234471/138‑3 (MQ=255) ccAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATAc < 5:276562/139‑1 (MQ=255) ccAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCAAGATAGCGGTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 7:312935/138‑3 (MQ=255) ccAGTCACAATCCCGCTTAATCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaata < 4:372030/138‑3 (MQ=255) cactCACAATCCCCCTTATTCATTTTAAGAATAAGCTTTCATCAAAAATCATGATATCGTTTTAGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACt < 8:311673/136‑1 (MQ=255) tCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTca < 8:110503/139‑1 (MQ=255) cacaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTca > 3:87428/1‑138 (MQ=255) cacaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTca < 4:87428/138‑1 (MQ=255) acaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTcaca < 2:306347/139‑1 (MQ=255) acaATCCAGCTTATTCAGATTAAGAATACTCTTTCATCATTAATAATGATAGAGATTTCGTCAAG‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAATATTACTTGTGATTTACTTcaca < 7:110573/139‑1 (MQ=255) aTCCCTCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 6:351319/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACATAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:361582/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 5:155834/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 5:73996/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 8:102037/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:205829/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 3:68585/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 1:336095/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 8:203255/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:271218/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 8:268356/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:179576/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 8:330392/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 1:350254/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑T‑A‑TTTTTTCAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:347147/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTATCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 4:64908/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTATCATCATAAATCATGATAGCGATTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAATAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 1:15353/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTAATCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTGAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 8:211914/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCTTAATCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATAATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 6:109188/139‑1 (MQ=255) aTCCCGCGTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 6:398510/139‑1 (MQ=255) aTCACGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:26211/139‑1 (MQ=255) ccGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc < 8:396117/138‑1 (MQ=255) ccGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc < 2:310195/138‑1 (MQ=255) ccGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATc < 8:159059/138‑1 (MQ=255) cGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGt > 8:93369/1‑139 (MQ=255) cGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGt > 1:261356/1‑139 (MQ=255) gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 4:330610/139‑1 (MQ=255) gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 4:321613/139‑1 (MQ=255) gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 3:297240/139‑1 (MQ=255) gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 7:173450/139‑1 (MQ=255) gCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 2:261356/139‑1 (MQ=255) cTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTATTATATAACATGTAGACAAAACTTCGTAAAAATTAATTGTGAAAGACATACCAATATCGTg > 4:235508/1‑138 (MQ=255) aTTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCCTAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCt < 3:235508/137‑1 (MQ=255) tCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 3:293655/128‑1 (MQ=255) tCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 4:293655/1‑128 (MQ=255) tCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATAc > 1:85823/1‑139 (MQ=255) aGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACt < 8:61899/138‑1 (MQ=255) aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCtata < 4:115529/134‑1 (MQ=255) aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCtata > 3:115529/1‑134 (MQ=255) cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 1:407237/1‑114 (MQ=255) cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 2:407237/114‑1 (MQ=255) cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAt > 1:368714/1‑138 (MQ=255) cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAt > 6:374575/1‑138 (MQ=255) cGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑T‑A‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAtg > 7:266856/1‑137 (MQ=255) tcatcaTAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 7:276455/109‑1 (MQ=255) tcatcaTAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 8:276455/1‑109 (MQ=255) catcatAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg > 3:146193/1‑113 (MQ=255) catcatAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTg < 4:146193/113‑1 (MQ=255) atcatAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGaaaga > 8:366725/1‑137 (MQ=255) tcatAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGaaagaaag < 5:374575/139‑1 (MQ=255) tAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata < 3:19186/103‑1 (MQ=255) tAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAata > 4:19186/1‑103 (MQ=255) aTAGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGAc < 7:339215/138‑1 (MQ=255) aGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGc < 3:35574/98‑1 (MQ=255) aGCGTTTTCGTCAAC‑TAT‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGc > 4:35574/1‑98 (MQ=255) gTCAAC‑T‑ATTTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAGGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCa < 3:287951/139‑1 (MQ=255) gTCAAC‑T‑ATTTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTc < 7:366725/138‑1 (MQ=255) | CGCCAACGAATAAAGGACACAGCGATCC‑TTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTGAGAATACGCTTTCATCATAAATTATGATAGCGTTTTCGTCAAC‑T‑G‑TTTTTT‑AGTTAAATAGTTTGATAAAACTTTTAGACAAAAATTCGTAAAAACTATTTGTGAAAAACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAACCATCAAAGAAAGCAGGAAAAAACAATGGAAACTCA > CP006881/3722929‑3723197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |