| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 214,982 | C→T | 100% | A268V (GCC→GTC) | U712_00980 → | Uncharacterized protein skfB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 214,982 | 0 | C | T | 98.9% | 269.9 / ‑6.2 | 83 | A268V (GCC→GTC) | U712_00980 | Uncharacterized protein skfB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); major base T (39/40); minor base G (0/2); total (40/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
AGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATGG > CP006881/214852‑215115 | aGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCgg < 7:284889/139‑1 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg < 7:57388/139‑1 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg < 7:136211/139‑1 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg < 6:75439/139‑1 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg > 6:172361/1‑139 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGAggg > 2:48046/1‑139 (MQ=255) acgcggcTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGTGTGCt < 3:48298/137‑1 (MQ=255) gaaagTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTg < 2:52022/139‑1 (MQ=255) agTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAg > 6:53336/1‑139 (MQ=255) tATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCGGGa < 7:282345/139‑1 (MQ=255) tGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGaaa < 8:189966/139‑1 (MQ=255) tGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGaa < 5:246935/138‑1 (MQ=255) ccATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt < 7:127775/139‑1 (MQ=255) cATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa > 8:114134/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 3:25257/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 4:104883/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 7:61280/1‑139 (MQ=255) aaaaTTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGAGCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGtt < 8:146877/139‑1 (MQ=255) aaaaTTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGtt < 8:268757/139‑1 (MQ=255) tCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTg < 3:19366/139‑1 (MQ=255) aaGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCATATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCTGTTGCTTTTATCTTTCGTGCAGTAAAAACGTTATCTGTTGGAAGTGCGa > 8:120310/1‑138 (MQ=255) cAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTTCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 5:172361/139‑1 (MQ=255) cAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 2:176654/139‑1 (MQ=255) cAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 5:270768/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTCTGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 4:120617/139‑1 (MQ=255) cAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttta < 7:103706/138‑1 (MQ=255) tGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggctttaaggc < 5:53336/139‑1 (MQ=255) aTTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggctttaaggctt > 4:219281/1‑139 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTg > 2:81581/1‑138 (MQ=255) cTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 2:125195/119‑1 (MQ=255) cTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 1:125195/1‑119 (MQ=255) taacaaTTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGAGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGa > 8:134223/6‑139 (MQ=255) aTTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTg < 4:123435/139‑1 (MQ=255) caGTCCAATGCTGAAGAAGTATCAGATGTCGGGGAGCAATGTGGCACTGCGCGTCCTTTT‑TCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAGCTGTGGGACGTGCGTCAGAAGGCTGTAAGGCTTTGGATATTGATTTTgaagaatt < 4:220615/138‑3 (MQ=255) aGTCCAATTCTGATGAAGTCTCAGATGTGGTGGATCAATGTGGCAATGCGGGTTCTTTTATATTTCGTGCAGGAAAAAAGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGTCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 6:39269/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 2:20086/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 4:47519/139‑1 (MQ=255) gTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 7:117171/138‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 3:17028/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 1:212038/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 3:282870/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 6:287907/1‑139 (MQ=255) aaTGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTc < 7:62328/139‑1 (MQ=255) tGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 4:191177/1‑97 (MQ=255) tGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 3:191177/97‑1 (MQ=255) gatgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 1:79924/1‑138 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCTATGTGTCAATGAGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 4:131591/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTGAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 4:195192/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 1:283457/1‑92 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 2:283457/92‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 7:134223/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 1:261961/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 8:61280/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 5:287907/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 4:48449/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 3:26546/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 3:245422/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACa > 5:69685/1‑139 (MQ=255) aaGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCt < 6:69685/139‑1 (MQ=255) gTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGCAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCt > 7:215985/1‑137 (MQ=255) gTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCt > 4:1060/1‑137 (MQ=255) tCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGATGAAATGGTTCAAATACAGCTTAgg > 8:85404/1‑138 (MQ=255) tCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGt > 8:197505/1‑122 (MQ=255) tCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGt < 7:197505/122‑1 (MQ=255) aGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggctttaaggct > 1:61209/1‑94 (MQ=255) aGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggctttaaggct < 2:61209/94‑1 (MQ=255) aGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTTGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAggt > 7:89452/1‑136 (MQ=255) aGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAggg > 3:107741/1‑137 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGc < 1:8289/42‑1 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGc > 2:8289/1‑42 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 6:97423/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 7:187224/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 5:32831/1‑139 (MQ=255) gtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 6:282143/75‑1 (MQ=255) gtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 5:282143/1‑75 (MQ=255) gAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTTAGGCTTTTGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCAt < 1:48046/138‑1 (MQ=255) aTGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATgg > 3:200152/1‑139 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt > 4:269241/1‑101 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 3:269241/101‑1 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt > 2:131535/1‑101 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 1:131535/101‑1 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCaaa < 2:280590/109‑1 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCaaa > 1:280590/1‑109 (MQ=255) | AGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATGG > CP006881/214852‑215115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |