Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,529,258 | T→C | Y280C (TAT→TGT) | U712_12985 ← | Uncharacterized protein yrkH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,529,258 | 0 | T | C | 98.2% | 409.0 / ‑2.0 | 112 | Y280C (TAT→TGT) | U712_12985 | Uncharacterized protein yrkH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (61/49); total (62/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
AAACCATGGTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTATAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGCCAATCG > CP006881/2529129‑2529393 | aaCCATGGTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGtttt < 2:355804/139‑1 (MQ=255) aCCATGGTTATCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCTTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTATATCCTTTGATAACGCTTAGTAACGGATACAAAGCGatttt > 1:372630/1‑139 (MQ=255) ggTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTa > 8:287943/1‑138 (MQ=255) ggTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTa > 6:447780/1‑138 (MQ=255) ggTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCAATCTCATTTAGCTCGCCAATGATCATAAAGTGTGACTGTAATACAAATAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACTGCTATAAAGCGTTTTTCTTa > 5:351554/1‑138 (MQ=255) ggTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCAAACTCATTTAGCTCGTCAATCATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTATGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGATTATCTTa > 5:329412/1‑138 (MQ=255) gTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTaa < 7:49796/138‑1 (MQ=255) gTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTaa < 3:112792/138‑1 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCACCACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTcc > 3:454948/1‑138 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAtctc < 8:22437/137‑1 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAtctc < 2:464376/137‑1 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAtctc < 5:77588/137‑1 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTcc > 1:31365/1‑138 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTcc > 5:286690/1‑138 (MQ=255) gCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTcc > 8:479700/1‑138 (MQ=255) agataatGTACTTAGTAGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGCTAATACACTTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTAcc < 3:263925/137‑1 (MQ=255) aataatGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTcccg > 1:460839/1‑138 (MQ=255) aataatGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTAcc < 8:109396/138‑1 (MQ=255) ataatGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTAccc > 6:69395/1‑138 (MQ=255) atGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATTAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAAtc < 8:3531/139‑1 (MQ=255) atGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAAtc < 7:479700/139‑1 (MQ=255) ttAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCTTTTTTCTTAAATCTCCTACCAAATCTACTGc > 2:284646/1‑139 (MQ=255) ttAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGc > 1:269529/1‑139 (MQ=255) aGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCa < 6:173389/128‑1 (MQ=255) aGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCa > 5:173389/1‑128 (MQ=255) aGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGcc > 4:426924/1‑138 (MQ=255) aGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCa > 7:72001/1‑139 (MQ=255) aGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCa > 3:268631/1‑139 (MQ=255) aGTTGTTTACCAACACTACCATTCTCATTTAGCACGACAAAGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGCCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAGCTCATCACCAAACTTCTGcct > 4:263925/1‑138 (MQ=255) ttgttTACCAACACTTGCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATa < 6:329412/139‑1 (MQ=255) ttgttTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATa < 6:400744/139‑1 (MQ=255) ttgttTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATa < 7:163334/139‑1 (MQ=255) ttgttTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATa < 5:169798/139‑1 (MQ=255) tACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGCTCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCGTACCCATTCTTCTGCGATACCGGc > 4:286193/1‑139 (MQ=255) tACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAATtctc < 7:28194/114‑1 (MQ=255) tACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAtctc > 8:28194/1‑114 (MQ=255) tACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAtctc < 1:490069/114‑1 (MQ=255) tACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAAtctc > 2:490069/1‑114 (MQ=255) tACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGc > 5:452309/1‑139 (MQ=255) ccAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCt < 2:31365/138‑1 (MQ=255) acacTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAgt > 2:326077/1‑139 (MQ=255) acacTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAgt > 2:377216/1‑139 (MQ=255) aTTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAgtctggtctg < 8:100790/139‑1 (MQ=255) tcATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGa > 6:156998/1‑139 (MQ=255) aTTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGAtt > 3:75384/1‑139 (MQ=255) aTTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGAtt > 6:392608/1‑139 (MQ=255) ttAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGTCTAAGTCTGGTCTGCCGATTg > 8:49284/1‑138 (MQ=255) gCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAAt < 2:269529/138‑1 (MQ=255) gCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATc < 4:443329/139‑1 (MQ=255) tCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATAc < 3:342540/106‑1 (MQ=255) tCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATa > 8:155254/1‑138 (MQ=255) aTCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAAc > 5:429412/1‑135 (MQ=255) aTAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGatat < 7:155254/139‑1 (MQ=255) aTAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGatat > 8:139559/1‑139 (MQ=255) aTAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGata > 2:248596/1‑138 (MQ=255) tgtgTCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTg < 6:370638/139‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTg < 4:214213/139‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTg < 2:398377/139‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTg < 1:281383/139‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTg < 5:69395/139‑1 (MQ=255) tgCCTGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 1:136841/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAATTCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 7:24010/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 6:313939/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 1:60110/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 6:211079/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 1:280221/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 5:4313/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa < 4:454948/138‑1 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 5:226610/1‑138 (MQ=255) tgCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGACGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGa > 7:452198/1‑138 (MQ=255) gCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTAcc > 5:159125/1‑72 (MQ=255) ccGGTAATTCAATTATATGGTTTGATTACGCTTTGTAACGGCTACATAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACGTGaaa < 1:284646/138‑1 (MQ=255) cGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAaaga < 3:68893/139‑1 (MQ=255) cGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAaaga < 5:318300/139‑1 (MQ=255) aTACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAAtc < 1:476171/70‑1 (MQ=255) aTACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAAtc > 2:476171/1‑70 (MQ=255) aaaTCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCa < 2:436248/138‑1 (MQ=255) aaTCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTATTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGTTATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATc > 6:324512/1‑139 (MQ=255) cTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATCCCGGCTAAGTCTGGTCTACCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACa < 8:346020/139‑1 (MQ=255) tttGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCGAAGTCTGGTCTGCCGCTTGAATAAATAAACAATAGATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACaa > 5:279094/1‑139 (MQ=255) tGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAaaga < 5:113807/118‑1 (MQ=255) tGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAaaga > 6:113807/1‑118 (MQ=255) tGATAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACaa < 2:280221/137‑1 (MQ=255) aTAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCTGATAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGa < 3:362469/138‑1 (MQ=255) aTAACGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGa < 6:178585/138‑1 (MQ=255) aaCGCTATGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAaag < 4:14143/139‑1 (MQ=255) aCGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAaag < 4:75384/138‑1 (MQ=255) cGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAaagaa > 6:151169/1‑139 (MQ=255) cGCTTTGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAaag > 1:306534/1‑137 (MQ=255) tGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGc > 6:261437/1‑58 (MQ=255) tGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGc < 5:261437/58‑1 (MQ=255) tGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTg > 1:332742/1‑137 (MQ=255) tGTAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTg > 1:74379/1‑137 (MQ=255) tAACGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGc < 2:306534/139‑1 (MQ=255) cGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGTAGCCaa > 4:35954/1‑139 (MQ=255) cGGCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGCCa > 4:16069/1‑138 (MQ=255) gCTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTATGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACACGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGCCaa > 6:267592/1‑137 (MQ=255) cTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTCCCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTGTGGTCGGCCGATTGAATCAAAAAACAAGATATCACCTGATAGAAGATACTGGTCTTCGACAATCAAAGAAGTGTCGCCAATCg > 2:483129/1‑139 (MQ=255) cTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGCCAATCg > 7:326238/1‑139 (MQ=255) cTACAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGCCAATCg > 4:407271/1‑139 (MQ=255) | AAACCATGGTTCTCGCTAAATAATGTACTTAGTTGTTTACCAACACTTCCATTCTCATTTAGCTCGTCAATGATCATAAAGTGTGCCGGTAATACAATTAAATCCTTTGATAACGCTTTGTAACGGCTATAAAGCGTTTTTCTTAAATCTCCTACCCAATCTTCTGCCATACCGGCTAAGTCTGGTCTGCCGATTGAATCAATAAACAAGATATCACCTGAAAGAAGATACTGGTCATCGACAATGAAAGAAGTGGAGCCAATCG > CP006881/2529129‑2529393 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |