| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 214,982 | C→T | A268V (GCC→GTC) | U712_00980 → | Uncharacterized protein skfB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 214,982 | 0 | C | T | 97.8% | 439.8 / 0.3 | 136 | A268V (GCC→GTC) | U712_00980 | Uncharacterized protein skfB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base T (64/68); total (67/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATGGGGAG > CP006881/214852‑215119 | aGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCgg < 5:459939/139‑1 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg > 3:466086/1‑139 (MQ=255) tttAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCt > 8:284428/1‑139 (MQ=255) tttAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGGCAATGCGGGTGCTTTTATCt > 3:105468/1‑139 (MQ=255) tAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCtt < 8:110690/138‑1 (MQ=255) gaaagTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTg < 8:25504/139‑1 (MQ=255) agTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAg > 7:131348/1‑139 (MQ=255) aaTACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGaaaa < 8:452386/138‑1 (MQ=255) aCCATTAAAAAATTATCAGAAGCACACATTCCAGTGATTGTCGCTCTGACCATTAATGAGGCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGt < 2:460569/139‑1 (MQ=255) ccATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGt < 3:225526/138‑1 (MQ=255) cATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa > 1:305677/1‑139 (MQ=255) cATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa < 8:466215/139‑1 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 6:427945/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt < 2:268659/139‑1 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCGTTTATCTTTCGTGCAGGAAAACCGTTAt > 5:387649/1‑139 (MQ=255) ttATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGAc > 8:297669/1‑139 (MQ=255) aTCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACg < 4:466086/138‑1 (MQ=255) aTCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGt > 1:4741/1‑139 (MQ=255) aTCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGt > 3:383236/1‑139 (MQ=255) tCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTg < 7:297669/139‑1 (MQ=255) tCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTg < 4:229906/139‑1 (MQ=255) cAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 7:188890/139‑1 (MQ=255) cAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 4:92244/139‑1 (MQ=255) cAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 4:71190/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGGAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTTCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 1:121899/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 3:61010/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 1:300819/139‑1 (MQ=255) tCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa < 7:287038/112‑1 (MQ=255) tCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggctt > 5:1679/1‑138 (MQ=255) tCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 4:478180/1‑133 (MQ=255) cAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttta < 1:239510/138‑1 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTgg > 2:389934/1‑139 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTAt > 3:79575/1‑80 (MQ=255) cGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTg > 2:99048/1‑136 (MQ=255) cGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTg < 1:99048/136‑1 (MQ=255) cGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGa > 6:347975/1‑138 (MQ=255) tGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTTGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTTTATGTAGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGATTTGGATATTGa > 1:240209/1‑139 (MQ=255) tGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCt > 2:336275/1‑68 (MQ=255) tGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGa > 1:234737/1‑139 (MQ=255) aCCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTTGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGAtt < 8:131348/139‑1 (MQ=255) ttAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTg > 6:135803/1‑138 (MQ=255) tGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTgaagaa < 8:383805/139‑1 (MQ=255) gAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGaaa > 3:239041/1‑139 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 7:416710/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 7:284428/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGGGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 2:329488/139‑1 (MQ=255) agtcAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATg > 1:459753/4‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg > 1:481660/1‑50 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaagg < 4:295746/104‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaagg < 4:302174/104‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaagg > 3:295746/1‑104 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGGTTTACGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 6:348290/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGAtt > 5:479033/1‑127 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGAtt < 6:479033/127‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 4:160525/137‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 4:185958/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 2:276304/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 1:105859/1‑139 (MQ=255) ccAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGt < 2:278599/139‑1 (MQ=255) cAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGt < 1:389934/138‑1 (MQ=255) tGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCa > 5:102364/1‑138 (MQ=255) gatgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 3:213890/1‑138 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa > 6:312368/1‑71 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa < 5:312368/71‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 5:166384/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 8:267723/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 7:406861/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 1:398155/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 2:4741/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 5:347975/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 5:209042/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 3:208784/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 3:53217/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTCATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 5:135345/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGCGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGGTATCTGTTGGACGCGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 6:187787/137‑1 (MQ=255) aTCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttta > 6:457331/1‑92 (MQ=255) tCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAgg > 5:470183/1‑138 (MQ=255) aGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAggg > 2:400602/1‑137 (MQ=255) gATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 3:457579/139‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 3:185958/139‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 3:355331/124‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCa < 6:135345/139‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCa < 2:450092/139‑1 (MQ=255) gtggtgGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCAc > 8:327600/1‑139 (MQ=255) tggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACg > 1:160137/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTTCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 4:429968/134‑1 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt > 5:20192/1‑54 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt < 6:20192/54‑1 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg > 3:429968/1‑134 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCAc > 7:485236/1‑137 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 5:338576/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt < 4:383236/139‑1 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 2:210131/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 2:293358/1‑139 (MQ=255) gAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATa < 8:217171/139‑1 (MQ=255) gCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATaaa > 2:354905/1‑139 (MQ=255) aTGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 7:190251/1‑67 (MQ=255) aTGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 8:190251/67‑1 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATggg > 6:31857/1‑139 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATggg < 6:177212/139‑1 (MQ=255) | AGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATGGGGAG > CP006881/214852‑215119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |