Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,564,138 | Δ1 bp | 5.1% | coding (180/870 nt) | U712_13180 ← | putative HTH‑type transcriptional regulator yraN |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,564,138 | 0 | T | . | 5.1% | 269.4 / 6.2 | 78 | coding (180/870 nt) | U712_13180 | putative HTH‑type transcriptional regulator yraN |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/39); new base . (2/2); total (37/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTGAGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGTTTTTGTTACACTTTG > CP006881/2564009‑2564272 | ttGAGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGt < 2:96944/138‑1 (MQ=255) ttGAGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa < 6:275320/139‑1 (MQ=255) ttGAGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa < 3:326503/139‑1 (MQ=255) ttGAGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa < 6:368997/139‑1 (MQ=255) aGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAg > 5:267196/1‑139 (MQ=255) aGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAg > 2:368821/1‑139 (MQ=255) aGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAg > 2:362897/1‑139 (MQ=255) cGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa > 7:24582/1‑134 (MQ=255) cGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa < 8:24582/134‑1 (MQ=255) cGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAgg > 7:344239/1‑138 (MQ=255) gAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGATGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGt > 2:154565/1‑138 (MQ=255) aaaTTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 1:187300/139‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 1:310979/139‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 5:356834/139‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 6:170522/139‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 8:393676/139‑1 (MQ=255) gATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCttt < 1:99533/137‑1 (MQ=255) gATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAAATCCttt < 1:368821/137‑1 (MQ=255) gATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAAATCCttt < 1:362897/137‑1 (MQ=255) aTACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTAt < 7:241034/138‑1 (MQ=255) ccAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCtttt > 1:70556/1‑139 (MQ=255) gCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGt > 6:159017/1‑139 (MQ=255) aGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa > 4:224099/1‑108 (MQ=255) aGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa < 3:224099/108‑1 (MQ=255) aGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGaa < 4:168945/137‑1 (MQ=255) gTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 3:269014/111‑1 (MQ=255) gTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa > 4:269014/1‑111 (MQ=255) ccTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATaattcaa > 5:198595/1‑139 (MQ=255) ccTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATaattcaa > 7:143408/1‑139 (MQ=255) ccTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTAGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATACTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTACTCCTTACGCAGTAAAGGTAATTCCTTAATGCCTTTTGGTGAATaattca > 7:38372/1‑138 (MQ=255) cTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATaattcaat > 7:297731/1‑139 (MQ=255) cTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATaattcaat > 6:71812/1‑139 (MQ=255) tGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATACTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGAAAAGGTAATTCCTTTAGGCCTTTTGGTGAATaattcaattc > 2:431393/1‑139 (MQ=255) gCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCATTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTcc > 3:378690/1‑139 (MQ=255) ctTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa > 1:348346/1‑92 (MQ=255) ctTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTa < 2:348346/92‑1 (MQ=255) tttGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAATGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAAtc > 3:336633/1‑139 (MQ=255) tGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAAt < 8:297731/136‑1 (MQ=255) cTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATctcct < 5:91749/139‑1 (MQ=255) agattagaGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCaa > 5:406533/1‑139 (MQ=255) agaTATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 2:56448/84‑1 (MQ=255) agaTATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa > 1:56448/1‑84 (MQ=255) agaTATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCttttt > 1:406966/1‑139 (MQ=255) agaTATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCtttt > 7:307947/1‑138 (MQ=255) atatGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCa < 6:198595/139‑1 (MQ=255) tGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCTGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAcc > 5:128397/1‑139 (MQ=255) tGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAcc > 8:75167/1‑139 (MQ=255) tGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAcc > 1:184326/1‑139 (MQ=255) tGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAcc > 5:343462/1‑139 (MQ=255) tGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAcc > 4:27086/1‑139 (MQ=255) tGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAcc > 5:182508/1‑139 (MQ=255) aTCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCC‑TCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGa > 6:272174/1‑138 (MQ=255) aTCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCC‑TCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAAACGa > 6:266414/1‑138 (MQ=255) tttGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGAATTATTCTTGCATAAGAAAACAAGTGTTATCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACTGAt > 5:90605/1‑137 (MQ=255) tGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAATTCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAg < 1:419889/138‑1 (MQ=255) tGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGAt < 3:55428/135‑1 (MQ=255) tGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGAt < 4:228494/135‑1 (MQ=255) tGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATaatt > 3:228494/1‑137 (MQ=255) tGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAg < 8:307947/138‑1 (MQ=255) tGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAg < 2:406966/138‑1 (MQ=255) tGGTATCATGAAGGTCCTGTATCATTCTTCTTGCATAAGCAAACAAGTGTTCTCCTTACGCAGTAAAGGTAATTACTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATa < 4:267795/136‑1 (MQ=255) aGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCt < 5:207674/139‑1 (MQ=255) aGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCAGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTCGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCt < 5:7467/139‑1 (MQ=255) ccTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCtgtg < 6:182508/138‑1 (MQ=255) cTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGAt < 6:267196/139‑1 (MQ=255) ttcttcTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa < 2:46801/48‑1 (MQ=255) ttcttcTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTaa > 1:46801/1‑48 (MQ=255) ttcttcTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAaataa < 4:205276/139‑1 (MQ=255) gCATAAGCAACCAAGTGTTCTCC‑TCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTc < 5:272174/136‑1 (MQ=255) gCATAAGCAACCAAGTGTTCTCC‑TCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTc < 5:266414/136‑1 (MQ=255) aGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGt < 6:406533/138‑1 (MQ=255) aGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACAGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCTTACTGCTGtt > 2:398751/1‑139 (MQ=255) gCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGttt < 8:411139/139‑1 (MQ=255) cAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGTTTTTGtt < 4:119323/139‑1 (MQ=255) cAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGTTTTTGtt < 3:27086/139‑1 (MQ=255) cAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTATGATGTAAATAATCGTTCTGCTGTTTTTGtt < 8:344239/139‑1 (MQ=255) ttCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTATATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGAGAAGTGATGGAAGGCTGTGCTGTAAATAATCGTGCTGCTGTTTTTGGTacacgt > 7:338784/1‑137 (MQ=255) ctcCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGTTTTTGTTACACTTTg > 7:226708/1‑139 (MQ=255) | TTGAGCGAAATTGCTTGATACCCCCAGCCTTAGATGTCCTTGCACCTCTTTGCTTAGATTAGAGATATGATCTTTGGTATCTTGAAGTTCCTGTAGCATTCTTCTTGCATAAGCAACCAAGTGTTCTCCTTCCGCAGTAAAGGTAATTCCTTTATGCCTTTTGGTGAATAATTCAATTCCGAAAATCTCCTCAATCTTTTTCAACCGATAAGTGATGGAAGGCTGTGATGTAAATAATCGTTCTGCTGTTTTTGTTACACTTTG > CP006881/2564009‑2564272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |