| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 3,894,527 | G→T | 15.3% | Q49K (CAA→AAA) | U712_20080 ← | Inositol 2‑dehydrogenase/D‑chiro‑inositol 3‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 3,894,527 | 0 | G | T | 15.3% | 141.8 / 5.1 | 64 | Q49K (CAA→AAA) | U712_20080 | Inositol 2‑dehydrogenase/D‑chiro‑inositol 3‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (15/38); new base T (9/2); total (24/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.48e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAACACATATTTCTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCAATACGTA > CP006881/3894390‑3894664 | gAACACATATTTCTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTgg < 5:73708/139‑1 (MQ=255) aaCACATATTTCTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTAATTTGt > 7:397615/1‑139 (MQ=255) tCTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTTATTGGTTTTTCtgatc > 1:409678/1‑135 (MQ=255) tCTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTAATTGGTATTGCTC‑AAc > 5:386600/1‑139 (MQ=255) cTGGTCTTTAATCGCATTCAGCACGCTTGACTCATGCGGAGGCCCCCAGCTTGTGACTTTTACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCTTCATTCGGTTAATCCGTCGGG‑TTTAATTGGTATTGCTG‑AACg < 4:31233/139‑1 (MQ=255) cTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AAc < 1:210138/138‑1 (MQ=255) ggCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACg < 8:45001/136‑1 (MQ=255) ggCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACg < 8:379271/136‑1 (MQ=255) ggCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACg < 3:240034/136‑1 (MQ=255) gCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGAcca > 7:429936/1‑138 (MQ=255) cTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑tt < 3:69241/139‑1 (MQ=255) tAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTCCATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCTTCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTAATTTTTATTGATT‑AAAGAccagttg > 6:49359/1‑134 (MQ=255) tAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTTATTGGTATTTCTC‑AACGACC‑GTTtg > 3:422535/1‑139 (MQ=255) aTCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTtgtg < 5:224005/139‑1 (MQ=255) aGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGcttctt < 3:114662/139‑1 (MQ=255) cGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGGATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGGATCTTCTTGA‑t > 8:344655/1‑138 (MQ=255) gACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAAc < 8:130532/137‑1 (MQ=255) aTGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGTATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGt < 7:344655/138‑1 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACATCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTa < 3:144252/139‑1 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAATCAAGCTGTCATCAATCGGATAAACCGTCGCG‑TTTTATTTGTTTTTCTC‑AACGACCATTTTGTG‑AGGTTATTGT‑TTAAAATGCgat > 4:144252/1‑136 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTa < 6:386600/139‑1 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTa < 3:288722/139‑1 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCGA‑AACGACC‑GTTTGTGCAGCGTCTTGA‑TTAACATCCGtt > 4:349498/1‑138 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTAATTTGTATTTCTCAAACAACC‑TTTT‑TTAAGCTTCATGA‑TTAAAAtaactt > 1:122494/1‑133 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTAAATGGTATTGCTC‑AACCACC‑ATTTGTGCCTCTTATTGA‑TTAACATCCGtt > 2:27759/1‑138 (MQ=255) tGCGCAGGCCCCCACCTAGTCACTAAAACAGCGGCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGGCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑ATTTGTTGAGCTCCTGGA‑AAAACAACCGATa > 2:242520/1‑139 (MQ=255) cgcAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCACGGTAGTGA‑TTAAAATCCGTTAcg > 8:434495/1‑138 (MQ=255) gcAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAg < 5:300702/139‑1 (MQ=255) gcAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGAGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTTGTATTGCTC‑AACTACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGGTACAg < 5:306831/139‑1 (MQ=255) gCCCCCCGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTTCTG‑AACGAAC‑GTTTGTGCACCTTCTTTA‑TTAAACAACGTTACAgaga > 6:223194/1‑135 (MQ=255) cAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAAttt < 1:353421/139‑1 (MQ=255) cTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCcg < 3:349498/139‑1 (MQ=255) tGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTATTTTGTATTTCTC‑AAACACC‑ATTTGTTCATCTTGTTGA‑TTTACAAACGTTTAAGCTAAAAATTAcgcc > 4:420362/1‑138 (MQ=255) tGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTTATTTGTTTTTGTG‑GACGAGC‑TTTTTTGGAGGTTGTGGA‑TTTAAAACCGTTTCATCTACAATTTTcgag > 3:255835/1‑137 (MQ=255) cttaaaCAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGCTAAACCGGCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGa < 8:206938/136‑1 (MQ=255) aGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCGTTTTATTTGGTTTTG‑GA‑AACGCCC‑GGTTTTGCAGCTTCTTGATTTAAAAACCG‑TACAGCCTCAATTTAAGCGCCGGACaccagg > 6:129152/1‑134 (MQ=255) cGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGtt < 5:223194/139‑1 (MQ=255) gTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTc < 5:140316/139‑1 (MQ=255) cATTTTCGGCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTGTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGAt < 5:332821/139‑1 (MQ=255) aTTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCTCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACA‑TTTTGTGAAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATa < 3:330696/139‑1 (MQ=255) aTTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTG‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATa < 1:242520/139‑1 (MQ=255) aTTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATa < 2:139744/139‑1 (MQ=255) aTTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTACTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATa < 3:413697/139‑1 (MQ=255) ttCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTTATTTGTATTTCTC‑AACGCCC‑GTTTTTGGAGCGTCTTGA‑TTAAAATACGGTTAAGCTAAAAATTAACCCCCAGGCAGCGTGTTCGTGATAAgg > 6:363219/1‑139 (MQ=255) tCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAATCCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACgg < 3:88015/138‑1 (MQ=255) tCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGt > 8:2697/1‑127 (MQ=255) tCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGt < 7:2697/127‑1 (MQ=255) tCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACgg < 7:185971/138‑1 (MQ=255) tCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTAGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACgg < 2:183333/138‑1 (MQ=255) cGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTTCTC‑AACGACC‑TTTTTTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGtt > 4:418983/1‑139 (MQ=255) tCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTaa > 8:70413/1‑139 (MQ=255) gcaagcaaGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTTGTTTTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCACCATCTTGA‑TTTACATCCGTTACAGGAACCATTTACCCGCCGGACAGCTTGTTAGTGGTACGGTTTatat > 8:185971/1‑139 (MQ=255) caagcaagCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTACTTGGTAGTGCTC‑AACGACC‑TTGTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAat < 1:183963/136‑1 (MQ=255) caagcaagCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAat < 1:27759/136‑1 (MQ=255) caagcaagCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAat < 6:193606/136‑1 (MQ=255) atTCGGATAAACCGTCGCG‑GTTTATTTGTATTTCTC‑AACGACC‑GTTTTTTGAGCTTGTTGT‑TTTACATACGTTTCAGCGAAAATTTGCCCGCCGGCCAGCGGGTTCGGTTTTAGGTTATTTTGTTGTTTTACGATTTCt > 8:322788/1‑139 (MQ=255) ttCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTc < 8:397615/139‑1 (MQ=255) tCGGATAAACCGTCGCG‑TTTTATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑GTTTTTGCAGGTTCTTTA‑TTAAAAACAGTTACAGCTAAAATTTACGCGCCTGACACCATGTTCGTGATTCGGGTAATATGTTATTTTACGATTGcag > 6:238055/1‑136 (MQ=255) ccGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAAt < 7:415321/139‑1 (MQ=255) ccGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAAt < 3:420362/139‑1 (MQ=255) ccGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAAt < 7:70413/139‑1 (MQ=255) cg‑TTTAATTTGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTTCAGCTTCTTGC‑TTAACATGCGTTACAGCTTCAATTTCCGCGGCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTACGATTGCTCCAGTTCCAATTAAGcc < 8:252771/139‑1 (MQ=255) cg‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGcc < 7:434495/139‑1 (MQ=255) g‑TTTAATTGGGATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCa < 2:409678/139‑1 (MQ=255) tttAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCaa < 7:322788/139‑1 (MQ=255) ggTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCAATACGTa < 5:363219/138‑1 (MQ=255) ggTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCAATACGTa < 5:129152/138‑1 (MQ=255) ggTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCAATACGTa < 7:365657/138‑1 (MQ=255) | GAACACATATTTCTGGGCTTTAATCGCTTTCAGCACGCTTGACTCATGCGCAGGCCCCCAGCTTGTCACTAAAACAGCGTCTACATTTTCGTCTGCAAGCAAGCTGTCATCATTCGGATAAACCGTCGCG‑TTTAATTGGTATTGCTC‑AACGACC‑TTTTGTGCAGCTTCTTGA‑TTAACATCCGTTACAGCTACAATTTCCGCGCCTGACAGCTTGTTCGTGATACGGTTAATATGTTCTTTTCCGATTGCTCCAGTTCCAATTACGCCAATACGTA > CP006881/3894390‑3894664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |