Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,017,350 | G→A | 5.6% | W18* (TGG→TGA) ‡ | U712_09990 → | Prophage‑derived protein uncharacterized protein yozM |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,017,350 | 0 | G | A | 5.6% | 224.9 / 3.0 | 72 | W18* (TGG→TGA) ‡ | U712_09990 | Prophage‑derived protein uncharacterized protein yozM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/27); new base A (2/2); total (42/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 |
ATAAAATATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATGGATCAAACCAA > CP006881/2017216‑2017484 | ataaAATATAAACGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTTTGATTGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTTGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGta < 5:18889/139‑1 (MQ=255) taaAATATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGtat < 4:253464/139‑1 (MQ=255) taaAATATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGtat < 8:197404/139‑1 (MQ=255) taaAATATAAAGGTACATATTGATATCCGTAGTATTAATTAAGGAGTGATGCTTTTCGAGGTGGGAGTGTGTGATGGTTAATGAAGAAGAGGCTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGta < 3:365739/138‑1 (MQ=255) aaaaTATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGtat > 3:289409/1‑138 (MQ=255) aaTATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGtat > 7:374678/1‑136 (MQ=255) aaTATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGtat < 8:374678/136‑1 (MQ=255) ataAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAAGtt > 7:222952/1‑138 (MQ=255) aataatGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAAt > 2:154702/1‑138 (MQ=255) aataatGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAAt > 5:205456/1‑138 (MQ=255) aataatGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTGTAATCGAAt > 5:335513/1‑138 (MQ=255) ataatGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATca < 3:15391/139‑1 (MQ=255) atGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGCGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATcaaac < 3:116059/139‑1 (MQ=255) tGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATcaaac > 2:320652/1‑138 (MQ=255) atatCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATcaaacaa > 3:399333/1‑138 (MQ=255) gtaTTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGta > 6:225557/1‑107 (MQ=255) gtaTTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGta < 5:225557/107‑1 (MQ=255) taaaaaaaGGAGACTTTCTTTTCGACGCGGTCTAGTGTGATGGGCATTGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTTGTTCCTGCTTTGATTTTGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAACGACCCCTGTa < 2:123661/134‑1 (MQ=255) aataaAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAg < 1:154702/138‑1 (MQ=255) ataaAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCATACAAAAAGACCCCTGTAg > 4:180509/1‑137 (MQ=255) ataaAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAg > 1:324522/1‑137 (MQ=255) ggAGGGATTCTTTTCCATGAAGGAGAGTGTAATGGTTAATGAAGAAGAGGCTAATCGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTCAGGta < 3:439780/96‑1 (MQ=255) ggAGGGATTCTTTTCCATGAAGGAGAGTGTAATGGTTAATGAAGAAGAGGCTAATCGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTCAGGta > 4:439780/1‑96 (MQ=255) ggAGGGATTCTTTTCCATGAAGGAGAGTGTAATGGTTAATGAAGAAGAGGCTAATCGCATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTCAGGTATTACTTTAATCGAAGCAAATAAAAAGTCCCCTTTGGAAGtaat > 8:348606/1‑136 (MQ=255) ggAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGttt > 3:258280/1‑138 (MQ=255) ggAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGttt > 6:331091/1‑138 (MQ=255) ggAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGttt > 6:382496/1‑138 (MQ=255) ggAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACACCTGAAGAAGtttt > 5:27753/1‑139 (MQ=255) gagaTTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGa < 5:277379/139‑1 (MQ=255) agaTTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGa > 8:17651/1‑138 (MQ=255) aTTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAg > 7:99413/1‑139 (MQ=255) aTTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAg > 2:361362/1‑139 (MQ=255) tttCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCtt > 8:164081/1‑139 (MQ=255) tttCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCtt > 3:177927/1‑139 (MQ=255) tttCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCtt > 7:423533/1‑139 (MQ=255) ttgagccgaGGGAGAGTGTTCTTGTGAATGAAGAATAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTTGTTCCTGCTTTTTTTATGTGGGGTATAACTTTAATCTAATAAAAAAAAACGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCt < 4:51864/132‑1 (MQ=255) gacgaGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAACGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTggg < 7:403477/138‑1 (MQ=255) gacgaGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTggg < 5:382496/138‑1 (MQ=255) cgaGGGATAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGTGGTTAATTGTATTTTTTGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGTTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGa < 6:205456/137‑1 (MQ=255) ggattgtgtGATTGTGAATTAAGAAGCGTTTTTTTGTATTTTTGGTCTTAGTTGTTTCTTTGTTTATGTGGGGTATAATTTTAATCGAATAAAAAAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAAt < 6:27753/133‑1 (MQ=255) gagaGTTTGATGGTGAATGAATACTCGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTGCCTGCTTTTATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAAttt < 5:82427/139‑1 (MQ=255) aTGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTAttt > 5:70361/1‑139 (MQ=255) aTGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCAGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTAtt > 2:116813/1‑138 (MQ=255) tgaatgaaGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGtt > 5:211414/1‑139 (MQ=255) gaatgaaGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGttt > 1:378036/1‑139 (MQ=255) aatgaaGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGtttt > 5:280518/1‑139 (MQ=255) aatgaaGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGtttt > 6:25438/1‑139 (MQ=255) tgaaGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGTTGAATTTGGGTTATTTAGTTTTg > 1:328275/1‑138 (MQ=255) aagaagAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGaaa > 5:131795/1‑139 (MQ=255) aagaagAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGaa < 2:378036/138‑1 (MQ=255) agaagaGGTTAATTGGTTTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTTATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAAt < 6:209888/139‑1 (MQ=255) gTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAAt > 6:251849/1‑138 (MQ=255) gTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAAt > 8:232970/1‑138 (MQ=255) gTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAAt > 5:3141/1‑138 (MQ=255) gTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAAt > 8:409411/1‑138 (MQ=255) tAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATaa > 7:387236/1‑138 (MQ=255) tttttGGTCTTAGTTCATTCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAAAAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCg < 3:362142/138‑1 (MQ=255) ttttGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCgg > 5:139869/1‑138 (MQ=255) tGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAAt > 4:334905/1‑139 (MQ=255) ggTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAAt < 6:139869/138‑1 (MQ=255) ggTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAAt < 7:164081/138‑1 (MQ=255) ggTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTCAGGTATTACTTTAATCGAAGCAAATAAAAAGTCCCCTTTGGAAGTAATTGATAATATTCGGGATGAATTTGGTATATTCAGTGTGCAAATTGGTCAAACAGATCCGGCAAt < 7:348606/138‑1 (MQ=255) tAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACaa < 7:17651/138‑1 (MQ=255) aGTTCCTTCTTTTATTAGTTGGGGTATAAATTTATTCTAATAAAACAAAACGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACaa < 6:269135/137‑1 (MQ=255) aGTTCCTGCTTTGATTATGTGTTTAATAAATTTAATCGAATAAAACAAAACGACCCCTGTATAAGTTTTAGAAAGTTCTTGGGATGAATTTTGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAAt < 1:116813/138‑1 (MQ=255) aGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACaa > 3:208950/1‑137 (MQ=255) aGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACaa < 8:99413/137‑1 (MQ=255) tGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATg > 1:370630/1‑139 (MQ=255) tGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATGGAt < 8:122569/137‑1 (MQ=255) tGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATGGAt < 3:180509/137‑1 (MQ=255) aTTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATGGATCaaa > 6:199508/1‑139 (MQ=255) gtgGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATGGATCAAACCaa > 3:149671/1‑138 (MQ=255) | ATAAAATATAAAGGTCAATAATGATATCCGTAGTATTAATAAAGGAGAGATTCTTTTCGACGAGGGAGAGTGTGATGGTGAATGAAGAAGAGGTTAATTGGATTTTTGGTCTTAGTTCCTGCTTTGATTATGTGGGGTATAACTTTAATCGAATCAAACAAAAAGACCCCTGTAGAAGTTTTAGAAAGTGCTTGGGATGAATTTGGGTTATTTAGTTTTGAAATTGGAATAACAGATCCGGCAATTACAATAGGCATGGATCAAACCAA > CP006881/2017216‑2017484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |