| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2,655 | Δ3 bp | intergenic (–/‑321) | – / → eryR | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 2654 | 23 (0.010) | 6524 (1.800) | 226/252 | 0.0 | 99.6% | intergenic (–/‑324) | –/eryR | –/– |
| ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2658 = | 24 (0.010) | intergenic (–/‑320) | –/eryR | –/– | |||||
Only 100 of 6524 total aligned reads displayed.
GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2517‑2654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2795 ACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCG > 3:328838/1‑137 CTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAG > 7:198636/1‑139 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGC < 7:226247/137‑1 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGGCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGC < 4:239354/137‑1 ATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACT > 4:63792/1‑139 GCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTT > 1:168944/1‑138 GCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTT > 2:35317/1‑138 GCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGC < 1:289439/132‑1 cGGGGATACAATTTACCGCGGCGCCATCTACTTAGGACGTAAAGGATTTGCACGATACAGATATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTCAG < 8:348046/138‑1 TGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGC < 3:12826/130‑1 TGGGGATAATATTTACAGCGGCGCCATATACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCATGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 8:64223/139‑1 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 6:130024/1‑137 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 4:91941/1‑137 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 4:402272/1‑137 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 4:115038/1‑137 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 3:59999/1‑137 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAG < 7:57284/139‑1 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 5:260832/137‑1 GGGATACCATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAG < 8:288347/139‑1 GATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCTTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTG < 2:313452/139‑1 TATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 2:202526/130‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGAT < 7:163411/139‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 1:85074/138‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 1:324066/138‑1 ACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGT > 2:225301/1‑139 ACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAG > 7:12996/1‑125 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CGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAG < 8:226348/120‑1 CGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGC > 8:377067/1‑109 CGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCG < 2:74148/105‑1 ATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTCTGTCTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 7:89712/129‑1 CTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATT < 3:263349/139‑1 CTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATT > 7:399661/1‑139 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ATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGT > 4:148161/1‑138 ATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATA > 5:389949/1‑87 TTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTA > 6:230532/1‑138 TTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 3:156661/71‑1 TTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACAACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTCCAGTATCTTAAAATTATGTGTATAATAGAAATTGAAGTTAAATTAGATGCTA > 1:205231/1‑138 TGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAA > 5:430967/1‑138 TGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTA < 2:255553/68‑1 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T‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATG > 7:25726/1‑139 T‑‑‑‑‑TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATG < 8:40797/139‑1 TGATCCCCGAAGCATACTTAAGAGTGTGTTGATTGTGGAGTATCTTATAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 6:162055/1‑139 TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 1:235817/1‑139 TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 6:385907/1‑139 TGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAAT < 4:175265/63‑1 GATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC < 2:417657/138‑1 GATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCG < 4:301462/117‑1 ATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 1:100339/1‑138 ATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 8:194021/1‑138 ATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG > 5:22482/1‑138 ATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGA > 5:196629/1‑112 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA > 3:432106/1‑139 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTT < 6:51356/50‑1 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTTTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAAT < 8:317426/139‑1 GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGT‑‑‑‑‑TGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2517‑2654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |