| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP006881 | 2010686 = | 152 (1.650) | 72 (0.820) +GTTTTT |
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| ? | CP006881 | = 2010694 | 162 (1.760) | coding (639/660 nt) | U712_09940 | UPF0361 protein yoqW | |||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
GGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGCTATTGCATTCAATAAAAGAGC > CP006881/2010549‑2010824 | ggATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGaa > 1:112469/1‑139 (MQ=255) gATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAAt > 6:115775/1‑139 (MQ=255) aTGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAAt > 1:227840/1‑138 (MQ=255) tCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCt > 1:98398/1‑139 (MQ=255) aCTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCAtt > 5:248848/1‑138 (MQ=255) atgaGAACATAATGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACTAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAAt < 7:401011/138‑1 (MQ=255) atgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGaa < 3:190959/137‑1 (MQ=255) tgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATcc > 4:155280/1‑139 (MQ=255) tgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATcc > 6:288950/1‑139 (MQ=255) tgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATcc > 6:110795/1‑139 (MQ=255) aaaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTa > 4:273738/1‑139 (MQ=255) aaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTTTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAATCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTTAATCCCATTAAGAAc < 5:400405/139‑1 (MQ=255) aaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACTTGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTAc < 7:32540/139‑1 (MQ=255) aaTGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACt > 6:271491/1‑139 (MQ=255) ctgatcctgattatctacaaagcttactgcagccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCata > 5:210619‑M1/96‑139 (MQ=255) aaTCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCata < 2:98398/137‑1 (MQ=255) atcctgattatctacaaagcttactgcagccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCatat > 6:388909‑M1/93‑137 (MQ=255) atcctgattatctacaaagcttactgcagccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCg < 4:235618‑M1/47‑1 (MQ=255) aTCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCg > 5:5699/1‑139 (MQ=255) aTCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCg < 6:168636/139‑1 (MQ=255) cctgattatctacaaagcttactgcagccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCt < 8:135819‑M1/49‑1 (MQ=255) ctgattatctacaaagcttactgcagccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCtt > 5:113543‑M1/90‑139 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aTCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcg < 2:61632‑M2/139‑54 (MQ=255) aTCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatat > 1:181218‑M2/1‑86 (MQ=255) ccTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgct < 4:316825‑M2/139‑56 (MQ=255) cTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCAcctcct < 3:273738/139‑1 (MQ=255) cTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgct > 1:387588‑M2/1‑83 (MQ=255) aTTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCata < 5:286609/115‑1 (MQ=255) agccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTaa > 2:231956‑M1/66‑139 (MQ=255) agccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTa < 2:256778‑M1/73‑1 (MQ=255) gccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAat > 2:158923‑M1/65‑139 (MQ=255) gccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAat > 1:250477‑M1/65‑139 (MQ=255) gccatatgatgctgatgacatggaagcataccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAat > 5:364118‑M1/65‑139 (MQ=255) cAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAat < 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tttcttctTTAGTGATGTCACCTGTGCTCATTGAATCCCATTAATTATCACTGCGATATCGCTTTATATACCACCTTCTCTTAGCTAATATTTTCTTAGTAGGAGGTTGTATTTTGTTTGTATCTCCTATGCTATTGct < 6:258783/137‑2 (MQ=255) tATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGCTATTGCa < 1:369433/139‑1 (MQ=255) tATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGCTATTGCa < 5:338520/139‑1 (MQ=255) tATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGCTATTGCa < 7:304645/139‑1 (MQ=255) attcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGATATTTTGTTTGTATCGCCAATGCTATTGCa > 3:316825‑M1/15‑139 (MQ=255) attcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGATATTTTGTTTGTATCGCCAATGCTATTGCa > 7:245252‑M1/15‑139 (MQ=255) attcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGATATTTTGTTTGTATCGCCAATGCTATTGCa > 7:135819‑M1/15‑139 (MQ=255) attcacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGATATTTTGTTTGTATCGCCAATGCTATTGCa > 6:93116‑M1/15‑139 (MQ=255) ttcATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttctaagtagcaggtgatattttgtttgtatcg < 8:429514‑M2/138‑118 (MQ=255) catctTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttctaagtaggaggtgatattttgtttgtatcgc > 8:366110‑M2/3‑20 (MQ=255) catctTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttctaagtaggaggtgatattttgtttgtatcgc > 6:47201‑M2/3‑20 (MQ=255) cacctaaaaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGATATTTTGTTGGTATCGCCAATGCTATTGCAtt > 4:437772‑M1/12‑138 (MQ=255) ttCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCAcctcct > 6:353019/1‑75 (MQ=255) aaacAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATATCACCTTCGCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGATATTTTGTTTGTATCGCCAATGCTATTGCATTCAATaaaa > 4:354405‑M1/5‑139 (MQ=255) gTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttctaagtaggaggtgatattttgtttgtatcgccaatgcta > 2:174250‑M2/1‑12 (MQ=255) aaTTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGCTATTGCATTCAATAAAAGAGc > 1:144049/1‑139 (MQ=255) | GGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGCTATTGCATTCAATAAAAGAGC > CP006881/2010549‑2010824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |