| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006881 | = 1846853 | 119 (1.290) | 48 (0.630) +ATTCACTAAAGATGAAACCTGG |
22/208 | 1.3 | 29.4% | coding (34/117 nt) | U712_09195 | Hypothetical Protein |
| ? | CP006881 | = 2010666 | 161 (1.750) | coding (611/660 nt) | U712_09940 | UPF0361 protein yoqW | |||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
TTATGGAAGACATTCATGATCGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGC > CP006881/2010528‑2010803 | ttATGGAAGACATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCata > 3:107360/1‑139 (MQ=25)ttATGGAAGACATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCata > 6:364118/1‑139 (MQ=25) aTGGAAGACATTCATGATCGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCatat > 5:168636/1‑138 (MQ=255) aTGGAAGACATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAc < 7:56644‑M2/138‑2 (MQ=255) aTGGAAGACATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAc > 7:260608‑M2/1‑137 (MQ=255) aaGACATTCATGATCGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGt < 4:114488/139‑1 (MQ=255) gACATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggttt > 3:213480‑M2/1‑131 (MQ=255) gACATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggttt > 8:214054‑M2/1‑131 (MQ=255) aCATCCATGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggttt < 2:433665‑M2/138‑9 (MQ=255) tccatGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatc < 3:354405‑M2/137‑13 (MQ=255) tGATCGGATGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatcttta > 6:247562‑M2/1‑123 (MQ=255) tGATCGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTa < 1:374259/139‑1 (MQ=255) tGATCGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTa < 8:306781/139‑1 (MQ=255) cGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTg > 1:255905/1‑138 (MQ=255) cGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGACTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTACATTAGTg > 5:131120/1‑138 (MQ=255) ggATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGaa > 1:112469/1‑139 (MQ=255) gATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAAt > 6:115775/1‑139 (MQ=255) aTGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaatt < 8:408766‑M2/139‑24 (MQ=255) aTGCCGGTTATCCTTACTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaat < 5:93116‑M2/138‑23 (MQ=255) cAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCAcc < 6:408485/139‑1 (MQ=255) aTCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAg < 5:51707/138‑1 (MQ=255) aTCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAg < 8:151626/138‑1 (MQ=255) tCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCt > 1:98398/1‑139 (MQ=255) aaCTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCatat > 4:403923/1‑103 (MQ=255) aaCTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCatat > 4:174251/1‑103 (MQ=255) aCTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaatt < 2:321501‑M2/139‑39 (MQ=255) aCTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaatt < 6:71011‑M2/139‑39 (MQ=255) aCTGATGAGAACGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaatt < 6:4885‑M2/139‑39 (MQ=255) aCTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCAtt > 7:339191/1‑138 (MQ=255) atgaGAACATAATGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACTAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAAt < 7:401011/138‑1 (MQ=255) atgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGaa < 5:219112/137‑1 (MQ=255) tgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATcc > 7:25462/1‑139 (MQ=255) tgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATcc > 6:288950/1‑139 (MQ=255) tgaGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATcc > 4:155280/1‑139 (MQ=255) gagaACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGt < 2:409311/101‑1 (MQ=255) aaCGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgag > 6:140498‑M2/1‑92 (MQ=255) aaCGAAAAGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgag < 5:140498‑M2/138‑47 (MQ=255) gaaaagGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctca > 3:283359‑M2/2‑89 (MQ=255) aaaaaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACACAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAg < 5:422407/139‑1 (MQ=255) aaaaaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAg < 3:170106/139‑1 (MQ=255) aaaGGAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcatt < 6:210619‑M2/139‑53 (MQ=255) aaaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCatat < 6:86454/88‑1 (MQ=255) aaaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTa > 4:273738/1‑139 (MQ=255) aaGGAATTGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTAc < 6:271230/139‑1 (MQ=255) aaGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTTTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAATCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTTAATCCCATTAAGAAc < 5:400405/139‑1 (MQ=255) aGGAATGGCTCACCCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattg < 6:271848‑M2/138‑54 (MQ=255) ggAATGGCTCAACCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaa > 3:411811‑M2/1‑84 (MQ=255) aaTGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTAt > 7:46566/1‑90 (MQ=255) tAAATCTT‑AAAATACTGATACTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGACTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCata < 6:377355/138‑1 (MQ=37) aaCCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaag > 1:433665‑M2/1‑74 (MQ=255) accctaAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaag < 2:199129‑M2/136‑66 (MQ=255) accctaAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaag < 3:245407‑M2/136‑66 (MQ=255) aTCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCg < 6:168636/139‑1 (MQ=255) aTCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCg < 2:255905/139‑1 (MQ=255) ccTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtac > 1:60468‑M2/1‑71 (MQ=255) ccTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtac > 6:306503‑M2/1‑71 (MQ=255) cTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCt < 2:354085/138‑1 (MQ=255) aaaaaTACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCAc > 8:256538/1‑124 (MQ=255) aaaaaTACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTta > 8:166472/1‑139 (MQ=255) aaaaTACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAg < 2:158913/117‑1 (MQ=255) aCTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCt < 1:412874/130‑1 (MQ=255) aCTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaa > 1:68855‑M2/1‑62 (MQ=255) aCTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaa < 2:68855‑M2/117‑56 (MQ=255) aCTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgcca < 1:38678‑M2/138‑49 (MQ=255) cTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccata > 5:334188‑M2/1‑89 (MQ=255) gATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCa < 1:229314/114‑1 (MQ=255) gATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCa > 2:229314/1‑114 (MQ=255) aTCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATaccac < 3:90703/137‑1 (MQ=255) aTCCTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcg < 2:61632‑M2/139‑54 (MQ=255) ccTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgct < 4:316825‑M2/139‑56 (MQ=255) cTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctt > 5:113543‑M2/1‑83 (MQ=255) cTGATTATCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgct > 5:71011‑M2/1‑83 (MQ=255) aTTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCata < 5:286609/115‑1 (MQ=255) aTTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCctct < 5:271491/138‑1 (MQ=255) tCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTtata > 7:155724/1‑121 (MQ=255) tCTACAAAGCTTACTGCAGCCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatata > 8:132856‑M2/1‑76 (MQ=255) cAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAat < 6:160575/138‑1 (MQ=255) cAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAat < 6:4402/138‑1 (MQ=255) cTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTc < 2:37222/139‑1 (MQ=255) gttgCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCTCTTTATATACAACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCt > 7:81246/1‑137 (MQ=255) gttgCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAat < 3:232514/130‑1 (MQ=255) gttgCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAat > 2:97557/1‑130 (MQ=255) gcCATATGATGCTGATGACATGGAAGCATAccaggtttcatctttagtgaattcacctaaaaacaattcacctgagctcattgaa < 5:255398‑M2/85‑56 (MQ=255) ccTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTAAGCTAATATGTTCTAAGTaggag > 7:182852/1‑139 (MQ=255) atgCTGATGACATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttct > 5:447742‑M2/1‑50 (MQ=255) cTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGaa > 8:420426/1‑59 (MQ=255) cTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACctcctc > 2:275298/1‑104 (MQ=255) cTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACctcctc < 1:275298/104‑1 (MQ=255) atgaCATGGAAGCATATCTGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACAACCTCCTCTTAGCTAATATGTTc > 1:281710/1‑116 (MQ=255) atgaCATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATtttgtt > 8:233439/1‑139 (MQ=255) gaCATGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttctaagtaggag < 4:241231‑M2/139‑98 (MQ=255) aTGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCtt > 8:48523/1‑80 (MQ=255) aTGGAAGCATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaatatgttctaagtaggaggt < 4:5021‑M2/138‑100 (MQ=255) gAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTAtctc < 1:216073/139‑1 (MQ=255) cATACCAGGTTTCATCTTTAGTGAATTCACCTaaaaacaattcacctgagctcattgaatcccattaagtaccactgccatatcgctttatatatcaccttcgcttagctaat < 1:342259‑M2/113‑82 (MQ=255) atCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGc > 8:102486/1‑138 (MQ=255) atCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGc > 5:37167/1‑138 (MQ=255) atCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGc > 4:210918/1‑138 (MQ=255) atCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGc > 3:366017/1‑138 (MQ=255) atCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGc > 1:146433/1‑138 (MQ=255) | TTATGGAAGACATTCATGATCGGATGCCAGTTATCCTAACTGATGAGAACAAAAAGGAATGGCTAAATCCTAAAAATACTGATCCTGATTATCTACAAAGCTTGTTGCTGCCTTATGATGCTGATGACATGGAAGCATATCAGGTATCTTCATTAGTGAATTCACCTGAGCTCATTGAATCCCATTAAGTACCACTGCCATATCGCTTTATATACCACCTCCTCTTAGCTAATATGTTCTAAGTAGGAGGTGGTATTTTGTTTGTATCTCCAATGC > CP006881/2010528‑2010803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |