| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,192,860 | C→T | G301G (GGG→GGA) | U712_10990 ← | Anthranilate phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,192,860 | 0 | C | T | 98.8% | 258.8 / NA | 84 | G301G (GGG→GGA) | U712_10990 | Anthranilate phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (46/37); minor base A (0/1); total (46/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCTTTTGTTTAATGATGTTTTCAAGCATAGATCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAATGCTAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTGATCCCCGCCGTGTATATCGCAGCCCCTGCATTAAAAGCTGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGACAGGCACTCTCTTTTGGTGACTCCACCTGTAAATCTTC > CP006881/2192726‑2192988 | tctttTGTTTGATGATTTTTTCAAGCATAGATCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCccg > 6:25872/1‑139 (MQ=255) ctttTGTTTGATGATTTTTTCAAGCATAGATCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCccg < 7:175337/138‑1 (MQ=255) ttGTTTGATGATTTTTTCAAGCATAGATCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCATCTCCGTTCCTTCCTTGAGTGAGGCGGTAATTCccgcc < 3:204546/137‑1 (MQ=255) tGTTTGATGATTTTTTCAAGCATAGATCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCgtg > 6:216556/1‑139 (MQ=255) aTCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCACGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg < 4:231666/139‑1 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg < 6:251999/134‑1 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg < 5:158712/134‑1 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg > 5:251999/1‑134 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg > 2:150946/1‑134 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg < 1:150946/134‑1 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTAAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGt > 5:205009/1‑138 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGACTCTAACGCCAGCTCAGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTACCGCCGTGTAAAACGCAGCACCCGCAATAAAAGCCGt > 2:137869/1‑138 (MQ=255) ttCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTACAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAAACGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTAAGAGAGGCGGTAATTCCCGCCGAGTAAAAAGCACCACCCCCAATAAAAGCCGt > 3:396990/1‑138 (MQ=255) ttCCTCGTTATGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCTGCGCCTCCGCTTGTAATCGGCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGcc < 6:67825/136‑2 (MQ=255) ctTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg < 2:228587/129‑1 (MQ=255) ctTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAg > 1:228587/1‑129 (MQ=255) ctTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTACCGCCGTGTAAAACGCACCAACCCCATAAAAAGCCGTAATat > 6:79504/1‑137 (MQ=255) ctTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCGTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCCGCACCCGCAGTAAAAGCCGTaa > 6:107371/1‑135 (MQ=255) ctTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGAGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGGGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGa < 7:210062/139‑1 (MQ=255) tCTGCTTTAGTCGTTCATGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCGGTAAAAGa < 8:9858/136‑1 (MQ=255) tCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGa < 5:216556/136‑1 (MQ=255) tGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCccgcc < 8:26215/96‑1 (MQ=255) tGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCccgcc > 7:26215/1‑96 (MQ=255) cTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAg < 2:26420/137‑1 (MQ=255) cTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCg > 4:437795/1‑139 (MQ=255) tttAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCgg < 5:25872/139‑1 (MQ=255) ttAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCgg > 7:80876/1‑138 (MQ=255) tAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTGCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCCCCCGCATTAAAATCCGTAATAGAAAAAGCGGaa > 5:255380/1‑139 (MQ=255) aGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAAc > 5:143976/1‑139 (MQ=255) aGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAAc > 3:125565/1‑139 (MQ=255) gTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAAc < 4:125565/138‑1 (MQ=255) gTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAAc < 6:143976/138‑1 (MQ=255) tCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCccgcc > 7:444625/1‑84 (MQ=255) tCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCccgcc < 8:444625/84‑1 (MQ=255) tCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACtgctgc > 4:447393/1‑139 (MQ=255) cAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTgctgct > 3:52571/1‑139 (MQ=255) cgcgGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTAttt > 6:357608/1‑139 (MQ=255) ggggCAGGGCCTCCGATTGTATTCGTCTCAAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATACCCGCGGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATTGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTAtttt < 2:196190/137‑1 (MQ=255) cgcCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTGCAGTGAGGCGGGAATTCCCGCCGTGTAAATAGCCGCCCCCGCATTTAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGGGTTTATTTTCaaaaa > 5:68417/1‑138 (MQ=255) ccTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAatat > 6:340727/1‑139 (MQ=255) ccTCCGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCGTTTATTTTCAAAAatat > 6:338272/1‑139 (MQ=255) ccGCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCt > 3:441631/1‑139 (MQ=255) gCTTGTAATCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTg > 3:312976/1‑138 (MQ=255) ggaaTCGTCGCTAACGCACTCGCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCATCAACCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAAt < 6:391714/135‑1 (MQ=255) aTCGTCTCTAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATgagat < 5:218920/139‑2 (MQ=255) ctctAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATgagataagcg > 8:48770/1‑133 (MQ=255) ctctAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCCCATTAAAAGCCGAAATAGATAAACAGGAACTGCTGCTTTTATTTTAAAAAATATTGTGAATgagaaaaacg > 6:250962/1‑133 (MQ=255) tAACGCCAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATgagataagcg < 3:395706/136‑7 (MQ=255) aggcctgCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAACCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGctct < 5:79504/132‑1 (MQ=255) aGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATAtt > 1:353400/1‑113 (MQ=255) aGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATAtt < 2:353400/113‑1 (MQ=255) gCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACAGCTGCTTTTATTTTAAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTAgg > 4:35418/1‑139 (MQ=255) cTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCgga < 8:267651/139‑2 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCCGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGctct < 6:50329/126‑1 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATATATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCgga > 4:78430/1‑133 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGa < 8:318645/70‑1 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGa > 7:318645/1‑70 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGctct < 3:311484/126‑1 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGctct > 5:50329/1‑126 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGctct > 4:311484/1‑126 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCgga < 3:78430/134‑2 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACtg > 1:272768/1‑138 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACtg < 3:437795/139‑2 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACtg > 8:426537/1‑138 (MQ=255) ttccttccTTCAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACtg > 4:36355/1‑138 (MQ=255) 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cAGTGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACTGCACCTGTaa < 5:357608/138‑1 (MQ=255) tGAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACTGCACCTTTAAATCt > 6:270172/1‑139 (MQ=255) gAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGa > 7:374628/1‑96 (MQ=255) gAGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGa < 8:374628/96‑1 (MQ=255) aGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACTGCACCTGTAAATCtt < 7:48770/138‑1 (MQ=255) aGGCGGTAATTCCCGCCGTGTAAACCGCTGCTCCCTCATTAAAACCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACTGCACCTGTAAATCtt < 5:250962/138‑1 (MQ=255) ggCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACTGCACCTGTAAATCTTc > 2:15858/1‑138 (MQ=255) gCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACtg < 3:78896/122‑2 (MQ=255) gCGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGATAAGCGCTCTCTTTCGGAGACtg > 4:78896/1‑121 (MQ=255) cGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTAtttt > 2:90243/1‑78 (MQ=255) cGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTAtttt > 2:96708/1‑78 (MQ=255) cGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTAtttt < 1:90243/78‑1 (MQ=255) cGGTAATTCCCGCCGTGTAAATCGCAGCACCCGCATTAAAAGCCGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTAtttt < 1:96708/78‑1 (MQ=255) | TCTTTTGTTTAATGATGTTTTCAAGCATAGATCTCTTCCTCTTTCTGCTTTAGTCGTTCAAGCTGCGCGGCAGCGCCTCCGCTTGTAATCGTCTCTAATGCTAGCTCCGTTCCTTCCTTCAGTGAGGCGGTGATCCCCGCCGTGTATATCGCAGCCCCTGCATTAAAAGCTGTAATAGATAAAGCGGAACTGCTGCTTTTATTTTCAAAAATATTCTGAATGAGACAGGCACTCTCTTTTGGTGACTCCACCTGTAAATCTTC > CP006881/2192726‑2192988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |