| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,194,991 | A→C | V97V (GTT→GTG) | U712_10995 ← | Anthranilate synthase component 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,194,991 | 0 | A | C | 98.7% | 246.3 / NA | 77 | V97V (GTT→GTG) | U712_10995 | Anthranilate synthase component 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (41/35); total (41/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTTCTTTTGAATGCGGAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCGTAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCTAGCTCTGGCGTTTTGATTTTGTACGTGGTATTCATCCAATTCAGAACTTCTTTAAGTTCATTTCCTGTGTAATGAGATCTGCCGTCATGATCTGTAGCTGTAAAACGGCTCTGCTTTTCTTTAATCGTGAGGAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTTGACCAATTGGATGTA > CP006881/2194855‑2195123 | tttCTTTGGTATGCGAAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCAc < 4:99233/139‑1 (MQ=255)tttCTTTGGTATGCGAAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCAc < 4:448841/139‑1 (MQ=255) gtaTGCGAAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCtttta > 3:318661/3‑137 (MQ=255) gtaTGCGAAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCtttt < 3:283269/136‑2 (MQ=255) tGCGAAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCACAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGAATTAATCCAGTTCAGCACTTCTATTAGt > 6:310360/1‑138 (MQ=255) gaaggaACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCAt < 5:279406/137‑1 (MQ=255) gaACAGAAGGCTCAATCTGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTcc < 2:402536/139‑1 (MQ=255) gaACAGAAGGCTCAATCAGCGGTATCTTTTCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTc < 2:340110/138‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCTGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCt < 3:431393/139‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTcc < 2:193346/138‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTAAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCt < 2:206305/139‑1 (MQ=255) agggCTCAATCTGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTACGCAGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTgtgtt < 8:42450/137‑2 (MQ=255) ggCTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaaa < 6:16647/139‑2 (MQ=255) cTCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaaa > 3:142123/1‑136 (MQ=255) tCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTc < 2:343684/127‑1 (MQ=255) tCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTc > 1:343684/1‑127 (MQ=255) tCAATCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaaa > 3:57529/1‑135 (MQ=255) aaTCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaaa < 3:77924/134‑2 (MQ=255) aaTCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaaa > 4:77924/1‑133 (MQ=255) aaTCAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGAt > 7:426082/1‑139 (MQ=255) cAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaa > 2:348598/1‑130 (MQ=255) cAGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTaa < 1:348598/130‑1 (MQ=255) aGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTg < 8:315365/138‑1 (MQ=255) aGCGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTg < 8:102235/138‑1 (MQ=255) cGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCttt < 1:172619/108‑1 (MQ=255) cGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCttt > 2:172619/1‑108 (MQ=255) cGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGctg > 7:184134/1‑137 (MQ=255) cGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGctg > 4:435626/1‑137 (MQ=255) cGGGATCATATCATAGCTTAAGTACCCGACACCTCCGCCGACAAAAGGAATGACAAGCTAACGTGTATTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTACAGCACTTCTTTTAGTTAAATTACTGTGTAAAGAGAttagcct > 7:42450/1‑133 (MQ=255) atcatatcatAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTcct > 1:437005/1‑137 (MQ=255) atcatatcatAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGAGTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTGTTAGTTCAGTTCCGGTGTAAAGAGATTTGCTGTcct > 8:318439/1‑137 (MQ=255) tcatAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTa < 6:213899/113‑1 (MQ=255) tcatAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTa > 5:213899/4‑116 (MQ=255) tcatAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATcag < 4:57529/136‑3 (MQ=255) tAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATcagcgg > 4:124436/1‑134 (MQ=255) aGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATcagcggc > 7:116755/1‑133 (MQ=255) cTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCt > 2:337949/1‑105 (MQ=255) cTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCt < 1:337949/105‑1 (MQ=255) gACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAagag > 6:223784/1‑104 (MQ=255) gACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAagag < 5:223784/104‑1 (MQ=255) aGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGc < 6:400834/139‑1 (MQ=255) cTCCGCCGACAAACGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGATATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCTAAAAACGGCCCTGCtc < 4:54322/139‑2 (MQ=255) cTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAagag < 4:387168/99‑1 (MQ=255) cTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAagag > 3:387168/1‑99 (MQ=255) cTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCTAAAAACGGCCCTGCtc < 6:133882/139‑2 (MQ=255) cTCCGCCGACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCtc > 2:353355/1‑138 (MQ=255) cgccgACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTc > 8:63679/1‑139 (MQ=255) ccgACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGct > 3:242113/1‑100 (MQ=255) ccgACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGct < 4:242113/101‑2 (MQ=255) ccgACAAAAGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTcttctt > 1:44979/1‑139 (MQ=255) aaGGAATGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGATATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGt < 3:124436/139‑1 (MQ=255) tGCCAAGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGaaa > 5:378905/1‑139 (MQ=255) ccaaGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATg > 1:44135/4‑139 (MQ=255) aGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAACCGGCCATGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGTAt > 4:285054/1‑139 (MQ=255) aGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGAt > 1:245583/1‑139 (MQ=255) aGCTCAGGTGTTTTGATTTTGTATGTGGTATTAATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGCCCCGGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGAt > 5:147186/1‑139 (MQ=255) gtttGATTTTGTATGGGGTACTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTGGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGAt < 4:142123/138‑1 (MQ=255) tttGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTATTTCTTTTCCTGTGTAAAGTGTTTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAACACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGAt < 1:353355/138‑1 (MQ=255) tttGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGAt < 3:435626/138‑1 (MQ=255) ttGATTTTGTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGACGa > 5:13637/1‑136 (MQ=255) gacaggTATGTGGTATTCATCCAGTTCAGAACTTCTTTTTGTTAATTTCCTGTGTAAAGTGATTTGCTGTCCTTATCAGCGGCCTAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACg < 4:128686/134‑1 (MQ=255) tatgTGGTATTCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAatat < 6:168922/135‑1 (MQ=255) ttCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCaa < 4:317114/138‑1 (MQ=255) tCATCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGAcctgtc > 3:128686/1‑135 (MQ=255) aTCCAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTgg > 1:358375/1‑139 (MQ=255) aTCCAGTTCAGCACTTATTTTAGTTAATTTCCTGTTTAAATATATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTgg < 6:226441/139‑1 (MQ=255) ccAGTTCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAATTGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGAt > 4:425600/1‑139 (MQ=255) cagttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATg < 8:35903/136‑1 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTGTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATTTCTGGACCATGTGGATGTa > 4:91222/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATGTa > 5:161447/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATGTa > 4:443346/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATGTa > 3:267514/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATGTa < 2:44135/138‑1 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATGTa > 2:116946/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACCAAGTGGATGTa > 5:226441/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGCCCTGCTCTTCTTTAATTGTGAGAAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGAACAAGTGGATGTa > 3:276023/2‑139 (MQ=255) gttCAGCACTTCTTTTAGTTCATTTCCTGTGTAAAGAGATTTGCTGTCCTGATCAGCGGCCGAAAAACGGACCTGCTCGTCTTTAATTGTGATAAATGGAGTCAGGCCGATAAACGAATATCTGGACAAAGTGGAtcga > 8:52085/2‑136 (MQ=255) | TTTCTTTTGAATGCGGAGGAACAGAAGGCTCAATCAGCGGGATCATATCGTAGCTTAAGTACCCGACAGCTCCGCCGACAAAAGGAATGCCTAGCTCTGGCGTTTTGATTTTGTACGTGGTATTCATCCAATTCAGAACTTCTTTAAGTTCATTTCCTGTGTAATGAGATCTGCCGTCATGATCTGTAGCTGTAAAACGGCTCTGCTTTTCTTTAATCGTGAGGAATGGATTCAGGCCGATAAACGAATATCTTGACCAATTGGATGTA > CP006881/2194855‑2195123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |