| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,195,248 | G→C | Q12E (CAG→GAG) | U712_10995 ← | Anthranilate synthase component 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,195,248 | 0 | G | C | 98.5% | 449.0 / NA | 139 | Q12E (CAG→GAG) | U712_10995 | Anthranilate synthase component 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); major base C (73/62); minor base A (0/2); total (74/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ATTGGATGTATCATCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCGAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCATCGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGATTGGTAATACATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAACATTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGGCTTCTTTTGGGTAGAA > CP006881/2195114‑2195381 | agtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCCCCATCGGTATCGTGTGGTGGGCCAAGCTGTCCTCTaa > 8:13831/3‑138 (MQ=255)agtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTaa > 3:110661/3‑138 (MQ=255)agtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTaa > 7:421987/3‑138 (MQ=255)agtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTaa > 4:72021/3‑138 (MQ=255)agtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAAGCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTaa > 8:76478/3‑138 (MQ=255)agtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGACAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCATGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTaa > 8:279349/3‑138 (MQ=255)agtGGATGTATAGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTaa > 4:109136/3‑138 (MQ=255) gtGGATGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAATATACGTAATCTCCATGACACGCTTCTCTATCATTAGAATTGGTGTCAGTGTATAGACTGTGAAGGTCTCCACAAACGGAATCGTGTGTTTGGACAAGCTGTCCTCTaaa > 2:106792/2‑138 (MQ=255) aTGTATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATgc > 8:443989/1‑138 (MQ=255) tATCGTCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATgcgg < 2:261596/138‑4 (MQ=255) tcgtcCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGaaa > 2:181917/4‑139 (MQ=255) gtcCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATg > 4:218396/2‑139 (MQ=255) gtcCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATg > 4:139934/2‑139 (MQ=255) cTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGttt > 3:223552/1‑138 (MQ=255) aagaagATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTggaa < 7:443989/138‑3 (MQ=255) agaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCa < 4:394971/139‑1 (MQ=255) gaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAt < 1:6039/139‑1 (MQ=255) gaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAt < 7:347662/139‑1 (MQ=255) gaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAt < 3:361211/139‑1 (MQ=255) aTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAtt > 4:256885/1‑139 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 4:276023/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 1:168511/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 6:210077/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa > 7:280871/1‑139 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCATGTGGTGGGACAAGCTGTCATCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 7:279349/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTATATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 2:44979/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGGCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGGGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 6:13637/139‑1 (MQ=255) tcCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 2:314282/136‑1 (MQ=255) tcCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa > 1:314282/1‑136 (MQ=255) ccTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCt > 8:153959/1‑139 (MQ=255) aGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCa < 7:13831/139‑1 (MQ=255) tttGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag > 3:92375/1‑137 (MQ=255) tGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTcc > 8:191666/1‑116 (MQ=255) tGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTcc < 7:191666/116‑1 (MQ=255) tGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag > 3:350358/1‑135 (MQ=255) tGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGagaag > 1:316396/1‑138 (MQ=255) gAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGagaaga < 1:181917/138‑1 (MQ=255) gAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGGCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGagaaga < 8:386951/138‑1 (MQ=255) aTGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATTCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTAGGGCAAGGAGAATGAGAAGAggg > 6:309283/1‑139 (MQ=255) gtgtCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAt > 4:140178/1‑138 (MQ=255) tgtCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAt > 6:72024/1‑137 (MQ=255) gtcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAt > 8:40130/7‑136 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 3:176218/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 1:235480/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 3:139934/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCAAAATCGGTATCTTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 3:109136/134‑1 (MQ=255) tcagtctATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATGGTGTGGTGGTACAAGCTGTGCTATAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 1:106792/133‑1 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 5:250414/134‑1 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGagag > 2:171438/4‑138 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGagag > 7:159832/4‑138 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGagag > 5:445619/4‑138 (MQ=255) tgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGa < 1:116946/137‑1 (MQ=255) tgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGACCTCTAAAAATGCGGAAATGTTAGATTCGAATTTCATTGCAATCACACCTTATGGCATGGATAAGAACAAGATGGCATGAGAGGa > 4:364594/2‑138 (MQ=255) gTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 8:421987/139‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 7:437486/138‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 1:215626/138‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 3:305629/1‑138 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 3:443346/138‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGATATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 2:135000/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATga > 4:16441/1‑129 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 1:74961/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 1:171438/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 3:398875/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 5:32530/136‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGAAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 6:32530/1‑136 (MQ=255) cTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCATCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatact < 6:97567/139‑5 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACTATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTTAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACtat > 3:326493/1‑139 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCGTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAGGAGAGGATaaaatacta > 7:235088/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 3:152505/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 5:78315/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 1:279820/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 2:10438/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 7:3864/1‑133 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag < 4:337981/102‑1 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 8:173132/1‑121 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 7:173132/121‑1 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACaaa > 5:374894/1‑138 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGAt > 7:297602/1‑60 (MQ=255) cacaATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 4:90663/1‑119 (MQ=255) cacaATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 3:90663/119‑1 (MQ=255) aTCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAccca < 1:10438/139‑2 (MQ=255) tCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATTGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAAacc > 6:214624/1‑138 (MQ=255) aTCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATGTAACAAATAAACCCAaaag > 7:233105/1‑138 (MQ=255) gtgtGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaaga > 2:58852/1‑136 (MQ=255) gtggtgGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaagaaagac < 3:140178/139‑3 (MQ=255) tggtggGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaagaaagac > 6:393255/1‑136 (MQ=255) tggtggGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaagaaagac < 5:393255/138‑3 (MQ=255) gtgggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGActtc > 2:366934/4‑139 (MQ=255) tgggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaata > 2:24223/3‑103 (MQ=255) tgggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGActtct > 4:123803/3‑139 (MQ=255) ggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatact < 3:253489/105‑5 (MQ=255) ggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatact > 4:253489/1‑101 (MQ=255) cAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 5:375188/95‑1 (MQ=255) cAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 6:375188/1‑95 (MQ=255) aaGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTggg < 2:279820/139‑1 (MQ=255) aaGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTggg < 3:72021/139‑1 (MQ=255) atcTGTCCTCTAAATATGCGGAAATCTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCAATCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGt < 8:235088/137‑1 (MQ=255) aGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCTATGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGCAAGACTTCTTTTgtgt > 6:333366/1‑139 (MQ=255) aGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGt < 8:184134/139‑1 (MQ=255) tCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGTAGaa > 2:309845/1‑138 (MQ=255) | ATTGGATGTATCATCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCGAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCATCGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGATTGGTAATACATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAACATTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGGCTTCTTTTGGGTAGAA > CP006881/2195114‑2195381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |