Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,198,863 | A→G | F40F (TTT→TTC) | U712_11015 ← | Chemotaxis protein methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,198,863 | 0 | A | G | 97.7% | 263.9 / NA | 85 | F40F (TTT→TTC) | U712_11015 | Chemotaxis protein methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (33/50); minor base T (0/2); total (33/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAATAGCAGTCTCAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGGGCTTGATCCTTTTCTAATGCCGCCGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGAAACCCCTTTTTCTCATAAAGCGACGTCAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAATGTCAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCACTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCATCTCTCTACTCTCCCAGT > CP006881/2198727‑2198999 | gAATTGCAGTCTCAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCATGAACGCTTTGgaa > 4:255860/1‑139 (MQ=255) aGTCTCAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCttt < 3:128305/139‑1 (MQ=255) tcAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTtct > 8:92376/1‑139 (MQ=255) tcAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTtc > 6:100566/1‑138 (MQ=255) tcAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTtc > 4:347115/1‑138 (MQ=255) aaGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCa > 6:208442/1‑139 (MQ=255) aGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCa > 4:114875/1‑138 (MQ=255) aCTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATaaa < 3:267594/139‑1 (MQ=255) ttCCCATCTTATATAATTACGATAAAATTCTGAAACATAGATCGTCATTCTGTCCAATGTAACATTTAAAAGAGATTGATCCTTATCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTCGAACCCCATTTTCTCTTAAAgt > 4:163253/1‑138 (MQ=255) cccATCTTTTATAATTACTATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAgt > 5:18264/1‑136 (MQ=255) cccATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGa > 3:198385/1‑139 (MQ=255) cccATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGa > 6:361734/1‑139 (MQ=255) cccATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGa > 5:253794/1‑139 (MQ=255) cccATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCAAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGa > 7:216992/1‑139 (MQ=255) ttATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGc < 6:181863/138‑1 (MQ=255) ataATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTATGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATCCCGCAGCAAACTCCTAAAAGCTTAGGAACCCCTTTTCCTCATAAAGTGACGTTAGCCt > 3:325497/1‑138 (MQ=255) taATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCtt < 3:177009/138‑1 (MQ=255) aTTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTtctc < 5:86061/139‑1 (MQ=255) tACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTGctct > 3:84211/1‑138 (MQ=255) aCGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCtt > 5:252404/1‑138 (MQ=255) aCGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCtt > 8:268225/1‑138 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 5:413373/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 6:18264/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 6:252404/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 3:124526/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 4:111038/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 1:40132/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 8:303128/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 7:158340/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 1:121077/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 3:361333/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 3:361172/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 1:283264/139‑1 (MQ=255) aaTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTtgtg < 5:183947/139‑1 (MQ=255) aTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGc < 3:255860/139‑1 (MQ=255) aTTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGc < 7:268225/139‑1 (MQ=255) ttCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGct < 3:268357/139‑1 (MQ=255) aaaCATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGcttct < 2:62255/137‑1 (MQ=255) cATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 8:220933/139‑1 (MQ=255) cATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 3:85657/139‑1 (MQ=255) cATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 7:243793/139‑1 (MQ=255) cATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 3:206269/139‑1 (MQ=255) cATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 5:361734/139‑1 (MQ=255) cATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 3:347115/139‑1 (MQ=255) agacagtCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 3:291044/133‑1 (MQ=255) cATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTACTTtata > 7:230997/1‑129 (MQ=255) cATTCTGTCAAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 8:230997/129‑1 (MQ=255) tCCAATGTTTCATTTAAGAGATCTTGATCCTTTTCCAATTACGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCGTTTTCTAATAAATTGACGTTATACTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTAAATAGTGTTAAATCGACTc > 8:334208/1‑139 (MQ=255) tCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCTTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAATGTGACGTTTGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACt < 5:100566/138‑1 (MQ=255) tCCAATGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTGGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACt < 7:137147/138‑1 (MQ=255) tGTTTCATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAATTCGACTCCGGt > 1:31665/1‑138 (MQ=255) cATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata > 1:84693/1‑112 (MQ=255) cATTTAAGAGAGCTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTtata < 2:84693/112‑1 (MQ=255) aaaGAGAGCTTCATCCTTTTCCAATGCCCCCGCAAAGCATTTAAAGCTTTGGACCCCCTTTTGATCATAATGGCAGGTTCGCGTGCTCTTATTTTGGGCTTCTTTATATGGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGttt < 4:230292/137‑1 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGGTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 3:40109/1‑139 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 8:356225/1‑139 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 1:99688/1‑139 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 7:54449/1‑139 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 4:13094/1‑139 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATGTCGt > 5:89655/1‑139 (MQ=255) cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCATTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTCACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGGGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt < 1:184476/139‑1 (MQ=255) gATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTg > 3:386215/1‑138 (MQ=255) gATCCTTTACCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCATTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTAAAAAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTg < 1:130246/138‑1 (MQ=255) ttttCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCATTCGAACCACTTTTTCTCATAAAGAGACGTTACCCTTATCTTCATTAGTGCTTCTTTTATTAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAAAACTTTCCAATTCGTAGTaaaa > 7:142967/1‑137 (MQ=255) tttCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTATTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTACACTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGATAAAAAGACTCCGGTTAATAGTTTCCATTTCGATGTAAATAc > 5:136668/1‑139 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAATGTCATTAACGCTTTGTAACCCCTTTTTGTCATAATGTGAGGTTCGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 8:54449/135‑1 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACTTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 3:114875/135‑1 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATCGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 5:188295/135‑1 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 4:435642/135‑1 (MQ=255) gaattGCGGCAGCAATGTCGTTAATGCTTTGGATCCCCTTTTTTTCATAATGTGACGTTTGCGTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATTGTGTTAATTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGc < 6:136668/134‑1 (MQ=255) cctaTGCCGCAGCAATGTCCTTAAAGCTTTTGAACCGCTTTTCCAGATAATTTTAAGTTAGCGTTGTCTTTATTTGTGGTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATTCGc < 4:325497/135‑1 (MQ=255) tGCCGCAGCAACGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtat < 6:412512/139‑1 (MQ=255) gccgaagcAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtat < 8:216992/132‑1 (MQ=255) ccgcagCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAATTACGCtgtatg > 8:413744/1‑138 (MQ=255) ccgcaccAAAGTCCTTAAAGTTTTGGAACCCCTTTTTCTAATAAAGTGAGGTTAGCCTTCTCTTCTTTTGTGATTCTTTATATAGTTTAAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtatg < 3:39347/132‑1 (MQ=255) gcagcAAAGTCCTTAAATCTTTGTAAGCCGTTTATCTCATAAAGTGACGTAAGCCGTCTATTCATTGGTGCTTCTTTATATAGTTTTAACTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTgtatgtat < 8:321512/136‑1 (MQ=255) gcagcAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAATTACGCTgtatgtat > 4:79918/4‑139 (MQ=255) cagaaaaGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTAATTTGTGCTTATTTATATAGTTTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATc < 6:253794/135‑1 (MQ=255) cAATGTCTTAAAAGTTTTGGAACCCTTTTTTCTAATAATGTTCGTTTAGCGTTCTATTCTTTTTTGCTTATTTATTTTGTGTAAACTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAt < 4:40109/139‑1 (MQ=255) aaatttCCTTAAAGGTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAACGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAt < 4:198385/134‑1 (MQ=255) aaaGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAtc < 5:208442/139‑1 (MQ=255) gTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAtctc > 3:419173/1‑138 (MQ=255) tCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAtctcta < 3:13094/139‑2 (MQ=255) tttGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCatt < 7:51144/96‑3 (MQ=255) tttGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCatt > 8:51144/1‑94 (MQ=255) tttGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGt > 5:98219/1‑139 (MQ=255) | GAATAGCAGTCTCAAGAACTTCCCATCTTTTATAATTACGATAAAATTCTGAAACATTGATCGTCATTCTGTCCAATGTTTCATTTAAGAGGGCTTGATCCTTTTCTAATGCCGCCGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGAAACCCCTTTTTCTCATAAAGCGACGTCAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAATGTCAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCACTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCATCTCTCTACTCTCCCAGT > CP006881/2198727‑2198999 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |