| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,198,953 | C→T | K10K (AAG→AAA) | U712_11015 ← | Chemotaxis protein methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,198,953 | 0 | C | T | 98.9% | 295.1 / NA | 94 | K10K (AAG→AAA) | U712_11015 | Chemotaxis protein methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (59/34); minor base A (1/0); total (60/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTTGATCCTTTTCTAATGCCGCCGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGAAACCCCTTTTTCTCATAAAGCGACGTCAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAATGTCAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCACTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCATCTCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTGCAGCT > CP006881/2198820‑2199078 | cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGGTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 3:40109/1‑139 (MQ=255)cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 4:13094/1‑139 (MQ=255)cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 1:99688/1‑139 (MQ=255)cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 7:54449/1‑139 (MQ=255)cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt > 8:356225/1‑139 (MQ=255)cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATGTCGt > 5:89655/1‑139 (MQ=255)cTTGATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCATTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTCACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGGGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGt < 1:184476/139‑1 (MQ=255) gATCCTTTTCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTg > 3:386215/1‑138 (MQ=255) gATCCTTTACCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCATTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTAAAAAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTg < 1:130246/138‑1 (MQ=255) ttttCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCATTCGAACCACTTTTTCTCATAAAGAGACGTTACCCTTATCTTCATTAGTGCTTCTTTTATTAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAAAACTTTCCAATTCGTAGTaaaa > 7:142967/1‑137 (MQ=255) tttCCAATGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTATTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTACACTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGATAAAAAGACTCCGGTTAATAGTTTCCATTTCGATGTAAATAc > 5:136668/1‑139 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAATGTCATTAACGCTTTGTAACCCCTTTTTGTCATAATGTGAGGTTCGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 8:54449/135‑1 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACTTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 3:114875/135‑1 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATCGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 5:188295/135‑1 (MQ=255) tccaaTGCCGCAGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 4:435642/135‑1 (MQ=255) gaattGCGGCAGCAATGTCGTTAATGCTTTGGATCCCCTTTTTTTCATAATGTGACGTTTGCGTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATTGTGTTAATTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGc < 6:136668/134‑1 (MQ=255) cctaTGCCGCAGCAATGTCCTTAAAGCTTTTGAACCGCTTTTCCAGATAATTTTAAGTTAGCGTTGTCTTTATTTGTGGTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATTCGc < 4:325497/135‑1 (MQ=255) tGCCGCAGCAACGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtat < 6:412512/139‑1 (MQ=255) gccgaagcAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtat < 8:216992/132‑1 (MQ=255) ccgcagCAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAATTACGCtgtatg > 8:413744/1‑138 (MQ=255) ccgcaccAAAGTCCTTAAAGTTTTGGAACCCCTTTTTCTAATAAAGTGAGGTTAGCCTTCTCTTCTTTTGTGATTCTTTATATAGTTTAAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtatg < 3:39347/132‑1 (MQ=255) gcagcAAAGTCCTTAAATCTTTGTAAGCCGTTTATCTCATAAAGTGACGTAAGCCGTCTATTCATTGGTGCTTCTTTATATAGTTTTAACTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTgtatgtat < 8:321512/136‑1 (MQ=255) gcagcAAAGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAATTACGCTgtatgtat > 4:79918/4‑139 (MQ=255) cagaaaaGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTAATTTGTGCTTATTTATATAGTTTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATc < 6:253794/135‑1 (MQ=255) cAATGTCTTAAAAGTTTTGGAACCCTTTTTTCTAATAATGTTCGTTTAGCGTTCTATTCTTTTTTGCTTATTTATTTTGTGTAAACTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAt < 4:40109/139‑1 (MQ=255) aaatttCCTTAAAGGTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAACGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAt < 4:198385/134‑1 (MQ=255) aaaGTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAtc < 5:208442/139‑1 (MQ=255) gTCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAtctc > 3:419173/1‑138 (MQ=255) tCCTTAAAGCTTTGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCAtctcta < 3:13094/139‑2 (MQ=255) tttGGAACCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGt > 5:98219/1‑139 (MQ=255) tggaaCCCCTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGtct > 4:84557/4‑139 (MQ=255) cTTTTTCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCt > 5:348675/1‑139 (MQ=255) tttCTCATAAAGTGACGTTAGCCTTCTATTCTTTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCttt < 3:163253/138‑1 (MQ=255) tttCTAATAAAGTGACGTAAGCATTATCTTCATTTTTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCttt < 2:99688/138‑1 (MQ=255) cATAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTcg > 1:335978/1‑138 (MQ=255) aTAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtatgta > 7:82927/1‑100 (MQ=255) aTAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCtgtatgta < 8:82927/100‑1 (MQ=255) aTAAAGTGACGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGGGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTc < 7:92376/137‑1 (MQ=255) aCGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg < 7:59642/83‑1 (MQ=255) aCGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACg > 8:59642/1‑83 (MQ=255) aCGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCt > 8:354736/1‑118 (MQ=255) aCGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCt < 7:354736/118‑1 (MQ=255) aCGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGc > 4:195976/1‑139 (MQ=255) aCGTTAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGc > 6:87011/1‑139 (MQ=255) aGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGtt > 2:347332/1‑139 (MQ=255) ctctTCATTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTAt > 8:397323/1‑137 (MQ=255) aTTTGTGCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGaaa < 6:348675/138‑1 (MQ=255) tgCTTCTTTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAattgtat > 3:49274/1‑139 (MQ=255) cttcttTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAattgtattg > 8:236898/1‑139 (MQ=255) cttcttTATATAGTGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAattgtattg > 6:208587/1‑139 (MQ=255) gtGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaa > 5:259418/2‑138 (MQ=255) tGTTAACTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATc < 2:390839/57‑1 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATc > 1:390839/1‑57 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTg > 5:26046/1‑90 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTg < 6:26046/90‑1 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTTGTATAGCTTGTTTTATGAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 5:17894/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGt < 4:422658/97‑1 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGt > 3:422658/1‑97 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATATCTTGTTTTATCAGGAAATTGTTTTGTTTCAATaaaaa > 5:424497/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGGTTGTTTTATCTGGATATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 6:59876/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAgg > 7:220728/1‑115 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAgg < 8:220728/115‑1 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAATTTGTATTGTTTCAATaaaaa > 3:80069/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAATTTGTATTGTTTCAATaaaaa > 8:114192/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 8:312777/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 4:155533/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 3:424560/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 1:325620/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 1:408996/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 4:331008/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 7:377017/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 3:71179/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 2:62448/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 1:83634/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 5:138477/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 7:131636/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 5:389816/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 1:109896/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 3:319919/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 6:187284/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATAAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaa > 2:109273/1‑138 (MQ=255) ttaaaTCGACTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATaaaaaaa > 3:202169/3‑138 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTc > 2:381119/1‑82 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTc < 1:381119/82‑1 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTa > 1:54123/1‑100 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTa < 2:54123/100‑1 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATc > 3:371848/1‑132 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATc < 4:371848/132‑1 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCtttt > 2:304753/1‑138 (MQ=255) aCTCCGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCAAAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCttt > 4:317645/1‑138 (MQ=255) cGGTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGc < 8:377017/139‑1 (MQ=255) ggTTAATTGTTTCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCt < 3:84557/139‑1 (MQ=255) tCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCtttt > 7:143722/1‑122 (MQ=255) tCCATTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCtttt < 8:143722/123‑2 (MQ=255) | CTTGATCCTTTTCTAATGCCGCCGCAAAGTCCTTAAAGCTTTGAAACCCCTTTTTCTCATAAAGCGACGTCAGCCTTCTCTTCATTTGTGCTTCTTTATATAATGTCAAATCGACTCCGGTTAATTGTTTCCACTTCGTTGTAAATACGCTGTATGTATCCATCTCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTGCAGCT > CP006881/2198820‑2199078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |