| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,199,093 | A→G | intergenic (‑111/+129) | U712_11015 ← / ← U712_11020 | Chemotaxis protein methyltransferase/Nucleoside diphosphate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,199,093 | 0 | A | G | 98.3% | 381.7 / ‑4.6 | 121 | intergenic (‑111/+129) | U712_11015/U712_11020 | Chemotaxis protein methyltransferase/Nucleoside diphosphate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (45/73); total (47/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AATACGCTGTATGTATCCATCTCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTGCAGCTGATTTTAGATCGTTAGAAAAGGCAGGAGTCTGGTACACCCTGCCAATAAACGCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAAGAAAACGAAAACCGACGGCATTACTTGGTGCCGGCTCTGTTACTTATTTTCATTAACG > CP006881/2198963‑2199220 | aaTACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa < 5:208587/138‑1 (MQ=255)aaTACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa < 7:356225/138‑1 (MQ=255)aaTACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa < 7:334208/138‑1 (MQ=255)aaTACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAg < 1:347332/139‑1 (MQ=255) tACGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCCGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAgag < 6:138477/139‑3 (MQ=255) cGCTGTATGTATCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGATTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAgaggt < 5:59876/139‑5 (MQ=255) tatgtatCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTgat > 6:3398/1‑137 (MQ=255) tatgtatCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTg < 2:325620/137‑1 (MQ=255) tgtatCCA‑‑TCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTATTTTTGTCCTAGTATAGATTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTATTCAGCTGATTTTAGATAGTTGGGAAAGGCAGAGGTCttctgc > 4:394348/1‑134 (MQ=255) tatccatctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATgcac < 1:109273/133‑1 (MQ=255) atccatctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATgcaca > 5:423183/6‑138 (MQ=255) tccatctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATgcacac < 2:335978/135‑3 (MQ=255) tctctcTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTGCAGCTGATTTTAGATCGTTAGAAAAGGCAGGAGTCTGGTACACCCTg > 8:348372/1‑139 (MQ=255) catctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACt < 8:131636/136‑1 (MQ=255) catctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTg > 7:422858/3‑139 (MQ=255) catctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAAAAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTg < 1:125045/137‑1 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa < 8:43346/119‑1 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa > 7:277464/1‑119 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa > 7:43346/1‑119 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCa < 8:277464/119‑1 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 5:208492/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 7:121192/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 7:81807/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 8:117858/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 8:16987/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 3:143227/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 2:410688/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTAAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 8:314719/1‑138 (MQ=255) tctctACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTAACAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGc > 7:198351/1‑138 (MQ=255) tACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCatt > 2:6620/1‑136 (MQ=255) ctctCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCattcaa > 2:291971/1‑134 (MQ=255) ctctCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAAATGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCatt < 4:386215/136‑3 (MQ=255) ctctCCCAGTCTCGATGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCattca < 4:84211/138‑5 (MQ=255) tcCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGTAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGTTCGTTGGTTAAGGCAGAGGTCTGATGGACTCTGCCattctac < 8:142967/137‑7 (MQ=255) tcCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCattca > 8:420276/1‑131 (MQ=255) ccAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCtt > 5:184883/1‑139 (MQ=255) ccAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCt < 8:198351/138‑1 (MQ=255) ccAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTAAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCt < 7:314719/138‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 6:423183/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 2:400583/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 4:419173/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 1:304753/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 6:208492/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 1:398607/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTGCAGCTGATTTTAGATCGTTAGAAAAGGCAGGAGTCTGGTACACCCTGCCAATAAACGCTTTAtt < 7:348372/139‑1 (MQ=255) tctcGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTATCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt < 7:397323/139‑1 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTTTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATGGTTGGGAAAGGCAGAGGGCTGATGCACACTGCCATTGAACCCTTTATTGACt > 4:74937/1‑139 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAgg > 2:374652/1‑98 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAgg < 1:374652/98‑1 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTgatgca < 1:109159/113‑6 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTAtt > 5:277744/1‑135 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACt > 1:124901/1‑139 (MQ=255) gCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTAAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTgatgca > 2:109159/1‑108 (MQ=255) ttGTCATTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCATGAAATTGTATTGGTTCAAATAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 2:31665/138‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 3:331008/139‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 7:413744/139‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 7:16987/139‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 4:424560/139‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 2:408996/139‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCGTGGTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCCATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 1:438071/139‑1 (MQ=255) cTGTCTTTTTGTACTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACtt < 2:124901/139‑1 (MQ=255) tttGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCatt < 5:274842/115‑3 (MQ=255) tttGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATg < 1:291971/137‑1 (MQ=255) tttGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGt > 3:130087/1‑138 (MQ=255) tttGTCCTAGTATAGCGTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCatt > 6:274842/1‑113 (MQ=255) ttGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTa < 4:319919/138‑1 (MQ=255) ttGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTa < 3:195976/138‑1 (MQ=255) ttGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTa < 4:71179/138‑1 (MQ=255) gTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGTAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCACCCCTTTATTCTCTTTAATGTAAAc > 5:273115/1‑139 (MQ=255) tCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAAcc > 7:43816/1‑139 (MQ=255) tCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAAc < 7:218897/138‑1 (MQ=255) tCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTAAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAAcc > 1:236127/1‑139 (MQ=255) cTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATAGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGGCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCt < 3:317645/138‑1 (MQ=255) cTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaa > 8:282988/1‑137 (MQ=255) tGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaacag > 7:439667/1‑135 (MQ=255) tGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaacag > 2:192559/1‑135 (MQ=255) ttttATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTTGGAAAGGCAGAGTTCTGATGCACACTGACATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaacagaa > 5:396958/1‑133 (MQ=255) ttttATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaacagaa > 3:144259/1‑133 (MQ=255) ttttATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaacagaa > 8:355916/1‑133 (MQ=255) ttttATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGAAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTAACaaaacagaa > 5:348082/1‑133 (MQ=255) ttttATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGAGCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACaaaacagaa > 2:188492/1‑133 (MQ=255) gAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCgg < 4:144259/139‑2 (MQ=255) gAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGGCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAACCCgg < 3:394348/139‑2 (MQ=255) aaaTTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCgg < 7:382200/138‑2 (MQ=255) atttgttttgttTCAAAAAAAAAATCTGCTTTTCTGCTGATTTTTTATCGTTGGTAACGGCAGTGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACACAACAAAAACCggc < 6:17894/136‑3 (MQ=255) atttgttttgttTAAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGTTAGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACTCTGCTATTGAACCCTTTATTAACTTTATTGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCg < 3:345529/137‑1 (MQ=255) acaggtattttTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTATATCGGTGCGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCggc < 4:357629/134‑3 (MQ=255) aaTTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGTTCTTTGGGAACGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATTTAAACCTTAACAAAACAGAAAAAAAACCggc < 4:80069/138‑3 (MQ=255) aaTTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGTAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCAATTCAACCCTTTATTCACTTTAATTTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCggc < 6:424497/138‑3 (MQ=255) aaTTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCg < 4:143227/139‑1 (MQ=255) aaTTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCg < 7:312777/139‑1 (MQ=255) aaTTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCg < 3:155533/139‑1 (MQ=255) aTAAAAAAATCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGcc > 3:380602/1‑139 (MQ=255) aTCAGCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGt < 7:114063/139‑1 (MQ=255) gCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGGCTGACGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCa < 4:202169/139‑1 (MQ=255) tGATTTTAGATCGTTGGTAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACACAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCa < 6:259418/137‑1 (MQ=255) aTTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCaca < 8:422858/137‑3 (MQ=255) aTTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTAATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCaca < 6:89655/137‑3 (MQ=255) tttAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCacaatg < 8:439667/138‑6 (MQ=255) ttAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTAATTTCacaatga < 6:389816/138‑7 (MQ=255) | AATACGCTGTATGTATCCATCTCTCTACTCTCCCAGTCTCGCTGTCTTTTTGTCCTAGTATAGCTTGTTTTATCAGGAAATTGTATTGTTTCAATAAAAAAATCAGCTTTGCAGCTGATTTTAGATCGTTAGAAAAGGCAGGAGTCTGGTACACCCTGCCAATAAACGCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAAGAAAACGAAAACCGACGGCATTACTTGGTGCCGGCTCTGTTACTTATTTTCATTAACG > CP006881/2198963‑2199220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |