| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,199,204 | A→G | intergenic (‑222/+18) | U712_11015 ← / ← U712_11020 | Chemotaxis protein methyltransferase/Nucleoside diphosphate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,199,204 | 0 | A | G | 98.8% | 257.3 / NA | 80 | intergenic (‑222/+18) | U712_11015/U712_11020 | Chemotaxis protein methyltransferase/Nucleoside diphosphate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (43/36); minor base T (1/0); total (44/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCTTTGCAGCTGATTTTAGATCGTTAGAAAAGGCAGGAGTCTGGTACACCCTGCCAATAAACGCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAAGAAAACGAAAACCGACGGCATTACTTGGTGCCGGCTCTGTTACTTATTTTCATTAACGATTAATAGATCCAGCCTGCCATGAGCTGTTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGGATGATGTTTT > CP006881/2199068‑2199337 | gCTTTTCAGCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCt < 4:380602/139‑1 (MQ=255) gCTGATTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGGCTGACGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCa < 4:202169/139‑1 (MQ=255) tGATTTTAGATCGTTGGTAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACACAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCa < 6:259418/137‑1 (MQ=255) aTTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCaca < 8:422858/137‑3 (MQ=255) aTTTTAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTAATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCaca < 6:89655/137‑3 (MQ=255) tttAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCacaatg < 8:439667/138‑6 (MQ=255) ttAGATCGTTGGGAAAGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTAATTTCacaatga < 6:389816/138‑7 (MQ=255) ttgggaaaGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGa > 7:418204/6‑138 (MQ=255) tgggaaaGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTTTTTTCA‑CAATGATTAATAGATc > 6:244142/5‑139 (MQ=255) tgggaaaGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGAt < 7:114192/134‑1 (MQ=255) aaaGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGc < 8:43816/139‑1 (MQ=255) aaaGGCAGAGGTCTGATGCACACTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGc < 7:282988/139‑1 (MQ=255) cagaggTCTGATGCACACTGCCATTCCACCCGTTATTCACTTTAATGTAATCGTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGc > 3:220989/6‑138 (MQ=255) cacaCTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCtgat < 7:117858/139‑1 (MQ=255) cacTGCCATTCAACCCTTTATTAACTTTAATGTAAACATTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTTCCGGCTCTGTTGCTTAATTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCtgatat > 6:83082/3‑139 (MQ=255) acTGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCtgatat > 2:32073/2‑138 (MQ=255) tGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCt > 4:54843/1‑88 (MQ=255) tGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCt < 3:54843/88‑1 (MQ=255) tGCCATTCAACCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCtgatatga > 4:284380/1‑138 (MQ=255) ccattcaaCCCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATAc > 4:425643/7‑139 (MQ=255) cccTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAAttctt < 1:410688/137‑1 (MQ=255) cccTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAAttct > 1:133057/3‑138 (MQ=255) cccTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAAttct > 6:96631/3‑138 (MQ=255) cccTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAAAGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAAttct > 1:403848/3‑138 (MQ=255) tttATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCAt > 8:306002/1‑139 (MQ=255) tttATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCAt > 4:195859/1‑139 (MQ=255) tttATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAAAAGAACAAAAACCGGCGGGGTTATTTGTTGCCGGCTATGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAAAATATCCAGCCTGCCATAAGATGGTGATATGATACTATttcgtggg > 1:391980/1‑134 (MQ=255) tATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTAAATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCATCATTc > 7:217595/1‑139 (MQ=255) tCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTa < 2:403848/139‑1 (MQ=255) aCTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTa > 8:187359/1‑137 (MQ=255) cTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCacaa > 4:12152/1‑75 (MQ=255) cTTTAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCacaa < 3:12152/78‑4 (MQ=255) tttAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTTCTTATTTTCA‑CAATGTTTAATAGATACAGCCTGCCCTAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTGATTCTTaaat > 1:214285/1‑137 (MQ=255) tttAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGc < 3:48673/94‑1 (MQ=255) tttAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGc > 4:48673/1‑94 (MQ=255) tttAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTT‑AACAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATTTGATACTAATTCTTCATTCTTAAAg > 6:48994/1‑138 (MQ=255) tAATGTAAACCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGa < 1:32073/137‑1 (MQ=255) aCCTTTACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTaa > 5:362690/1‑138 (MQ=255) aCCTTTACAAAACAAAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTaa > 6:413220/1‑138 (MQ=255) ttACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTTCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTATTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTcg > 7:158587/1‑139 (MQ=255) tACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTACTAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAAtctc < 6:348082/137‑1 (MQ=255) tACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAAtctc < 5:96631/137‑1 (MQ=255) tACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAAtctc < 6:363057/137‑1 (MQ=255) tACAAAACAGAACAAAAACCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTcgc > 5:372199/1‑139 (MQ=255) acagaacaaaaacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTg < 2:133057/135‑1 (MQ=255) cagaacaaaaacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGc > 8:332817/4‑139 (MQ=255) aacaaaaacAGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTTCCATAAGCTGCTGATAAGATACTAATTCTTCATTCTTTAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACt > 5:261444/1‑139 (MQ=255) aaacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGaa < 6:439043/110‑1 (MQ=255) aaacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGaa > 1:125442/1‑110 (MQ=255) aaacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGaa > 5:439043/1‑110 (MQ=255) aaacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGaa < 2:125442/110‑1 (MQ=255) aacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCgag < 6:362690/139‑1 (MQ=255) aacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCgag < 7:332817/139‑1 (MQ=255) aacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCgag < 3:425643/139‑1 (MQ=255) aacCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCgag < 5:413220/139‑1 (MQ=255) acCGGCGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCga > 5:150241/1‑137 (MQ=255) ggcGGCGTTATATGTTGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGaa > 3:307885/3‑139 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTgc < 7:341543/58‑2 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTgc > 8:341543/1‑57 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGa > 4:92764/1‑89 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGa < 3:92764/89‑1 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTa > 3:15290/1‑97 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTa < 4:15290/97‑1 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCgag > 5:162706/1‑120 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCga < 8:293523/119‑1 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCga > 7:293523/1‑119 (MQ=255) tGCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGggtg > 1:49015/1‑139 (MQ=255) tGCCGGATCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCgag < 6:162706/120‑1 (MQ=255) gCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCtgatat < 5:134793/63‑1 (MQ=255) gCCGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCtgatat > 6:134793/1‑63 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAAttctt < 6:51617/75‑1 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAAttctt > 5:51617/1‑75 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCa > 3:171429/1‑125 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCa < 4:171429/125‑1 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGgttgag > 1:270047/1‑138 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGggtgat > 7:379516/1‑139 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTCAACTTTCGATAGAATCAGAGCCGTGgatgtt > 7:142812/1‑137 (MQ=255) ccGGCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTATTTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGggtgat > 7:415192/1‑139 (MQ=255) gCTCTGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGGATGATGtt > 1:10936/1‑139 (MQ=255) tctGTTGCTTATTTTCA‑CAATGATTAATAGATCCAGCCTGCCATAAGCTGCTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGGATGATGtttt < 8:379516/139‑1 (MQ=255) | GCTTTGCAGCTGATTTTAGATCGTTAGAAAAGGCAGGAGTCTGGTACACCCTGCCAATAAACGCTTTATTCACTTTAATGTAAACCTTTACAAAAGAAAACGAAAACCGACGGCATTACTTGGTGCCGGCTCTGTTACTTATTTTCATTAACGATTAATAGATCCAGCCTGCCATGAGCTGTTGATATGATACTAATTCTTCATTCTTAAAGAAAATGTTAATCTCGCGTTCTGCACTTTCGAGAGAATCAGAGCCGTGGATGATGTTTT > CP006881/2199068‑2199337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |